CuGenDBv2

Gene ID	Lsi01G013440
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	60S ribosomal protein L12-like
Genome location	chr01:11638828..11639328
RNA-Seq Expression	Lsi01G013440
Synteny	Lsi01G013440
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004143249.1 60S ribosomal protein L12-1 [Cucumis sativus]

3.3e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQVV+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

XP_022143990.1 60S ribosomal protein L12-like [Momordica charantia]

1.5e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDL G+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

6.7e-84

99.4

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

1.1e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

2.3e-84

100

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CQD9 60S ribosomal protein L12-like

7.2e-84

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDL G+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

A0A6J1F4X7 60S ribosomal protein L12-1-like

3.2e-84

99.4

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

A0A6J1GE12 60S ribosomal protein L12-3

5.5e-84

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

3.2e-84

99.4

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

A0A6J1KW77 60S ribosomal protein L12-3

5.5e-84

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

1.8e-79

90.96

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        H+G+ISLDDVIEIA++M+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVEIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

1.6e-64

72.89

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDP++V  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKLT+QNRQA VSVVPSA+ALVIKALKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P D+Q+EI +G++EIPQ+
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

P50883 60S ribosomal protein L12-1

1.0e-79

89.16

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

1.8e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI  GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

2.3e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

7.4e-81

89.16

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.6e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.3e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI  GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCGCCCAAGTTCGATCCTTCTCAGGTTGTCGATGTTTTCGTCCGAGTCACCGGAGGTGAGGTCGGAGCGGCCAGTTCTCTCGCTCCTAAAATCGGTCCTCTAGGTCT
CTCCCCGAAGAAGATCGGAGAAGACATTGCCAAGGAGACTGCCAAGGAATGGAAGGGTCTCAGAGTCACTGTCAAGCTTACTGTGCAGAACCGTCAAGCCAAGGTCTCGG
TTGTTCCTTCTGCTGCTGCTTTGGTCATCAAGGCCCTCAAGGAGCCTGAGCGAGACCGCAAAAAGACCAAGAACATCAAGCACAATGGTAATATCTCGCTTGACGATGTG
ATTGAGATCGCTAGGGTTATGCGCCCCAGGTCTATGGCTAAGGATCTCAGTGGATCCGTCAAGGAGATTCTCGGTACTTGCGTTTCTGTTGGATGTACGGTCGACGGTAA
GGACCCGAAGGATTTACAGCAGGAAATTACTGATGGAGATGTTGAAATTCCCCAGGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIKHNGNISLDDV
IEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEITDGDVEIPQD

Lsi01G013440 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome