CuGenDBv2

Gene ID	Lcy12g005200
Organism	Luffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description	calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X1
Genome location	Chr12:20011712..20014486
RNA-Seq Expression	Lcy12g005200
Synteny	Lcy12g005200
Gene Ontology terms	GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6570403.1 hypothetical protein SDJN03_29318, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7010276.1 hypothetical protein SDJN02_27069, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022944586.1 calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_022944587.1 calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X2 [Cucurbita moschata]

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XP_022987000.1 calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X2 [Cucurbita maxima]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A5A7TDB6 Centrosomal protein of 83 kDa isoform X1

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A0A6J1FUT8 calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X1

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A0A6J1FW14 calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X2

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A0A6J1JFL2 calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X2

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A0A6J1JI67 calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X1

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT1G51405.1 myosin-related

3.6e-07

34.48

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        TF     +V++ D GG + + E         D  ++ V             E KWRFQ EM+R+EC+LLR+E+EI  KK+E+ K ++
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Sequences

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CDS sequence

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ATGACGTTTTTTAATGATGGTTTTCTAGTTGTTTTGATGGATCGTGGTGGTGGGAGGAGTGAGAGAGAGAACGACAACAACGATGTAGCGGTGGAGCAGAAGTGGAGGTT
TCAGGTGGAGATGATGAGGGCGGAGTGTGACTTATTGAGAATGGAAAGAGAGATTACCAACAAGAAATTGGAGAAGATGAAGGCCCAACTGGCAGTACCCGCAACCGGCA
CTGCCGACTCCGAGGATCCTCCACTTTCTGAGGAGGTCGAGGACGCAGAGGCGTCTGTCCAAGAGTCTACCTGCGAAATCCAGTTCCAGGTTCGATGGGAGAGGGAAGCT
TGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MTFFNDGFLVVLMDRGGGRSERENDNNDVAVEQKWRFQVEMMRAECDLLRMEREITNKKLEKMKAQLAVPATGTADSEDPPLSEEVEDAEASVQESTCEIQFQVRWEREA

Lcy12g005200 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome