; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi01G002360 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi01G002360
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionDOG1 domain-containing protein
Genome locationchr01:2155698..2156498
RNA-Seq ExpressionLsi01G002360
SyntenyLsi01G002360
Gene Ontology termsGO:0006351 - transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR025422 - Transcription factor TGA like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052615.1 transcription factor TGA6 [Cucumis melo var. makuwa]9.9e-11482.95Show/hide
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KAG7026521.1 Protein DOG1-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.3e-10174.9Show/hide
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XP_004134926.1 protein DELAY OF GERMINATION 1 [Cucumis sativus]1.1e-11785.61Show/hide
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XP_008439732.1 PREDICTED: transcription factor TGA6 [Cucumis melo]8.4e-11382.44Show/hide
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XP_038883466.1 protein DELAY OF GERMINATION 1-like [Benincasa hispida]6.0e-11985.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNL1 DOG1 domain-containing protein5.5e-11885.61Show/hide
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        IAGCRPSVFIRLAYSLTG++LE ++ EFLQGMKSMEELAGEL+PQQM+QLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIA+RSMKEEG SEELE+A
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A0A1S3B031 transcription factor TGA64.1e-11382.44Show/hide
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        IAGCRP++FIRLAYSLTG++LE ++ +FLQGMKSME++AGEL+PQQM+QLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIA+RSMKE+   EELE+A
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A0A5D3CMS6 Transcription factor TGA64.8e-11482.95Show/hide
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A0A6J1EET8 protein DELAY OF GERMINATION 1-like6.1e-10174.52Show/hide
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        LEKQDGEMLR++++AD+LRIRTL ELTEI RPLQ V  LAFSKKLHLCVREWG+ SDR HGR+
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A0A6J1KW35 protein DELAY OF GERMINATION 1-like2.6e-9973.76Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0SVK0 Protein DELAY OF GERMINATION 18.1e-3434.23Show/hide
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        SS +   ++  +LEWM LQ     EL + L      A       E+ + +L KL  + I  F++Y  +R  LA    S ++AP W S  E +L+W+ GCR
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Query:  PSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAG-------ELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELE
        PS F RL Y+L G   E ++T+FL+ +   E   G       +LS +Q+ +++ L ++ I EEE++T +++ +QE+ AD  +  +A         +  ++
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Query:  KALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
        +AL+KQ+  M RL+ +AD LR+ TL ++  I  P+Q   FL   KKLHL + EWG   DR
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Q58FV0 Protein DOG1-like 31.5e-3233.09Show/hide
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        MA S SS       + C+ EWM +Q     +L EAL +  ++ +  L++          LV + ++ FQ Y ++R +L++   S++FAP W S  E  LL
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Query:  WIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS
        W+ GCRPS FIR+ YSL G   E +L+++L  +    E+       +L+  Q+ +++ L ++ I++E+++T + A +QE +AD   + IA  +       
Subjt:  WIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS

Query:  EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR-RSDRMHGRLRT
          +E AL+K +  M  L+ +ADKLR  TL ++ ++  P+QA  FL   K+LH+ + EWGR R ++  G +RT
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Q84JC2 Protein DOG1-like 41.6e-1025.49Show/hide
Query:  ERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDS
        E +L  L+ +     + Y   +    + DV AFF  VW +  E +  W+ G +PS+  R+                   +  + +    L   Q+K+L+ 
Subjt:  ERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDS

Query:  LQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS-EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVRE
        L+++T  +E+++  E+ R Q  MAD+ +V +A       G S   +E A+      + ++++ AD +R++TL  + +I  P Q V FLA +    + +R 
Subjt:  LQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS-EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVRE

Query:  WGRR
        WG R
Subjt:  WGRR

Q9SN45 Protein DOG1-like 21.5e-2731.66Show/hide
Query:  MAESGSSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLW
        M  S S       +RC+ EWM LQ     +L EAL    N            + +L  LV + ++ +  Y  +R +L+    + +FAP W +  E S+LW
Subjt:  MAESGSSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLW

