| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025634.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo var. makuwa] | 2.5e-120 | 85.87 | Show/hide |
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FREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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| KAE8647621.1 hypothetical protein Csa_003197 [Cucumis sativus] | 3.8e-89 | 89.22 | Show/hide |
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RGSR
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| XP_016899368.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo] | 1.7e-92 | 89.05 | Show/hide |
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R
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| XP_031743118.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 3.8e-89 | 89.22 | Show/hide |
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RGSR
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| XP_038881911.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Benincasa hispida] | 5.2e-94 | 89.05 | Show/hide |
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R
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KMM4 RRM domain-containing protein | 1.9e-89 | 89.22 | Show/hide |
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RGSR
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|
|
| A0A1S4DTT1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 8.1e-93 | 89.05 | Show/hide |
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R
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|
| A0A5A7SJ12 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.2e-120 | 85.87 | Show/hide |
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V+L I+ + K +M + LG +GTLDLLPPGELLQD DLDHD GPGPGPDHGQGQDPQVVEDQG EVVGASSR+HA+NPGNTLYVTGLSTRVTE
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FREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
|
| A0A6J1GFF0 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 7.8e-88 | 91.1 | Show/hide |
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E+ +NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKV+SCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL
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KSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPY GGRSRRDHSRSPPYSP GGSPDRRYPRGSR
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|
|
| A0A6J1INV2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 7.8e-88 | 91.1 | Show/hide |
Query: EHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL
E+ +NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKV+SCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL
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KSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPY GGRSRRDHSRSPPYSP GGSPDRRYPRGSR
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 9.1e-17 | 41.94 | Show/hide |
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++ R H N P L V GLS TERDL E FSK G +A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP T
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Query: PTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
PTPG Y+G + T S R D R G DY Y RS R +R A++ R SP PY R R SRS YSP
Subjt: PTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q10422 Uncharacterized RNA-binding protein C25G10.01 | 3.7e-18 | 36.93 | Show/hide |
Query: SSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHY
S+ E + N GN L+V+G+++R+ E +L++ FSK G V ++ EP T+ SRGF F++ V++A + +LN GR + V+K++R RP +PTPG Y
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Query: LGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-RSPYRGA---REYSP------RHSPPPYGGRSRRDHSRS
+G R+S D S + GG R +Y R S R R+ YR + RE+SP R++ R R H RS
Subjt: LGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-RSPYRGA---REYSP------RHSPPPYGGRSRRDHSRS
|
|
| Q13595 Transformer-2 protein homolog alpha | 5.3e-17 | 41.92 | Show/hide |
Query: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
+P L V GLS TERDL E FS+ G ++ +V + RT SRGFAFV + +DD+ ++ N L+GR I V+ S KR TPTPG Y+G + T
Subjt: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
Query: DSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRH---SPPPYGGRSRRDHSRSPPYSP
G G G GGG R D Y R R Y +Y R+ SP PY R R SRS YSP
Subjt: DSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRH---SPPPYGGRSRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 9.1e-17 | 41.94 | Show/hide |
Query: ASSREHAHN-----PGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRT
++ R H N P L V GLS TERDL E FSK G +A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP T
Subjt: ASSREHAHN-----PGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRT
Query: PTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
PTPG Y+G + T S R D R G DY Y RS R +R A++ R SP PY R R SRS YSP
Subjt: PTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.1e-35 | 51.24 | Show/hide |
Query: QGREVVGASSR-------EHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVE
+GR V + SR A NPGN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ S+L+GR ITVE
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Query: KSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPP
K+RR+R RTPTPG YLGL++ R S R SR R G S+ YG R RS SP YR R YSP SP P RRD S SP
Subjt: KSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPP
Query: Y
Y
Subjt: Y
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G07350.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.1e-37 | 51.24 | Show/hide |
Query: QGREVVGASSR-------EHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVE
+GR V + SR A NPGN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ S+L+GR ITVE
Subjt: QGREVVGASSR-------EHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVE
Query: KSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPP
K+RR+R RTPTPG YLGL++ R S R SR R G S+ YG R RS SP YR R YSP SP P RRD S SP
Subjt: KSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPP
Query: Y
Y
Subjt: Y
|
|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-49 | 62.37 | Show/hide |
Query: SSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHY
S NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHY
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Query: LGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPPYGGSPDRRY-PRGSR
LGLKS+RDS G R S RG R+DY RRSPR R+YSPR RSRRD S S P+ P +RRY PRGSR
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|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-50 | 60.89 | Show/hide |
Query: QGREVVGASSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRP
+GR + R NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRP
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Query: RTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPPYGGSPDRRY-PRG
RTPTPGHYLGLKS+RDS G R S RG R+DY RRSPR R+YSPR RSRRD S S P+ P +RRY PRG
Subjt: RTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPPYGGSPDRRY-PRG
Query: SR
SR
Subjt: SR
|
|
| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.9e-34 | 70.21 | Show/hide |
Query: QGREVVGASSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
+GR + R NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: QGREVVGASSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
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| AT4G35785.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-33 | 74.42 | Show/hide |
Query: SSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
S NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
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