; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy06g013480 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy06g013480
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationChr06:20241942..20247358
RNA-Seq ExpressionLcy06g013480
SyntenyLcy06g013480
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64943.1 hypothetical protein Csa_022813 [Cucumis sativus]1.6e-10990.3Show/hide
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XP_022945942.1 uncharacterized protein LOC111450033 [Cucurbita moschata]1.7e-10687.92Show/hide
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XP_022967102.1 uncharacterized protein LOC111466606 [Cucurbita maxima]4.9e-10687.87Show/hide
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XP_038894579.1 uncharacterized protein LOC120083099 [Benincasa hispida]1.3e-11191.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein7.9e-11090.3Show/hide
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A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998849.6e-10889.45Show/hide
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A0A5A7SY45 Senescence regulator9.6e-10889.45Show/hide
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A0A6J1G2B0 uncharacterized protein LOC1114500338.1e-10787.92Show/hide
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A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666062.4e-10687.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11700.1 Protein of unknown function, DUF5841.3e-1148.81Show/hide
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        SAPVNVP  SK     +V+  HE D ++ +E  G M+PPHE +A+S  +    S    SV EG GRTLKGR+LR+VR+A+W +T
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AT1G61930.1 Protein of unknown function, DUF5841.5e-1245.88Show/hide
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        SAPVNVP  SK     +V+  HE+D +D ++ +  M+PPHE +A+S A+          SV +G GRTLKGR+LR+VR+A+W +T
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AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5841.8e-3751.28Show/hide
Query:  ANPSSTNGLDD--DTELNEDDVFWTGDFAADTPHHTHSTPSS-SSSSTPRHHIHLLQHNKGFPQPETFGILAALPENEASSSLRSSSHFYHK--------
        ++PSS   + D  D ELNEDD+F   D +   P   HS  SS +   TP     L +   G    E  GILAALPE+  SSS  S   F+HK        
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Query:  --ASVSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPIS--TSLKY-QSAPVNVPIMSKAVQRHH-------EIDVDDVDEGDGEMLPPHEIVARSL
          ++ SSSSSS       S SS+R IPT PKPP ERLP   S     KY QSAPV VP++S A+   H       ++  DD +E +GEMLPPHEIVARSL
Subjt:  --ASVSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPIS--TSLKY-QSAPVNVPIMSKAVQRHH-------EIDVDDVDEGDGEMLPPHEIVARSL

Query:  AQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        AQS +LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAV+RRT
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5845.2e-1340.67Show/hide
Query:  ILAALPENEASSSLRS--SSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISTSLKYQSAPVNVPIMSK----------AVQRHHEIDVDDVDE
        + + L E E SS       SHF    S SSSSSSSP + R    +             + +K  SAP+NVP  SK          +   H     DD ++
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Query:  GDGEMLPPHEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
         DG M+PPHE VAR LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL +VRNAV  +T
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5843.4e-1240.97Show/hide
Query:  ENEASSSLRSSSHFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISTSLKYQSAPVNVPIMSKAV--------QRHHEIDVDDVDEGDGEML
        E E  S LR S     +  +S S    S+SS SS+R IP   +         +S   K  SAP+N+P  SK             H   +DD DE  G M+
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Query:  PPHEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        PPHE+VA+ LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL + RNAV  RT
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTCAACCTTCCTTCCTCCCGTCTCCGCCACCGTAAATCCCCCTCCTCCGAACGCTTCCTCGCCTCCTTCGCTTCTCCGCCCGCTCGCCCTGCAAACCCT
AGCTCCACCAACGGCCTCGACGACGACACCGAGCTCAACGAGGACGACGTCTTCTGGACTGGCGATTTCGCTGCCGATACCCCCCACCATACCCACTCCACTCCC
TCTTCCTCCTCCTCCTCCACTCCTCGTCACCATATTCATCTCCTCCAGCACAACAAGGGTTTCCCCCAGCCGGAGACCTTCGGAATCCTCGCTGCGCTCCCCGAG
AACGAGGCCTCCTCCAGCCTGAGGAGCTCTTCTCATTTCTACCACAAGGCCTCCGTTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCCCTTCCTCCTCTCGGATGATTCCCACC
ATCCCTAAACCTCCCTTGGAGCGATTGCCCTTGCCCATTTCTACCTCGTTGAAGTACCAGTCCGCTCCGGTAAATGTGCCCATAATGTCCAAGGCGGTTCAGAGA
CACCACGAGATCGATGTGGATGATGTTGATGAAGGAGATGGGGAGATGTTGCCGCCGCATGAGATTGTCGCCAGAAGTTTGGCTCAGTCGCCGATGTTGTCTTGC
TCGGTGCTCGAGGGCGCTGGAAGAACGTTAAAGGGCAGGGATCTTCGCCAGGTTCGCAACGCGGTTTGGAGACGAACAGTCAGAAGGTCGTTCTTTTCTATTCTC
TTCCATTACAATAGTTCCATCGGAGTTTTGGGATTCTACACAAGTTATTGGGCACAAGCCTTACAATGCCATAGCTTGACTTTCTTCATAAAGGGAGGCCAAGTC
ACCTCTATGATTTCTGTACAATCATGTGCTCCGATGTCTGCTTCCTCTTGTCCTGTTCTTGAACAACTTTCATTCTCCATCAGGCAGTTGAGAATTTCAGCAGTA
ATCTCCCTCCTGTCGGTTGGGCATTGGCCAAATCTCAGCTGCCTGATTTTCACCATTAATGCTCTATGCTTGCCAGGTCTTAAAGAGAAACAAGGCTGGGGTCAT
ACTTTTCCAAATTTGTCATGGGAGAAAATTGGCTTGGGCTGTGGTTTCAGACAGATTTCCATTGGTGTTGTTTATTTACCTTTGGAATCACAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCTCAACCTTCCTTCCTCCCGTCTCCGCCACCGTAAATCCCCCTCCTCCGAACGCTTCCTCGCCTCCTTCGCTTCTCCGCCCGCTCGCCCTGCAAACCCT
AGCTCCACCAACGGCCTCGACGACGACACCGAGCTCAACGAGGACGACGTCTTCTGGACTGGCGATTTCGCTGCCGATACCCCCCACCATACCCACTCCACTCCC
TCTTCCTCCTCCTCCTCCACTCCTCGTCACCATATTCATCTCCTCCAGCACAACAAGGGTTTCCCCCAGCCGGAGACCTTCGGAATCCTCGCTGCGCTCCCCGAG
AACGAGGCCTCCTCCAGCCTGAGGAGCTCTTCTCATTTCTACCACAAGGCCTCCGTTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCCCTTCCTCCTCTCGGATGATTCCCACC
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CACCACGAGATCGATGTGGATGATGTTGATGAAGGAGATGGGGAGATGTTGCCGCCGCATGAGATTGTCGCCAGAAGTTTGGCTCAGTCGCCGATGTTGTCTTGC
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ATCTCCCTCCTGTCGGTTGGGCATTGGCCAAATCTCAGCTGCCTGATTTTCACCATTAATGCTCTATGCTTGCCAGGTCTTAAAGAGAAACAAGGCTGGGGTCAT
ACTTTTCCAAATTTGTCATGGGAGAAAATTGGCTTGGGCTGTGGTTTCAGACAGATTTCCATTGGTGTTGTTTATTTACCTTTGGAATCACAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRTVRRSFFSILFHYNSSIGVLGFYTSYWAQALQCHSLTFFIKGGQVTSMISVQSCAPMSASSCPVLEQLSFSIRQLRISAV
ISLLSVGHWPNLSCLIFTINALCLPGLKEKQGWGHTFPNLSWEKIGLGCGFRQISIGVVYLPLESQ