Query:  IAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASE
        + GCRPS FIRL Y+L G   E +L+++L  +    ++       +L+  Q+ +L+ L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +         A  
Subjt:  IAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASE

Query:  ELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR
         +E AL+K +  M  L+ +ADKLR  TL ++ ++  PLQAV FL   K+L L + + GR
Subjt:  ELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR

Q9SN47 Protein DOG1-like 11.4e-3032.97Show/hide
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        E+ SS+     + C+ EWM LQ     EL EA++  E   N           +L  L+  +I  F DY  +R + ++   S +FAP W +  E +LLW+ 
Subjt:  ESGSSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIA

Query:  GCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFL------------------QGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIA
        GCRPS FIRL Y++ G   E +LT F                   +G     E   +L+ +Q+ +++ L ++T++ E +LT   A +QE+ AD  +   A
Subjt:  GCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFL------------------QGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIA

Query:  IRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDRMHGRL
                A   +E+AL+K + +M  L+ +ADKLR+ TL ++ +I   +QA  FL   KKLHL + EWG+   R H RL
Subjt:  IRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDRMHGRL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G14880.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: transcription factor-related (TAIR:AT4G18650.1)7.5e-1925.59Show/hide
Query:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR
        + E     + K Q+    +L   LN + +  N +       E +L + VD  ++ F++Y   +      DV    A  W SA E SL W+ G RP+    
Subjt:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR

Query:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQM-------KQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQ
        L Y+ +    E ++ + L+G ++ +    +LSP Q        + +  LQ  T+KEE  +T EL+  Q++ +D  +           G S + ++ + + 
Subjt:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQM-------KQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQ

Query:  DGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
           +  ++ + D LR+RT+  + E+  PLQ   FL  + +L   V  WG   DR
Subjt:  DGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR

AT3G14880.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown6.2e-2126.32Show/hide
Query:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR
        + E     + K Q+    +L   LN + +  N +       E +L + VD  ++ F++Y   +      DV    A  W SA E SL W+ G RP+    
Subjt:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR

Query:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRL
        L Y+ +    E ++ + L+G ++ +    +LSP Q + +  LQ  T+KEE  +T EL+  Q++ +D  +           G S + ++ + +    +  +
Subjt:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRL

Query:  IQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
        + + D LR+RT+  + E+  PLQ   FL  + +L   V  WG   DR
Subjt:  IQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR

AT4G18680.1 unknown protein5.4e-2531.38Show/hide
Query:  MKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIRLAYSLTGHD
        M LQ     +L EAL    N            + +L  LV + ++ +  Y  +R +L+    + +FAP W +  E S+LW+ GCRPS FIRL Y+L G  
Subjt:  MKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIRLAYSLTGHD

Query:  LEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQA
         E +L+++L  +    ++       +L+  Q+ +L+ L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +         A   +E AL+K +  M  L+ +A
Subjt:  LEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQA

Query:  DKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR
        DKLR  TL ++ ++  PLQAV FL   K+L L + + GR
Subjt:  DKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR

AT4G18690.1 unknown protein1.1e-3333.09Show/hide
Query:  MAESGSS-SDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLL
        MA S SS       + C+ EWM +Q     +L EAL +  ++ +  L++          LV + ++ FQ Y ++R +L++   S++FAP W S  E  LL
Subjt:  MAESGSS-SDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLL

Query:  WIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS
        W+ GCRPS FIR+ YSL G   E +L+++L  +    E+       +L+  Q+ +++ L ++ I++E+++T + A +QE +AD   + IA  +       
Subjt:  WIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS

Query:  EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR-RSDRMHGRLRT
          +E AL+K +  M  L+ +ADKLR  TL ++ ++  P+QA  FL   K+LH+ + EWGR R ++  G +RT
Subjt:  EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR-RSDRMHGRLRT

