; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi01G003090 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi01G003090
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationchr01:2747613..2748296
RNA-Seq ExpressionLsi01G003090
SyntenyLsi01G003090
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023543221.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-8286.43Show/hide
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XP_038882910.1 VQ motif-containing protein 4-like [Benincasa hispida]8.2e-10992.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KI33 VQ domain-containing protein4.7e-10288.55Show/hide
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A0A1S3B0C2 VQ motif-containing protein 4-like1.4e-10187.67Show/hide
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A0A5D3CP65 VQ motif-containing protein 4-like1.4e-10187.67Show/hide
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A0A6J1EIU9 VQ motif-containing protein 4-like4.4e-8480.09Show/hide
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A0A6J1IR60 VQ motif-containing protein 4-like1.2e-7885.42Show/hide
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        +NRS+STNPYP TFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ STPD PSKTHIP IKSIP+R HSNFKLYERRNAL NLQ I+PVFAS   T GFSPR    H
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        PEI SPSMLDFPSLV+SPVTPLIPDPFGRSQPLNSEP+NNV+ SN GLD EAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPP  G
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 133.2e-3145.7Show/hide
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        Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       P  P    IPPIK++  K+Q S+F+L ERRN++ +   INP  +                PEIL+P++
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        L+FP+L LSP TPL+ DPF R    +  P++    S    D++ E ++I+EKGFYL PSP+TTPR++EP+LL LFP+T   SP PS
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Q5M750 VQ motif-containing protein 45.2e-5052.67Show/hide
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        NS+ +   +++++  +PP  P + +  RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+
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        ++E+GFYLHPSPATTP + EP+LLPLFP+TSP  SG    S+S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 333.8e-3242.06Show/hide
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        TS+ ++  + +Q PPP   +                   +NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS     T K    P P +  +      IPPIK    
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Query:  RQHSNFKLYERRNALHNLQIINPVFASSV------------------STPGFSPRNKHNHPEI-LSPSMLDFPSLVL-SPVTPL--IPDPFGRSQPLNSE
         + ++FKLYERR   +N+   N +  +++                   +P FSPRN  +   I LSPSMLDFP L L SPVTPL    DPF +S PL   
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Query:  PANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP
             +  NS      E KAI +KGFYLHPSP +TPR+S+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.4e-1536.76Show/hide
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        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E    A+TP+    KT      +I KR  S  KL+ERR  +   L+I+ P    S    G +P +K  +  +L+ S +
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          PS + S ++ +  +P                  +   + E E KAI+E+ FYLHPSP + P  +EP+LL LFP+TSP  SG+P
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 192.4e-3446.12Show/hide
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        P+SS +S S++  +G        I RSD    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTG     SP++ +  +TP       IPPIK+   ++HS  KLYERR  
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            N L N  +IN +        +P FSPRN+    EILSPS LDFP L L SPVTPL         DPF +  PL+                  E + 
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        I +KG+YLH SP +TPR+SEPQLLPLFP+TSP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein3.7e-5152.67Show/hide
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        NS+ +   +++++  +PP  P + +  RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+
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             F+LYERRN++ NL+I  +NPVF  +     FSPR     PEILSPS+LDFPSLVLSPVTPLIPDPF RS   N  P           +  AE KA
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        ++E+GFYLHPSPATTP + EP+LLPLFP+TSP  SG    S+S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein5.4e-5052.72Show/hide
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        NS+ +   +++++  +PP  P + +  RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+
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        ++E+GFYLHPSPATTP + EP+LLPLFP+TSP  S   R
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein2.3e-3245.7Show/hide
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        Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       P  P    IPPIK++  K+Q S+F+L ERRN++ +   INP  +                PEIL+P++
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        L+FP+L LSP TPL+ DPF R    +  P++    S    D++ E ++I+EKGFYL PSP+TTPR++EP+LL LFP+T   SP PS
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AT3G15300.1 VQ motif-containing protein1.7e-3546.12Show/hide
Query:  PNSSFTSTSTTTADGLQPPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-----SPETAKQASTPDPPSKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERR--
        P+SS +S S++  +G        I RSD    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTG     SP++ +  +TP       IPPIK+   ++HS  KLYERR  
Subjt:  PNSSFTSTSTTTADGLQPPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-----SPETAKQASTPDPPSKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERR--

Query:  ----NALHNLQIINPVF--ASSVSTPGFSPRNKHNHPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSEPANNVNCSNSGLDEEAEAKA
            N L N  +IN +        +P FSPRN+    EILSPS LDFP L L SPVTPL         DPF +  PL+                  E + 
Subjt:  ----NALHNLQIINPVF--ASSVSTPGFSPRNKHNHPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSEPANNVNCSNSGLDEEAEAKA

Query:  IREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP
        I +KG+YLH SP +TPR+SEPQLLPLFP+TSP
Subjt:  IREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein2.7e-3342.06Show/hide
Query:  TSTSTTTADGLQPPPPKFIN---------------RSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS---PETAKQASTPDPPSKTH------IPPIKSIPK
        TS+ ++  + +Q PPP   +                   +NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS     T K    P P +  +      IPPIK    
Subjt:  TSTSTTTADGLQPPPPKFIN---------------RSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS---PETAKQASTPDPPSKTH------IPPIKSIPK

Query:  RQHSNFKLYERRNALHNLQIINPVFASSV------------------STPGFSPRNKHNHPEI-LSPSMLDFPSLVL-SPVTPL--IPDPFGRSQPLNSE
         + ++FKLYERR   +N+   N +  +++                   +P FSPRN  +   I LSPSMLDFP L L SPVTPL    DPF +S PL   
Subjt:  RQHSNFKLYERRNALHNLQIINPVFASSV------------------STPGFSPRNKHNHPEI-LSPSMLDFPSLVL-SPVTPL--IPDPFGRSQPLNSE

Query:  PANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP
             +  NS      E KAI +KGFYLHPSP +TPR+S+P LLPLFP+ SP
Subjt:  PANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAATTTCTCATCCAAATTCATCCTTCACTTCAACTTCAACCACCACCGCCGATGGCCTTCAACCACCACCGCCCAAATTCATTAACAGATCCGATTCCACTAACCC
ATATCCCACCACTTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCCTTTAAACAAGTTGTTCAAATGCTCACCGGCTCGCCGGAAACCGCCAAGCAAGCTTCCACACCAGACCCACCTT
CCAAAACCCACATCCCTCCCATTAAATCCATTCCCAAACGCCAACACTCCAATTTCAAACTCTATGAGCGAAGAAATGCCCTCCATAACCTCCAAATTATCAACCCTGTT
TTTGCCTCCTCTGTTTCTACTCCCGGATTTTCCCCTAGAAATAAACATAACCACCCTGAAATTCTCTCTCCCAGTATGCTGGATTTCCCGTCGCTTGTCCTCAGCCCCGT
CACACCGCTCATTCCCGATCCCTTCGGCCGATCGCAGCCGTTGAATTCTGAACCGGCGAACAATGTCAATTGTAGTAATTCGGGGTTGGATGAGGAAGCAGAGGCTAAAG
CCATTAGAGAAAAGGGGTTTTATTTGCACCCTTCGCCGGCCACTACTCCCAGGGAATCGGAGCCGCAGCTTTTGCCTCTTTTTCCGATCACTTCCCCTCCACCTTCAGGT
CAACCTCGCCTTTCGTCTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAATTTCTCATCCAAATTCATCCTTCACTTCAACTTCAACCACCACCGCCGATGGCCTTCAACCACCACCGCCCAAATTCATTAACAGATCCGATTCCACTAACCC
ATATCCCACCACTTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCCTTTAAACAAGTTGTTCAAATGCTCACCGGCTCGCCGGAAACCGCCAAGCAAGCTTCCACACCAGACCCACCTT
CCAAAACCCACATCCCTCCCATTAAATCCATTCCCAAACGCCAACACTCCAATTTCAAACTCTATGAGCGAAGAAATGCCCTCCATAACCTCCAAATTATCAACCCTGTT
TTTGCCTCCTCTGTTTCTACTCCCGGATTTTCCCCTAGAAATAAACATAACCACCCTGAAATTCTCTCTCCCAGTATGCTGGATTTCCCGTCGCTTGTCCTCAGCCCCGT
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CAACCTCGCCTTTCGTCTTCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKISHPNSSFTSTSTTTADGLQPPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASTPDPPSKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERRNALHNLQIINPV
FASSVSTPGFSPRNKHNHPEILSPSMLDFPSLVLSPVTPLIPDPFGRSQPLNSEPANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPPPSG
QPRLSSS