; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy07g001030 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy07g001030
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionU2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor-like protein
Genome locationChr07:2800524..2808076
RNA-Seq ExpressionLcy07g001030
SyntenyLcy07g001030
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605331.1 hypothetical protein SDJN03_02648, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-13884.35Show/hide
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XP_023007213.1 uncharacterized protein LOC111499771 isoform X1 [Cucurbita maxima]1.2e-13783.12Show/hide
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XP_023534565.1 uncharacterized protein LOC111796104 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-13784.03Show/hide
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XP_038902923.1 uncharacterized protein LOC120089505 isoform X1 [Benincasa hispida]2.1e-13782.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TGG1 Uncharacterized protein3.6e-13582.8Show/hide
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A0A6J1G7H1 uncharacterized protein LOC111451522 isoform X14.1e-13984.08Show/hide
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A0A6J1G7U7 uncharacterized protein LOC111451522 isoform X21.0e-13784.08Show/hide
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A0A6J1L4C1 uncharacterized protein LOC111499771 isoform X21.4e-13683.12Show/hide
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A0A6J1L735 uncharacterized protein LOC111499771 isoform X15.9e-13883.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64010.1 unknown protein3.9e-4142.13Show/hide
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        + F PIFGE   E  + GS  L   LFHV+  +  NL   VTDF S  W +  S  QLDDMRD +GIGG+ SEFV Y + SLKS +V+L L   S  +G 
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          A+L++QK+KGMP  ++PLTK+++S+ASEAMA LSL LF + K K+       +  +  +   + +K+K ++  +QL +Y++K  +   + +N  D   
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Query:  GHNIGSTKVTNRV--VPAHRRAKTRGALLQDSEDD
          +       N V  VPAHRR + RGALLQDSE++
Subjt:  GHNIGSTKVTNRV--VPAHRRAKTRGALLQDSEDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTTCAAGATTTTGCACCCATTTTTGGGGAACCCAAAGTGGAGTGGTTAAACAGGGGTTCGCTTCCTTTGAACCCATTTTTGTTCCATGTTCATACTCCAAATCC
TTCGAACCTCAGATTTTCTGTTACTGATTTCCACTCCAACACTTGGGAATCCACCAAATCGGCCTTGCAGCTCGACGACATGAGAGATGACATTGGAATTGGAGGGGCTA
TGTCAGAGTTTGTTAAATATATCATTACTTCACTGAAATCCGGAGATGTAAGGCTTAGTTTGGAAGGACAATCGGGGAAAGATGGTGCAGCATGTGCTAAATTAATTGCT
CAGAAATCAAAAGGAATGCCTGTTTTTTCCATTCCTCTCACAAAACTCATGGATTCTGCTGCTTCTGAAGCTATGGCAACTCTCTCCTTGGGACTTTTTAACTCATTAAA
AGACAAGGAATGTTCACTTATAAAAGAACAAGAGCACTCCCTTCAGTTGACAACCATGATATCAACTAAAAAGGAAAAATACGAAAGTATTCAGAGCCAGCTCGGGCAAT
ATACAAAGAAGCAGAAGTTACCAAATATGAATGCCTCAAATTCTCCAGACAAATCTGTTGGTCATAATATTGGCTCGACAAAAGTCACGAATCGTGTAGTGCCAGCACAT
CGCAGGGCAAAAACAAGGGGTGCCCTTCTGCAAGACTCTGAAGATGACACTGAACAAGAGCGCTCCCTTCAATCGACATCGGAGGAAAAGGAAAAGAAACAGGAGTTACT
AAATACAAATGCCTCAGCCATTGTAGATGGGTTTGAAAAGTCTCCTGTGGACAAACCTGTTGTTCATGATATTGGCTCGACAAAAATCACCAATCGTGTCGTGCCAGCAC
ATCGCAGGGGAAGAACAAGAGGTGCCCTTCTGCAGGATAATGAAGATGAAAATGGCAGGTCATATGAATGTAGTACCATGTTCGTATGGTATGATATAGGCATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTAAATCAAAATTTATTTGACCCTGGAAGCCTAATAGTCAATTGTATTTGTATCCCCCATTGCAGAAGCAGAACAAAGCTCATTCGGTGGAACAAAGACGAAGACGTTCC
TTGAGGGTTGAAAATGGAGCTTCAAGATTTTGCACCCATTTTTGGGGAACCCAAAGTGGAGTGGTTAAACAGGGGTTCGCTTCCTTTGAACCCATTTTTGTTCCATGTTC
ATACTCCAAATCCTTCGAACCTCAGATTTTCTGTTACTGATTTCCACTCCAACACTTGGGAATCCACCAAATCGGCCTTGCAGCTCGACGACATGAGAGATGACATTGGA
ATTGGAGGGGCTATGTCAGAGTTTGTTAAATATATCATTACTTCACTGAAATCCGGAGATGTAAGGCTTAGTTTGGAAGGACAATCGGGGAAAGATGGTGCAGCATGTGC
TAAATTAATTGCTCAGAAATCAAAAGGAATGCCTGTTTTTTCCATTCCTCTCACAAAACTCATGGATTCTGCTGCTTCTGAAGCTATGGCAACTCTCTCCTTGGGACTTT
TTAACTCATTAAAAGACAAGGAATGTTCACTTATAAAAGAACAAGAGCACTCCCTTCAGTTGACAACCATGATATCAACTAAAAAGGAAAAATACGAAAGTATTCAGAGC
CAGCTCGGGCAATATACAAAGAAGCAGAAGTTACCAAATATGAATGCCTCAAATTCTCCAGACAAATCTGTTGGTCATAATATTGGCTCGACAAAAGTCACGAATCGTGT
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AGGCATTTGATGCTCCCATCCAAACCGTCTCATCACACGTTCTGGAAAATGTCACTTTACTGCAAAAAAAAAAAAAAACATATGAGTGAACTTCCAATTGTCCATACATC
TTGACCCGTGAGACAATAGTCCGACAATGAATGGAGCAGATAATCTACACGATTGTTTGAACATAAGGTTTATGAAATCAAATAAAAATATTGAAAATAAAGATGATGTA
TAAATAAACTTAGTTATACCTATTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RRAKTRGALLQDSEDDTEQERSLQSTSEEKEKKQELLNTNASAIVDGFEKSPVDKPVVHDIGSTKITNRVVPAHRRGRTRGALLQDNEDENGRSYECSTMFVWYDIGI