CuGenDBv2

Gene ID	Lcy09g017790
Organism	Luffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description	Cytochrome f
Genome location	Chr09:37683392..37684457
RNA-Seq Expression	Lcy09g017790
Synteny	Lcy09g017790
Gene Ontology terms	GO:0015979 - photosynthesis (biological process) GO:0022900 - electron transport chain (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0031361 - integral component of thylakoid membrane (cellular component) GO:0005506 - iron ion binding (molecular function) GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR002325 - Cytochrome f IPR011054 - Rudiment single hybrid motif IPR024058 - Cytochrome f transmembrane anchor IPR036826 - Cytochrome f large domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

AKZ22372.1 cytochrome f [Heliopsis helianthoides var. occidentalis]

5.3e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

YP_005089436.1 petA gene product [Silene noctiflora]

5.3e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

YP_009456159.1 cytochrome f [Lagenaria siceraria]

5.3e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

YP_009572452.1 cytochrome f [Nyctaginia capitata]

5.3e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

YP_009762123.1 cytochrome f [Bidens pachyloma]

5.3e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A218KG41 Cytochrome f

2.6e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

A0A346SAT8 Cytochrome f

2.6e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

A0A7H0R0X6 Cytochrome f

2.6e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

D0QM39 Cytochrome f

2.6e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

K9L5N0 Cytochrome f

2.6e-31

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A6MM49 Cytochrome f

7.0e-34

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

A8SEB6 Cytochrome f

1.2e-33

96.05

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIK+DQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

P16013 Cytochrome f

1.2e-33

94.74

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAE+VLQDPLR+QGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

P49161 Cytochrome f

9.1e-34

96.05

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFAS+ILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

Q2QD76 Cytochrome f

7.0e-34

97.37

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00540.1 photosynthetic electron transfer A

1.3e-32

92.11

Show/hide

Query:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF
        G ELLVSEGESIKLDQPLTSNPNV GFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFF  SV+LAQIFLVLKKKQFEKVQLSE+NF
Subjt:  GPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCGAGCGATTCAGAATGAGAAACTGTCATCCCATTCAATCGAATTGGGATGCCCCGGATCTGACATGTGGCTTGCTTGGACCAGAACTTCTTGTTTCAGAGGGCGA
ATCTATCAAACTTGATCAACCGTTAACGAGTAATCCTAATGTGGAAGGGTTTGGTCAGGGAGATGCGGAAATAGTCCTTCAAGATCCATTACGTGTCCAAGGCCTTTTGT
TCTTTTTTGCATCTGTTATTTTGGCACAAATCTTTTTAGTTCTTAAAAAGAAACAGTTTGAGAAGGTTCAATTGTCCGAATTGAATTTCTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAERFRMRNCHPIQSNWDAPDLTCGLLGPELLVSEGESIKLDQPLTSNPNVEGFGQGDAEIVLQDPLRVQGLLFFFASVILAQIFLVLKKKQFEKVQLSELNF

Lcy09g017790 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome