; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy06g010670 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy06g010670
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationChr06:11832468..11839437
RNA-Seq ExpressionLcy06g010670
SyntenyLcy06g010670
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.8e-14696.73Show/hide
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XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]1.2e-14698.18Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein3.5e-14495.99Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like1.1e-14596.72Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like1.1e-14596.72Show/hide
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A0A6J1GTT4 transmembrane protein 565.4e-14596Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like4.2e-14596.73Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B7.6e-1125.11Show/hide
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        L +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST++AI  S +S+Y +++++   +   +      +S +S FI      YF+ D  +  +    L     ++
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        HH+++ L+  +    G           +EITTP IN+R++L    +K    Y++NG++IF  +++ R+     T + V     HY  +    +I + + F
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Query:  GVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMK
          P +  ++NL W   I K + K
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A3.4e-1124.4Show/hide
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        D  + Y  V G  L  +L++  ++  +   Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G   +    ++     I+ GY
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         + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  RS    LLNG+ +   + + RI +    +  
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Query:  VYLHY--DQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        V+  +  +  I++ +   V       VL ++N+ W  KI +G  K +  +
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B1.3e-1328.37Show/hide
Query:  LTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFS
        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LII+ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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Query:  FGKIVKGLMKTISKR
          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 42.5e-1426.98Show/hide
Query:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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Query:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLLNGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNL
        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A ++NGI++   + + RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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Query:  MWFGKIVKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
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Q96MV1 TLC domain-containing protein 49.6e-1427.59Show/hide
Query:  FYFKSYLGLTKI----------QRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGME
        FYF SY    K+          +++EWN+R +ST H++ + I  LY   +     D+       +   +L+   + I+ GY ++DL +II  +  +G   
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Query:  YVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLLNGIVIFFAWLVARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYV
        +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RW+ +     K S A ++NGI++   + + RI  +L  Y F +     +  I++ V+  +
Subjt:  YVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLLNGIVIFFAWLVARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYV

Query:  LVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
               VL +MN+MW  KI KG +K IS  R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein9.9e-11573.8Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
Subjt:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ

Query:  GHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLL
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
Subjt:  GHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLL

Query:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GYVLVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein9.9e-11573.8Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  GHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLL
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GYVLVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-6550.42Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY LNGI +F  WLVAR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK +
Subjt:  KMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.9e-10671.27Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQ     
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.9e-10671.27Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQ     
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTGATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTGGTAAAGAACTACTTATTAGCAGACCGTTTTGTCCCATACACC
TCTGTCCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGA
GTCGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGGGTCAT
GCTGGCCTTGTTACCTTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCGGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCT
TCTTTAGGTGGGATGGAGTATGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTC
ATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATCTGCTTAATGGCATTGTAATATTTTTT
GCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGCTGTTTGGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATGTTTTGGTA
TTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACCTGATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCGAAGAGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGATTGGTGGAACACAACTAAGAGTGCAGTATAATTTAATATTTCCTCAATCCTACACCGACTGAATTTTACATAAAAATTCACAAAGCATATTGATTATTGAAG
TAATAAATGAAGGGCGCTAAAAAAAAAGGAAAAAATCATCGGCCAAGGCGCGAAGTTATCATATTCCTTCGGTTACTACTGGCAGGGATTGGATAGAATGCAATT
CAATCCACAAGAACACGACGATCCCATCTCTGGATACTCAAATCCATTGCTGATTAGCAAAACCCACATTTTGTTTTTTGTAATTTTCTCTTCATCTTGTCGTGA
TTACCCCTTTTAGATTGTTGCGGTTGGAGATTCCTAACGCTTCACATTGATTCAACCTCACGGTTCTTTTATACCGGTCGGTTGTTGCATTTCCTTTACAGATTA
TCTTATTTTGTTTGTTCCCGTTTTGTTATCTTTGATAAAGGAAAAACCCCTTCTGCATCTCCTCGTGATCTGGGGTTTTCATTTATGAGGGATAACAACATGGAG
CGAGGGAGCAAATAGTTAATTCAGTCTAAGGTACAGAGATCTGCTGAATGTTATGTAGCCAAACAAAACAATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTGATGGCTATTAA
ATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTGGTAAAGAACTACTTATTAGCAGACCGTTTTGTCCCATACACCTCTGTCCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGT
CTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTCA
TGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGGGTCATGCTGGCCTTGTTACCTTTCAAAGTTCAACATTGTC
TACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCGGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGTGGGATGGAGTATGTTGTCCACCACTC
TCTTTCCGGACTAGCAGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGATTAATATGAG
ATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATCTGCTTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGCTGTTTGGTTA
CACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATGTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACCT
GATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCGAAGAGGCGATGAGAAACATATTCTTCTGGTTCATCTCTTCCTCTTCACTCTCTTGGTCT
GTTTCTTAACATCTACAGATGGGTTGAGGAGAAAAAGGAATTTGATGGTATGTAATGTGTTGTAAATGGTTCAAAATAACTTAAAACTTGTTGACATTTAGTGTC
TTCTTCCTCTTGTCAAATTTGTGTACCAATTCATTTTTTCTGTATAGTTCCTTTCTTTTTTCTTCCTTTTTTCAAGAATGTATGGAAGAAATGTGATGATACTAC
AGCAAATTTTTTTGTATTCAGTTATATTTACAATTTCGATTCTCTTCTTTGTTGTCCCTTCATGATGTCTGGCATTGTTTTACCTTTCTCCAACATTTTCTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQGH
AGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIVIFF
AWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR