; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy05g013320 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy05g013320
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionNADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
Genome locationChr05:15753324..15757335
RNA-Seq ExpressionLcy05g013320
SyntenyLcy05g013320
Gene Ontology termsGO:0006120 - mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone (biological process)
GO:0032981 - mitochondrial respiratory chain complex I assembly (biological process)
GO:0005747 - mitochondrial respiratory chain complex I (cellular component)
GO:0003954 - NADH dehydrogenase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR010226 - NADH-quinone oxidoreductase, chain I
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038887775.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial [Benincasa hispida]8.5e-11998.65Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C2E8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial4.1e-11998.65Show/hide
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A0A6J1F0I7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial2.1e-11897.3Show/hide
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A0A6J1GJX8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like6.6e-11796.85Show/hide
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A0A6J1I8H7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial2.1e-11897.3Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O21233 NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 86.9e-7985.71Show/hide
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O24143 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial2.3e-10384.35Show/hide
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P80269 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial1.4e-10887.34Show/hide
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Q42599 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial1.5e-10585.59Show/hide
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Q9FX83 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial1.0e-10686.49Show/hide
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AT1G16700.1 Alpha-helical ferredoxin7.2e-10886.49Show/hide
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AT1G79010.1 Alpha-helical ferredoxin1.0e-10685.59Show/hide
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ATCG01090.1 NADPH dehydrogenases2.5e-1535.54Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATCGCTGA
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TTAAATACTTTTTTGAGAAAAAAGTCACTATCAATTATCCATTCGAGAAAGGCCCACTAAGCCCTCGTTTTCGAGGTGAGCATGCCCTCCGACGATATGCAACTGGAGAA
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TCTATGACAAGGAAAAGTTGCTCGAGAACGGAGACCGATGGGAGACGGAGATTGCAGAGAACCTCAGATCTGAAAGCCTCTATCGCTGATACATTTGCCAATGGTGCCTT
GTGCTTTTGACTTTTCTTAGTGCGTTCATAATAAGATAAACCTGAGCATGCTGTTGAAATTATTTTGTATTCTTGGTATAAATGAGTTGAGAACATAATTCTTGCTGCTT
CTTACTACGGCCCAAGTTTGGGGTTTTTCAAAGTATCTTTTGTCTTTCTTCTCTTCCCAATAAAAATGGGAATGTTATGGTTTCTCATGAAAGAGTTGTATTGTAGGTTA
AATATGAACAGTATCAGCAATATCTCTTAAAGTTCTTCATGACTTCAGTTTCATAGAATGTGCACATCTAAATTTAGTCTTGTTTGATGATGGATAAATTAAGATGTACT
GCCAGGTTTAAGCTGAGTCCTTCACTCAGAGGCACTATAAGAAATTTGCATGCATCTGTTTAGTAATATTACATTTTTGTGGCATCCTTGGACAATTTATAGAAGCTTTT
ATTGTTTCATCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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