; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy12g016830 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy12g016830
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Descriptiontranscription factor HY5
Genome locationChr12:44586125..44590673
RNA-Seq ExpressionLcy12g016830
SyntenyLcy12g016830
Gene Ontology termsGO:0010017 - red or far-red light signaling pathway (biological process)
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GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CN91 transcription factor HY5-like isoform X12.3e-4983.65Show/hide
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A0A6J1FK24 transcription factor HY5-like isoform X18.4e-5284.97Show/hide
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A0A6J1FQI7 transcription factor HY5-like isoform X23.9e-4983.66Show/hide
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A0A6J1IVY4 transcription factor HY5-like isoform X25.6e-4882.35Show/hide
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A0A6J1IYV9 transcription factor HY5-like isoform X11.2e-5083.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2VD01 Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 26.3e-0439.34Show/hide
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O24646 Transcription factor HY59.6e-2960.67Show/hide
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Q54RZ9 Probable basic-leucine zipper transcription factor G8.2e-0445.76Show/hide
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Q8W191 Transcription factor HY5-like1.0e-1448.89Show/hide
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Q9SM50 Transcription factor HY51.6e-3164.24Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17609.1 HY5-homolog1.6e-1557.89Show/hide
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AT3G17609.2 HY5-homolog7.3e-1648.89Show/hide
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AT3G17609.3 HY5-homolog1.6e-1557.89Show/hide
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AT3G17609.4 HY5-homolog1.6e-1557.89Show/hide
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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein6.8e-3060.67Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTGCATCGGATGGCGTGAGGAGCAGAGGACGAAGCGCCGCTGACAAAGAAAGCAAAAGGCTGAAGAGATTGTTAAGAAACAGAGTTTCAGCACAGCAAGCAAGGGAGAGG
AAAAAGGCGTATTTAAGCGACTTGGAAATTAGAGCAACAAACTTGGAGAGAAGGAACTCCGAGCTTGAAGAGAAGCTGTCCACGTTACAGAATGAGAATCAGATGCTTAG
ACACGTACGTCAACCAACCCTCGTCGGTACCAGTTTCTCTTTTACGCACCACATGATCATTACGTTTTCTTTCCTTCACAATTATATAATTTTCCTTTCCATCATCTCTA
GCTTCATGTTTACTCATTTCCTTTCTTAG
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TTGCCGCCGGTCGTCTGCGCTCGAGCAGCGAAAGATCGTCGAGCTCCGCTTTTCAACTTGATGTTAAAGAAGATATAGGAGTGGAGAGTGACGAGGAGGAGATAAGCAGA
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AGAGAAGGAACTCCGAGCTTGAAGAGAAGCTGTCCACGTTACAGAATGAGAATCAGATGCTTAGACACGTACGTCAACCAACCCTCGTCGGTACCAGTTTCTCTTTTACG
CACCACATGATCATTACGTTTTCTTTCCTTCACAATTATATAATTTTCCTTTCCATCATCTCTAGCTTCATGTTTACTCATTTCCTTTCTTAGGAATTAAATTATAAGTG
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ACACTTCAAAAAAAAAAATGTATATATAACAAAATTCTATTGAATATAGAATAATAAATTTGAATACTTATCAAAGTTCTATAAGATATAAAAGTTTAAACTCTATAAGA
CATTACACTCTTGTGGATCTAGACAATTATGTGTCACAAAAATTATCAGTTATAAACTCTATGTTAATAATTTTTTTATAATATATGAGAAGAGCATCTATAACTAAGTG
TCATATTATCGTATCATTATAAGCCAATAATATTGGACGTAGACATTTATTAGAGAAATTATTGGAGCGGTTCGCCTTTTTTTCCCTCCCTTTTCTTTATCTTTTTTAAT
TTGAGTCCATTCGGTTGGCGGCCTACCCGTAAAAACTACTGCCTTTCTCTCCCATTTATGAAACCTTTATTTTGAGGTGGACCACCAATATGGATAATTGGGAGAGATGA
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CATGGTAAAATAATGTAATTTAAATTTTAACAGTAAAATAGCGATCACACGCTTTGCCAAGAGCATAGGTCAATGATAATTGACATATATCATCGAGAAGTTTGAATCCT
CTTCTCCTAAATATTCTTAGAATTCAAAAGAAAAGGAAAAAACACTCTGATTCTAGTAACTAGGTTAATCACTTTATTTAGAATTATAAACTTACGGTGGAAGTATCATC
TACTTCCACAATTGCTAAAACTCTATGACTTTAGGATTGAGTTTTAAATTCTTAATATTCTATTGGAAACGTAAACTCGCAAAAAGAAGAAAATTGTTGGGAGAAGATCA
GAAAACAAGCCCCAAAATAGTTCCATAATAACTGTACCTTTTCCTTCCCAATTAAGTTCCATGGAGAGCTGTTGACGCATTTTCAGATGGGACGGATAGCACTAAGCAGT
GTGAGAGGAGGCGTCCATCGTCATCTAAACCCAAAATAGAATGTGCTAGTGGTCTAATTATTGATTAATTTATTTGGTAGGTTTATGTAGGGGCCATGCCCCAACCAAGA
ATTGTCAATTGCTTGCGATTTCTTCCATTAGATTTTATTTTATTTTTTTAATTTATTTATTATTATTATTATTTTTTTTTTTGAAGATGTTGCTTCCATTAGAATTATGA
GGGAATAACTATAGAGAGAGAGAAGAGAATAAAGTTTATTTTATTTTTCTTTTTTCTTTTTGAACTTTCCTAAATTTCTTTTTAGTGAATAAAGATGGGTGTGGATATTA
ACCTATGCTGGAATTGCTTGATAACAGAGTTTTTTTAGTTAGGTAGAGAGCAGGGTTATTTATCTCTGGTCTTTGTCAACATAAATTTATTTTAAAATGTTACATTAAAG
TTTTGGTCAAATTACAAGTTTAGCTCTTGAACTTTGTGGATTGTGTTTATTTATTTATTTATTTTTTCATTTTTTTTTTAGTACATCAACATTTGGGGGGAATTCAAACC
TCTGATCTTTTGGTCGAGGGTACATGTTAATCACCGCCAAGCTATGCTCACTTTGGCATGGATTGTGTTTACTTGGTTCCTAAACTTTTAGAAGTGTCTAATAGGTTTCT
AATCGTTCAGTTTAGTTTTAATTTTGTGTCTAATAAGTATCCGACAAATTTAAGATTTTAAAAGTTAATTGATCTTTTAGATATAAATTTGAATTTTATGTCTAATGGAG
ATTTAAGATTTTAATTTCGTGTCAAGTAGATCCATGATTTTTAAAAAATTATTTGTAATTTAGTCTTAAAGATTTATATTAATATAAATATGGTATAACTTTTTTTTTTT
ACCTCATTTCTATACATGGAAGACAACTGTAGCCTAAAGGATTATTGATTATCCCGTAAGGATTATCTCATTTTTATACATGGAAGACCGTATATGTATCCTTAGGAATT
ATTAATTATCCCTTTCTGTTATAAAAATGATGAGTTCTCTTTAATCAATAATAAGTTTTCACATCTCAACACAAGCTTCTTAAGTTCAGAGGTGCAAATCTTCTGTCCAT
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TGAATGAAAGCTAGAGGTTCGAATCTCTACCTTATATATGGTTGAAGAAAAAAAATACTTTTTTTGTGTGTGTAAAAGTTTATTATTTTATTCCACTTTAAATTTAATTT
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