| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG0463048.1 hypothetical protein HPP92_021524 [Vanilla planifolia] | 3.9e-44 | 93.81 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
M+SGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVG+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNIS+VGELDEELD+NLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| XP_004137538.1 sm-like protein LSM8 [Cucumis sativus] | 1.0e-44 | 96.91 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MASGPGL+SLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| XP_011621662.1 sm-like protein LSM8 isoform X1 [Amborella trichopoda] | 2.3e-44 | 93.81 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
M+SGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVG+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNIS++GELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| XP_022155134.1 sm-like protein LSM8 [Momordica charantia] | 4.7e-45 | 97.94 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| XP_042494798.1 sm-like protein LSM8 [Macadamia integrifolia] | 1.4e-44 | 95.88 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
M+SGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVG+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LT86 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 5.0e-45 | 96.91 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MASGPGL+SLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| A0A1S3ATI1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 5.0e-45 | 96.91 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MASGPGL+SLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| A0A6J1DPC5 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.3e-45 | 97.94 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| A0A6J1GT46 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.3e-45 | 97.94 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| A0A6J1K221 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.3e-45 | 97.94 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O95777 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.9e-29 | 62.22 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL +
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
|
|
| Q3ZCE0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.9e-29 | 62.22 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL +
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
|
|
| Q5RCP3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.9e-29 | 62.22 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL +
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
|
|
| Q6ZWM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.9e-29 | 62.22 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL +
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPI
|
|
| Q8VYI0 Sm-like protein LSM8 | 3.2e-41 | 84.54 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G19120.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.2e-11 | 43.06 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
L + +D+ + V+ DGR ++G+L+ FDQ N +L+E++ERV + + LGLYIIRG+N+ ++GELD E
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
| AT1G65700.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 2.3e-42 | 84.54 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| AT1G65700.2 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 2.3e-42 | 84.54 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKP++
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| AT1G65700.3 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 4.2e-36 | 58.57 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQL
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STK EGVQQ
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQL
Query: VLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKP++
Subjt: VLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPIL
|
|
| AT3G14080.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 4.7e-11 | 43.06 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
L S +D+ + V+ DGR ++G L+ FDQ N +L+ + ERV E + LGLY+IRG+N+ ++GELD E
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
