; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi01G001190 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi01G001190
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionLactamase_B domain-containing protein
Genome locationchr01:1247098..1250014
RNA-Seq ExpressionLsi01G001190
SyntenyLsi01G001190
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR036866 - Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8655600.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein isoform 1 [Hibiscus syriacus]1.3e-2358.77Show/hide
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        +I+LTHEHAD +LGLDD+  VQP S T++I+ T VYL Q      S+A +FPYLVQK+LR+ QEVRRVAQLD +IIE++ ++PF ASGL     P +ISK
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           G LDLLILD L
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KAF3450375.1 hypothetical protein FNV43_RR06455 [Rhamnella rubrinervis]2.8e-2349.32Show/hide
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        +I+LTHEHAD +LGLDDI A+QP+SAT+ I+ T +YL Q     +S+A++FPYLVQK+++E QEVRRVAQLD RIIE+NYE+PF ASGL           
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Query:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDAL
                                      VISKG AG LDLLILD L
Subjt:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDAL

XP_008444715.1 PREDICTED: putative hydrolase C777.06c [Cucumis melo]1.4e-2254.55Show/hide
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        +IILTHEHAD ILGLDDI AVQPFSA ++I+ T +YL+Q  +  +S++++FPYLVQK+L+E QEVRRVAQLD +IIED++E+PF ASGL   P  +  GE
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Query:  AGL-LDLLILDALRVGSVTQI
          + L  L  +  RV  ++ +
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XP_021835311.1 putative hydrolase C777.06c [Spinacia oleracea]1.1e-2249.32Show/hide
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        +IILTHEHAD ILGLDDI AVQPFS T++I+ T +YL QD     SVA++FPYLVQK+L+E QE+RRVAQLD +IIE ++E+PF ASGL           
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Query:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDAL
                                     A+ISK   G LDLLILD L
Subjt:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDAL

XP_022146510.1 putative hydrolase C777.06c [Momordica charantia]1.3e-2555.03Show/hide
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        +IILTHEHAD +LGLDDI  VQPFS+T+EIN T VYL QD    KSVAMRFP LV K LRE QEVRRVAQLD +IIED+YE+PF ASGL           
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Query:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDALR
                                      VISK  AG LDLLILDALR
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0K9RW97 Lactamase_B domain-containing protein5.1e-2349.32Show/hide
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        +IILTHEHAD ILGLDDI AVQPFS T++I+ T +YL QD     SVA++FPYLVQK+L+E QE+RRVAQLD +IIE ++E+PF ASGL           
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Query:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDAL
                                     A+ISK   G LDLLILD L
Subjt:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDAL

A0A1S3BAI1 putative hydrolase C777.06c6.7e-2354.55Show/hide
Query:  TIILTHEHADTILGLDDIHAVQPFSATDEINLTLVYLAQDMNMTKSVAMRFPYLVQKELREDQEVRRVAQLDRRIIEDNYEEPFTASGLH--PAVISKGE
        +IILTHEHAD ILGLDDI AVQPFSA ++I+ T +YL+Q  +  +S++++FPYLVQK+L+E QEVRRVAQLD +IIED++E+PF ASGL   P  +  GE
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Query:  AGL-LDLLILDALRVGSVTQI
          + L  L  +  RV  ++ +
Subjt:  AGL-LDLLILDALRVGSVTQI

A0A5D3DB08 Putative hydrolase6.7e-2354.55Show/hide
Query:  TIILTHEHADTILGLDDIHAVQPFSATDEINLTLVYLAQDMNMTKSVAMRFPYLVQKELREDQEVRRVAQLDRRIIEDNYEEPFTASGLH--PAVISKGE
        +IILTHEHAD ILGLDDI AVQPFSA ++I+ T +YL+Q  +  +S++++FPYLVQK+L+E QEVRRVAQLD +IIED++E+PF ASGL   P  +  GE
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Query:  AGL-LDLLILDALRVGSVTQI
          + L  L  +  RV  ++ +
Subjt:  AGL-LDLLILDALRVGSVTQI

A0A6A2WNT5 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein isoform 16.1e-2458.77Show/hide
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        +I+LTHEHAD +LGLDD+  VQP S T++I+ T VYL Q      S+A +FPYLVQK+LR+ QEVRRVAQLD +IIE++ ++PF ASGL     P +ISK
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Query:  GEAGLLDLLILDAL
           G LDLLILD L
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A0A6J1CXF2 putative hydrolase C777.06c6.5e-2655.03Show/hide
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        +IILTHEHAD +LGLDDI  VQPFS+T+EIN T VYL QD    KSVAMRFP LV K LRE QEVRRVAQLD +IIED+YE+PF ASGL           
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Query:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDALR
                                      VISK  AG LDLLILDALR
Subjt:  ----------------------------PAVISKGEAGLLDLLILDALR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30300.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein2.1e-2458Show/hide
Query:  TIILTHEHADTILGLDDIHAVQPFSATDEINLTLVYLAQDMNMTKSVAMRFPYLVQKELREDQEVRRVAQLDRRIIEDNYEEPFTASGLH--PAVISKGE
        +IILTHEHAD +LGLDDI +VQPFS T++I+ T ++++Q     +S+A++FPYLVQK+L+E QEVRRVAQLD R+IE++ E+PF ASGL   P  +  GE
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AT4G03610.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein8.7e-1535.64Show/hide
Query:  HLLAHSLMILLPCLLLGTNDSFRASTQTTGICSPAHWLAVLLSSFCIFSDAARHCLLII-----AKATIILTHEHADTILGLDDIHAVQPFSATDEINLT
        H+ + SL  LLP L    N ++R +T              LL  +C   +  RH  ++I      +  IILTHEHAD + GLD+I ++QP  AT      
Subjt:  HLLAHSLMILLPCLLLGTNDSFRASTQTTGICSPAHWLAVLLSSFCIFSDAARHCLLII-----AKATIILTHEHADTILGLDDIHAVQPFSATDEINLT

Query:  LVYLAQDMNMTKSVAMRFPYLVQKELREDQEVRRVAQLDRRIIEDNYEEPFTASGLH--PAVISKGEAGL-LDLLILDALRVGSVTQI
        L        M +S+A RFPYLV+K+++E    RRV+ LD + IE+N +EPF ASGL   P  +  GE  + L  L  D  +V  ++ +
Subjt:  LVYLAQDMNMTKSVAMRFPYLVQKELREDQEVRRVAQLDRRIIEDNYEEPFTASGLH--PAVISKGEAGL-LDLLILDALRVGSVTQI

AT4G03610.2 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein5.6e-1442.15Show/hide
Query:  TIILTHEHADTILGLDDIHAVQPFSATDEINLTLVYLAQDMNMTKSVAMRFPYLVQKELREDQEVRRVAQLDRRIIEDNYEEPFTASGLH--PAVISKGE
        +IILTHEHAD + GLD+I ++QP  AT      L        M +S+A RFPYLV+K+++E    RRV+ LD + IE+N +EPF ASGL   P  +  GE
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Query:  AGL-LDLLILDALRVGSVTQI
          + L  L  D  +V  ++ +
Subjt:  AGL-LDLLILDALRVGSVTQI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGCAGATTCTCCCGGGAAAATGCCGATCATCGGAATCGGCGACAACGACGGCAATGGTACTGGATCGGCGCTCATCTTCTTGCGCACAGCCTCATGATCCTCCTGCC
GTGTTTGCTCTTAGGCACTAACGATTCCTTCCGAGCCTCAACCCAAACTACAGGTATATGCTCACCGGCGCATTGGCTTGCAGTTTTATTGTCCTCGTTTTGTATATTTT
CGGATGCAGCACGTCACTGCTTATTGATTATTGCCAAAGCAACGATTATTTTGACTCATGAACATGCGGATACGATTCTTGGTTTGGATGATATACACGCTGTGCAACCT
TTTAGTGCCACAGATGAAATTAACCTGACGCTTGTTTACCTAGCACAAGATATGAATATGACGAAGAGTGTAGCAATGAGGTTCCCGTACTTGGTGCAAAAAGAGCTTAG
AGAGGACCAGGAAGTGAGACGGGTAGCACAGCTTGACCGGAGAATCATTGAGGACAATTATGAGGAACCATTTACTGCATCAGGCTTACACCCTGCAGTCATTTCAAAGG
GTGAGGCAGGGCTGTTGGATCTTCTCATCTTGGATGCACTGCGCGTAGGATCAGTGACACAAATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGAGTTGAGTTTGTTGAAAATGGTTAAAAGACTCCAGACCGTTGAAATTGGCGGGACTCAGAAAAGCATCCGTAGAGATGCGCAGATTCTCCCGGGAAAATGCCGATCA
TCGGAATCGGCGACAACGACGGCAATGGTACTGGATCGGCGCTCATCTTCTTGCGCACAGCCTCATGATCCTCCTGCCGTGTTTGCTCTTAGGCACTAACGATTCCTTCC
GAGCCTCAACCCAAACTACAGGTATATGCTCACCGGCGCATTGGCTTGCAGTTTTATTGTCCTCGTTTTGTATATTTTCGGATGCAGCACGTCACTGCTTATTGATTATT
GCCAAAGCAACGATTATTTTGACTCATGAACATGCGGATACGATTCTTGGTTTGGATGATATACACGCTGTGCAACCTTTTAGTGCCACAGATGAAATTAACCTGACGCT
TGTTTACCTAGCACAAGATATGAATATGACGAAGAGTGTAGCAATGAGGTTCCCGTACTTGGTGCAAAAAGAGCTTAGAGAGGACCAGGAAGTGAGACGGGTAGCACAGC
TTGACCGGAGAATCATTGAGGACAATTATGAGGAACCATTTACTGCATCAGGCTTACACCCTGCAGTCATTTCAAAGGGTGAGGCAGGGCTGTTGGATCTTCTCATCTTG
GATGCACTGCGCGTAGGATCAGTGACACAAATCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRRFSRENADHRNRRQRRQWYWIGAHLLAHSLMILLPCLLLGTNDSFRASTQTTGICSPAHWLAVLLSSFCIFSDAARHCLLIIAKATIILTHEHADTILGLDDIHAVQP
FSATDEINLTLVYLAQDMNMTKSVAMRFPYLVQKELREDQEVRRVAQLDRRIIEDNYEEPFTASGLHPAVISKGEAGLLDLLILDALRVGSVTQI