; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy08g018240 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy08g018240
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Descriptionprotein SPEAR1
Genome locationChr08:48948937..48952071
RNA-Seq ExpressionLcy08g018240
SyntenyLcy08g018240
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR040356 - SPEAR family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023537409.1 protein SPEAR1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.4e-7376.88Show/hide
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XP_038889470.1 protein SPEAR1-like [Benincasa hispida]1.1e-8887.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFV0 SPOROCYTELESS-like EAR-containing protein 18.6e-8486.27Show/hide
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A0A1S3C7M3 protein SPEAR19.2e-8688.18Show/hide
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A0A6J1FCT6 protein SPEAR1-like3.8e-7175.38Show/hide
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A0A6J1HQB1 protein SPEAR1-like5.2e-7376.38Show/hide
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                 GMGEYERGSFRYGDSQPTTTSIRW+ SNT +ETQHFG+PNMTGHL NP V DSMHKNMNTKYGSDSIGSSSQNSESSET ELDLELRLSI
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A0A6J1KB48 protein SPEAR3-like isoform X13.4e-7278.61Show/hide
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        SPSYGFHQNFMGMGE+ERGS R GDSQP TTS+RWDPS+TFLET HFGQPNMTGHLFN HVQDS+  N+N KYGSDS+  S QNSESS   ELDLELRLS
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        I
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6IDB0 Protein SPEAR32.2e-2843.75Show/hide
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          SS     YGFH N M      +YER + RYGDSQP      W+PS   LE+QHF +PN T H         +H++      + S+GS  QN E+SE  
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        ELDLELRL
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Q84X40 Protein SPEAR11.2e-2643Show/hide
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        MGS +FG  N +G++    S + ++++   R  K  G EKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEM C ++    P+L   +D+RMQ       YS+  S SS+
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        P YGF+ N M MG +          Q    ++ W+PS   LE+QH  +PN+T H  N     +  +       S S+GS  Q+S SSE QE+DLELRLS+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20080.1 unknown protein8.7e-2843Show/hide
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        P YGF+ N M MG +          Q    ++ W+PS   LE+QH  +PN+T H  N     +  +       S S+GS  Q+S SSE QE+DLELRLS+
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AT2G20080.2 unknown protein2.3e-2036.5Show/hide
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        MGS +FG  N +G++    S + ++++   R  K  G EKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEM C ++    P+L                          
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        P  G H++     +Y+R             ++ W+PS   LE+QH  +PN+T H  N     +  +       S S+GS  Q+S SSE QE+DLELRLS+
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AT4G28840.1 unknown protein1.6e-2943.75Show/hide
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        MGS +FG   MG +    S + ++++  +RG+   G +KPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGE  C ++ + YP+   S   +D+R+Q       +SS S+S 
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          SS     YGFH N M      +YER + RYGDSQP      W+PS   LE+QHF +PN T H         +H++      + S+GS  QN E+SE  
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        ELDLELRL
Subjt:  ELDLELRL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAGATGAATATGGGGAATACTGATAAGAGGAGGAGTGGGTCGCCGGCGGCGGCGGCGACAGGGCGGAGAGGGAGGAAGGGCGGCGGCGG
AGAGAAACCGAAACAGCCGCAGAGAGGGTTGGGAGTTGCTCAGTTGGAGAAGATCAGATTGCATGGCGAAATGGGCTGTGCTGCTTATGGCCACTTGTATCCAAATCTCT
CCGCCAGCGATGATATGAGAATGCAAACAGCAGCTTCTTCTTTTTCTTACTCCACAACTCAATCTTCTTCTTCATCTCCTTCCTATGGCTTCCATCAAAACTTTATGGGA
ATGGGAGAATATGAAAGAGGAAGCTTCAGATATGGGGATTCTCAGCCAACAACAACTTCTATAAGATGGGACCCAAGTAATACATTCCTGGAGACCCAACATTTTGGGCA
ACCAAACATGACTGGACACCTTTTCAATCCTCATGTACAGGATTCAATGCACAAGAACATGAATACAAAATATGGGAGTGATTCAATTGGTTCAAGCAGTCAGAATTCTG
AATCAAGTGAGACTCAAGAGCTAGATTTGGAGCTGAGATTGTCAATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGACTGTGAAAAAGAGCTTAAAAAGAGGGCTTTAGAGATCTCTGGTTTCTCAGATTGCCGGCCAGCAAAACAAAGCCATCCCACTTTCTCTCTCTAGTTTTTTTAATTT
TTGTTTCTCTCTCTAAGATTTTTTTTTTTGGAGATAATATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAGATGAATATGGGGAATACTGATAAGAGGAGGAGTGGGTCGCCGGCGGCG
GCGGCGACAGGGCGGAGAGGGAGGAAGGGCGGCGGCGGAGAGAAACCGAAACAGCCGCAGAGAGGGTTGGGAGTTGCTCAGTTGGAGAAGATCAGATTGCATGGCGAAAT
GGGCTGTGCTGCTTATGGCCACTTGTATCCAAATCTCTCCGCCAGCGATGATATGAGAATGCAAACAGCAGCTTCTTCTTTTTCTTACTCCACAACTCAATCTTCTTCTT
CATCTCCTTCCTATGGCTTCCATCAAAACTTTATGGGAATGGGAGAATATGAAAGAGGAAGCTTCAGATATGGGGATTCTCAGCCAACAACAACTTCTATAAGATGGGAC
CCAAGTAATACATTCCTGGAGACCCAACATTTTGGGCAACCAAACATGACTGGACACCTTTTCAATCCTCATGTACAGGATTCAATGCACAAGAACATGAATACAAAATA
TGGGAGTGATTCAATTGGTTCAAGCAGTCAGAATTCTGAATCAAGTGAGACTCAAGAGCTAGATTTGGAGCTGAGATTGTCAATCTAAGAAAGGCTGGGTTTCAATCAAT
CAATTTCCCAACATTATATAAATAATTATAAACTGCATTAATCCTGTAATTTTACCTATTTTATGAACCAGGCCCTCAAGTTTTAAGAATTGTTTCAAATAGCTCTTTTA
GTTTGTACATTTGCAAACCATACCCTTTATTGTCAAGTTTAAGTTCAGCAGAATAATTGATACATTTTGATAAAAGGGTATGGTTTTTTTGAGATGTTTGAGACTATTAT
AAACAGAGAATTCAAGGGTGTGATTTGTAAAATGGGCAAATCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSGYFGEMNMGNTDKRRSGSPAAAATGRRGRKGGGGEKPKQPQRGLGVAQLEKIRLHGEMGCAAYGHLYPNLSASDDMRMQTAASSFSYSTTQSSSSSPSYGFHQNFMG
MGEYERGSFRYGDSQPTTTSIRWDPSNTFLETQHFGQPNMTGHLFNPHVQDSMHKNMNTKYGSDSIGSSSQNSESSETQELDLELRLSI