; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy06g004230 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy06g004230
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like
Genome locationChr06:3852368..3856113
RNA-Seq ExpressionLcy06g004230
SyntenyLcy06g004230
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001857 - Ribosomal protein L19
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR038657 - Ribosomal protein L19 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573088.1 50S ribosomal protein L19, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-12588.06Show/hide
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XP_022955270.1 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita moschata]7.4e-12587.69Show/hide
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XP_038896029.1 uncharacterized protein LOC120084206 [Benincasa hispida]4.8e-12487.73Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV41 Uncharacterized protein2.2e-12285.87Show/hide
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A0A6J1CB38 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like2.1e-12589.59Show/hide
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A0A6J1GUP7 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X23.6e-12587.69Show/hide
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A0A6J1GVN3 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X18.8e-12487.36Show/hide
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A0A6J1K1Y5 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X22.0e-12387.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P82413 50S ribosomal protein L19, chloroplastic6.5e-3146.86Show/hide
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        S+  S F  P  + F +   AE ++   +  +A  +  E  P  S A   +  PR +  +L      IM IL+K+A+   +  R +P I+ G IVQ+++E
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Q2G8H1 50S ribosomal protein L194.3e-1950Show/hide
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        YYLR +
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Q2VZV5 50S ribosomal protein L196.7e-2049.06Show/hide
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Q8RXX5 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic6.5e-3160.19Show/hide
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        LRDK+  L
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Q8W463 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic5.0e-3160.19Show/hide
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        LRDK+  L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24240.1 Ribosomal protein L19 family protein2.4e-5776.16Show/hide
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AT4G11630.1 Ribosomal protein L19 family protein7.5e-5976.82Show/hide
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        FR+RRLVAGVGVES+FPLYSPN++EIKV+DKKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
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AT4G17560.1 Ribosomal protein L19 family protein3.5e-3260.19Show/hide
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        LRDK+  L
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AT5G11750.1 Ribosomal protein L19 family protein1.2e-5977.63Show/hide
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        +S R  +TT  S++S PQGSP  D  +  RIKFKRLDKT+KHIMQI+DKEA+EEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRRVS +KG+VIARRNAGLN+
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        TFR+RRLVAGVGVES+FPLYSPN++EIKV+DKKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
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AT5G47190.1 Ribosomal protein L19 family protein4.6e-3260.19Show/hide
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Query:  LRDKMNAL
        LRDK+  L
Subjt:  LRDKMNAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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