; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi01G013610 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi01G013610
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr01:11774662..11778281
RNA-Seq ExpressionLsi01G013610
SyntenyLsi01G013610
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647385.1 hypothetical protein Csa_002978 [Cucumis sativus]2.9e-11982.78Show/hide
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XP_011657645.1 uncharacterized protein LOC101220918 [Cucumis sativus]2.9e-11982.78Show/hide
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XP_038880947.1 uncharacterized protein LOC120072617 isoform X1 [Benincasa hispida]6.2e-12285.35Show/hide
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XP_038880948.1 uncharacterized protein LOC120072617 isoform X2 [Benincasa hispida]7.8e-12589.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF21 Uncharacterized protein1.4e-11982.78Show/hide
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A0A1S3BLN6 uncharacterized protein LOC1034912012.6e-11882.42Show/hide
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A0A5A7TWJ8 Uncharacterized protein7.6e-11882.35Show/hide
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A0A6J1E431 uncharacterized protein LOC1114297512.5e-10877.29Show/hide
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         LLME+ S+SS SS  +LVWSEELYSGEFDNLRLCNL S+ET+  LHP+L+GHESNTH+V R+  PN EVLQV
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A0A6J1JD30 uncharacterized protein LOC1114857012.7e-10776.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G07950.1 unknown protein3.9e-5848.73Show/hide
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        M    F  P S      S S+ +   SP    S  RLWRP+AQRN+RNQWS LS+ +QQW  + S+GRSHAT +VN+YLS+KYMP MELG LSDM DI  
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         A  KL  QQ              V VVV+MVNASR +RCY K S+ S L+QFS + ED+N  D GD GGI VF    +  FEK+AEELV MF+ E+ LK
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        RLL+ME+ SLS+E   P N  WS+ELY GEFD+L  C+L+S E  + + P ++ +   +  +  +  P AE+LQ+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAGGCCATCGGCACAAAGGAACATTAGGAATCAATGGTCGAAGTTGTCTTCACTCAAACAACAATGGGCTTCTTCTTCTTCAAGTGGTCGATCTCATGCTACCTCCATTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCAATGCCTATTTATCTGAAAAGTACATGCCTTCTATGGAGCTGGGTTCTCTCAGCGACATGATTGATATACGAAACACAGCTTGTTTGAAATTGTCTAAGCAGCAGGTT
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