AT5G45830.1 delay of germination 15.7e-3534.23Show/hide
Query:  SSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCR
        SS +   ++  +LEWM LQ     EL + L      A       E+ + +L KL  + I  F++Y  +R  LA    S ++AP W S  E +L+W+ GCR
Subjt:  SSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCR

Query:  PSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAG-------ELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELE
        PS F RL Y+L G   E ++T+FL+ +   E   G       +LS +Q+ +++ L ++ I EEE++T +++ +QE+ AD  +  +A         +  ++
Subjt:  PSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAG-------ELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELE

Query:  KALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
        +AL+KQ+  M RL+ +AD LR+ TL ++  I  P+Q   FL   KKLHL + EWG   DR
Subjt:  KALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGAAAGCGGGAGCAGCAGCGACCATGCTGCATCGGAGCGATGTTTCCTGGAGTGGATGAAGCTTCAAGAGGACAGTCAGAGGGAGCTTTTCGAAGCCCTCAACGC
CGTTGAAAACAGAGCAAATTCCAACCTCCAAGACCCCGAAGAAATCGAACGTCAACTCACCAAGCTTGTAGACGAGAGCATCGACCAATTCCAAGACTACATTGACCGAC
GAATGCAGCTGGCCAAAAACGACGTGTCCGCATTCTTCGCCCCTGTCTGGTGCAGCGCCAGAGAAACCTCTCTCCTCTGGATCGCCGGTTGCCGGCCCTCCGTCTTCATC
CGCTTAGCCTACTCCCTCACCGGACACGACCTGGAAAAAAAACTCACGGAATTTCTGCAGGGGATGAAGTCGATGGAGGAATTAGCGGGAGAGCTGTCGCCGCAGCAAAT
GAAGCAGCTGGACAGTCTGCAGATGAGAACCATCAAGGAGGAGGAGAGACTGACGTCGGAGCTGGCGAGGGTGCAGGAGGAGATGGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTG
CGATAAGATCAATGAAAGAGGAAGGGGCGAGTGAGGAACTGGAGAAGGCTCTGGAAAAGCAGGATGGGGAAATGCTGAGACTCATCCAACAAGCCGACAAACTGAGGATC
CGTACGCTGAATGAGCTGACGGAGATTTTCAGACCGTTGCAGGCGGTGTGGTTCTTAGCGTTCAGTAAGAAGCTCCATCTCTGCGTCCGCGAATGGGGACGGCGAAGCGA
TCGAATGCACGGCAGACTTCGTACTCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGTTGAAAACAGAGCAAATTCCAACCTCCAAGACCCCGAAGAAATCGAACGTCAACTCACCAAGCTTGTAGACGAGAGCATCGACCAATTCCAAGACTACATTGACCGAC
GAATGCAGCTGGCCAAAAACGACGTGTCCGCATTCTTCGCCCCTGTCTGGTGCAGCGCCAGAGAAACCTCTCTCCTCTGGATCGCCGGTTGCCGGCCCTCCGTCTTCATC
CGCTTAGCCTACTCCCTCACCGGACACGACCTGGAAAAAAAACTCACGGAATTTCTGCAGGGGATGAAGTCGATGGAGGAATTAGCGGGAGAGCTGTCGCCGCAGCAAAT
GAAGCAGCTGGACAGTCTGCAGATGAGAACCATCAAGGAGGAGGAGAGACTGACGTCGGAGCTGGCGAGGGTGCAGGAGGAGATGGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTG
CGATAAGATCAATGAAAGAGGAAGGGGCGAGTGAGGAACTGGAGAAGGCTCTGGAAAAGCAGGATGGGGAAATGCTGAGACTCATCCAACAAGCCGACAAACTGAGGATC
CGTACGCTGAATGAGCTGACGGAGATTTTCAGACCGTTGCAGGCGGTGTGGTTCTTAGCGTTCAGTAAGAAGCTCCATCTCTGCGTCCGCGAATGGGGACGGCGAAGCGA
TCGAATGCACGGCAGACTTCGTACTCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAESGSSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDESIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFI
RLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRI
RTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDRMHGRLRTP