; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi01G001930 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi01G001930
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
Genome locationchr01:1851537..1853279
RNA-Seq ExpressionLsi01G001930
SyntenyLsi01G001930
Gene Ontology termsGO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
GO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR026992 - Non-haem dioxygenase N-terminal domain
IPR027443 - Isopenicillin N synthase-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052582.1 codeine O-demethylase-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-4583.64Show/hide
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TYK13242.1 codeine O-demethylase-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-4583.64Show/hide
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XP_004134920.1 codeine O-demethylase [Cucumis sativus]2.7e-4481.82Show/hide
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XP_022978731.1 codeine O-demethylase-like [Cucurbita maxima]1.1e-4280Show/hide
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XP_038883393.1 protein SRG1-like [Benincasa hispida]8.9e-4887.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UA06 Codeine O-demethylase-like isoform X15.3e-4683.64Show/hide
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A0A5D3CPF6 Codeine O-demethylase-like isoform X15.3e-4683.64Show/hide
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A0A6J1CKJ4 protein SRG1-like1.6e-3465.57Show/hide
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A0A6J1ED48 codeine O-demethylase-like1.0e-4179.09Show/hide
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A0A6J1INU8 codeine O-demethylase-like5.5e-4380Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2A1A0 S-norcoclaurine synthase 11.0e-1436.7Show/hide
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D4N500 Thebaine 6-O-demethylase6.1e-1539.47Show/hide
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        Q+ +K+T   IP  ++  ++    P      +   T P+ID+  LLSP+    + EL  LH ACK WG FQ+VNHGV  SL+  +K EI+ FF +  +EK
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         K+  + G+VEG+G
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D4N501 Probable 2-oxoglutarate/Fe(II)-dependent dioxygenase4.2e-1650.63Show/hide
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D4N502 Codeine O-demethylase6.5e-1742.48Show/hide
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        K+G + G+ EG+G
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Q39224 Protein SRG11.5e-1845.54Show/hide
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        T+P  ++R DQ+ +   D        PIIDM RL S     SE+  L  ACK WG FQLVNHG+  S L ++K EI++FF +P EEK KF  +  E+EG+
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        G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17010.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein6.6e-1742.16Show/hide
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        +G
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AT1G17020.1 senescence-related gene 11.1e-1945.54Show/hide
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Query:  G
        G
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AT1G78550.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein4.0e-2242.98Show/hide
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        +SGE EG+G V  +
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AT4G25300.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein1.2e-1843.69Show/hide
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        T+P  ++R DQ+ +    D       PIIDMS L S     SE+  L SACK WG FQLVNHG+  S L ++K E+++FF +P EEK     +  E+EG+
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Query:  GTV
        G V
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AT4G25310.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein1.3e-1739.02Show/hide
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        + G++EG+G       VF  ++K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAGCACAAAAGAGCTCGAAAATCACAATCCCACAAAACTTCATTCGTTTGGATCAAGAACCTTCTTCTACCTGTGATCCTTCAACCTTCCCCACCCCTCCAATCAT
TGATATGAGCCGATTACTCTCACCAAAACATTCTCAATCCGAGCTTCTCAATCTTCACTCGGCTTGCAAAGGATGGGGATTGTTTCAGTTGGTGAACCATGGGGTTAGCT
GTTCATTGTTGGGAGAGCTAAAGCACGAGATTGAAGAATTTTTTGAGATTCCATTTGAAGAGAAGATGAAGTTTGGTATGAAGAGTGGAGAAGTTGAGGGTTATGGAACA
GTGAAATGCATTGGAATCGTATTTGAAAGAGACGAAAAAGATAACGATGGCGTTGTTGAGGATGATAGCGGGAAATTTGGAGATAGAGGTGAGGAAGATGGAGGAGTTGT
TTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATAGCACAAAAGAGCTCGAAAATCACAATCCCACAAAACTTCATTCGTTTGGATCAAGAACCTTCTTCTACCTGTGATCCTTCAACCTTCCCCACCCCTCCAATCAT
TGATATGAGCCGATTACTCTCACCAAAACATTCTCAATCCGAGCTTCTCAATCTTCACTCGGCTTGCAAAGGATGGGGATTGTTTCAGTTGGTGAACCATGGGGTTAGCT
GTTCATTGTTGGGAGAGCTAAAGCACGAGATTGAAGAATTTTTTGAGATTCCATTTGAAGAGAAGATGAAGTTTGGTATGAAGAGTGGAGAAGTTGAGGGTTATGGAACA
GTGAAATGCATTGGAATCGTATTTGAAAGAGACGAAAAAGATAACGATGGCGTTGTTGAGGATGATAGCGGGAAATTTGGAGATAGAGGTGAGGAAGATGGAGGAGTTGT
TTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIAQKSSKITIPQNFIRLDQEPSSTCDPSTFPTPPIIDMSRLLSPKHSQSELLNLHSACKGWGLFQLVNHGVSCSLLGELKHEIEEFFEIPFEEKMKFGMKSGEVEGYGT
VKCIGIVFERDEKDNDGVVEDDSGKFGDRGEEDGGVV