; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy05g012820 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy05g012820
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationChr05:14860154..14863987
RNA-Seq ExpressionLcy05g012820
SyntenyLcy05g012820
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA+NA+GKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

XP_022136196.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Momordica charantia]7.8e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPK+FESNVRRAMAGGYVG TFFTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

XP_022931623.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita moschata]4.6e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA+NA+GKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

XP_023530137.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-10197.27Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA+NA+GKPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]1.3e-10197.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVG T+FTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.1e-10096.72Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVG T+FTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.1e-10096.72Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVG T+FTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like3.8e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPK+FESNVRRAMAGGYVG TFFTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.2e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA+NA+GKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.2e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA+NA+GKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.0e-6462.3Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E       K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC ISF +  DDL+NF++ I PDEG+Y  G F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G T+F RC+
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.8e-6462.3Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E       K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G T+F RC+
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.8e-6462.3Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E       K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        YHPNID+EGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G T+F RC+
Subjt:  YHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc126.7e-8883.7Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A+NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        VYHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVG TFF RC+
Subjt:  VYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.5e-8481.08Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE +++ NG+    VKKQ+AGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        KVYHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE NVRRAM GG VG T F RCM
Subjt:  KVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein1.1e-8581.08Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE +++ NG+    VKKQ+AGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        KVYHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE NVRRAM GG VG T F RCM
Subjt:  KVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      + S     +D+ +++ TI  P E  Y GG FL S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR

AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      + S     +D+ +++ TI  P E  Y GG FL S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR

AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 14.7e-8983.7Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A+NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        VYHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVG TFF RC+
Subjt:  VYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM

AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 14.7e-8983.7Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAENA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A+NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAENA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM
        VYHPNID+EGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVG TFF RC+
Subjt:  VYHPNIDVEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTTAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGACTTCAAAAAGA
TATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAG
GTGGTACCTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACGTGGAAGGAAAT
GTTTGCCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCTGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTCAA
CCATGACGCCGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCGAAGATGTTCGAATCCAATGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTACGTGGGGCATACTTTCTTCACACGTTGCATGT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCGAATTTGGCCCTGCAGAGCGTACGACGATAATTTGACAGTCAGAAACCCGAAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGTTCTGAATCAAACCCATCTCCCTCTTCCTTTC
TCTCTCACTTTCTACACGCTTTCTTTCACGGTTCTGCTTCGCCTTTATCCTTTCCGGAATTTGTTTCTACTCGGTTCAAATCCAGTACTCTGCAGGAAGGATGATTAAGC
TTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTTAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGACTTCAAAAAGATATCAGTGAA
TTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACCTT
TCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACGTGGAAGGAAATGTTTGCCTCA
ATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCTGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTCAACCATGACGCC
GCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCGAAGATGTTCGAATCCAATGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTACGTGGGGCATACTTTCTTCACACGTTGCATGTAGACACTACA
TGAATTGTAAAGCAGCACCAGATACATCATTTGAAGCATGGGCTCGGCGAGGTCTTCGAATTCTCTGGTCAGGTAATATGTTAAGAGGATTTTCCGATCATCAATGCGAC
GTGAAGTCCTTTGTGATGCAGGTGGAAGAACTTTGTTGTGTGTTTGCAGTATTGGTTTCAAATGGAAGTTGGACTCGAAACAGAAACTCTTGTCTGTGTATGTATTTCTT
CTAATTTATCTTGAAAAGACAGATTGCTCTTTTCCTATCAGTTGAAAGTATAAGGTATGTTTTTGGAGCCTCCCCTCTCTTTTCTTTATCAGAGTCTACTACTATGGATG
TAAATTTACTGAATTGAATCACAAAGATTTATTTCCTAATATATTTCAGGTTTGTAAAATCTCTTTTAGTTTCACATTTTGTCATCATCACAAGATTGTGAAAGTTTTTC
ATTTTTATCTTTATTTGGTCAGACCCTTTATCTCAATGGCCATTCTGATTGTGTTGCTGCAATGATTGTGTAATTGAAAAGCTGTTTGGGCTAAGTGACAGAAATCTCAG
GGAACAATTTATTTAAGTGGGAGGTAACATGGCCTTTCAAATCCTAGAAAGGGATAACAGATATTGTAATGGATGTATAATAATGAGCATTTGGGACATATATTTGTTTT
GCTTTGATTATTAATTTATTTTTAATTCATATCTTGTTTTTCAAATCTTGTATAATAATATGTGGGTTGTGGGGTGGGAGATTCGAATCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIKLFKVKEKQREIAENANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDVEGN
VCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM