; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi01G015960 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi01G015960
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionregulatory-associated protein of TOR 1-like
Genome locationchr01:14178502..14182247
RNA-Seq ExpressionLsi01G015960
SyntenyLsi01G015960
Gene Ontology termsGO:0009267 - cellular response to starvation (biological process)
GO:0010506 - regulation of autophagy (biological process)
GO:0030307 - positive regulation of cell growth (biological process)
GO:0031929 - TOR signaling (biological process)
GO:0071230 - cellular response to amino acid stimulus (biological process)
GO:0071902 - positive regulation of protein serine/threonine kinase activity (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0031931 - TORC1 complex (cellular component)
GO:0030674 - protein binding, bridging (molecular function)
InterPro domainsIPR004083 - Regulatory associated protein of TOR
IPR029347 - Raptor, N-terminal CASPase-like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050391.1 regulatory-associated protein of TOR 1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-12973.61Show/hide
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XP_023543826.1 regulatory-associated protein of TOR 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-12872.14Show/hide
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XP_038881490.1 regulatory-associated protein of TOR 1-like [Benincasa hispida]1.3e-13073.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L034 WD_REPEATS_REGION domain-containing protein1.2e-12973.61Show/hide
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A0A5D3BDX7 Regulatory-associated protein of TOR 1 isoform X11.2e-12973.61Show/hide
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A0A6J1CS41 regulatory-associated protein of TOR 12.9e-12872.43Show/hide
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A0A6J1EE73 regulatory-associated protein of TOR 1-like isoform X12.9e-12872.35Show/hide
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A0A6J1IT38 regulatory-associated protein of TOR 1-like2.9e-12872.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0IQN5 Regulatory-associated protein of TOR 22.2e-8553.67Show/hide
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        MAP KALE+IGKTL  QYERWQP+ARYK+QLDPT+EEVKKLC+TCRK+A+TERVLFHYNGHGVPKPTA+GEIW+FNK                       
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          SYTQYIPLPI+DLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIV AF E
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Q8K4Q0 Regulatory-associated protein of mTOR3.2e-5545.75Show/hide
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Query:  GSNPFSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVL
          +P SM PQKALE+IG  L  QYE WQPRARYK  LDPTV+EVKKLC++ R+ AK ERVLFHYNGHGVP+PT +GE+W+FNK                 
Subjt:  GSNPFSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVL

Query:  FSRFFMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE
                +YTQYIPL I DL +W+ +PSI+V+DCS AG+IV +F +
Subjt:  FSRFFMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE

Q8N122 Regulatory-associated protein of mTOR3.2e-5545.75Show/hide
Query:  LVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRS
        L   WR KDRMKT  VALVLCLN+ VDPPDV+K +PCAR+ECWI                                                        
Subjt:  LVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRS

Query:  GSNPFSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVL
          +P SM PQKALE+IG  L  QYE WQPRARYK  LDPTV+EVKKLC++ R+ AK ERVLFHYNGHGVP+PT +GE+W+FNK                 
Subjt:  GSNPFSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVL

Query:  FSRFFMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE
                +YTQYIPL I DL +W+ +PSI+V+DCS AG+IV +F +
Subjt:  FSRFFMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE

Q93YQ1 Regulatory-associated protein of TOR 11.4e-10058.96Show/hide
Query:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL--DDCASNHDDDVDLISLRRDSEV-ASSSYGNA---AVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSK
        MALGDLM SR SQSS+++VSNH   +DC S+HDD     S R+DSE  +SSSYGN       TAT+M YLPQTIVLCELRHDA EA  P G S+  LV K
Subjt:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL--DDCASNHDDDVDLISLRRDSEV-ASSSYGNA---AVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSK

Query:  WRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNP
        WR K+RMKTGCVALVLCLNI+VDPPDVIKISPCAR+E WI                                                          +P
Subjt:  WRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNP

Query:  FSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRF
        FSMAP KALE+IGK LS QYERWQPRARYKVQLDPTV+EV+KLC TCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTA+GEIW+FNK                     
Subjt:  FSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRF

Query:  FMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTEIHD
            SYTQYIPLPIS+LDSWLKTPSIYVFDCSAA MI+NAF E+HD
Subjt:  FMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTEIHD

Q9LZW9 Regulatory-associated protein of TOR 21.0e-8250.58Show/hide
Query:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL----DDCASNHDDDVDLISLRRDSEVASSSYGNAAVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSKWR
        MALGDLM SR+SQSS+ VV+NHL    D+CAS+  DD   +S+     VASSSY N  ++ AT+M YLPQT+VLC+LRHD          SD     +WR
Subjt:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL----DDCASNHDDDVDLISLRRDSEVASSSYGNAAVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSKWR

Query:  PKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNPFS
         K+RMKTGCVALV+CL+I+VDPPDVIKISPCAR+ECWI                                                          +PFS
Subjt:  PKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNPFS

Query:  M-APQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRFF
        M  P++ALE+IG+ LS+QYERW  RARYKV+LDPT ++V+KLC +CRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPT +GEIW++NK                      
Subjt:  M-APQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRFF

Query:  MVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE
           ++TQYIPLP+S+LDSWLKTP+IYVFDCSAA +I+NAF E
Subjt:  MVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G08850.1 HEAT repeat ;WD domain, G-beta repeat protein protein1.0e-10158.96Show/hide
Query:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL--DDCASNHDDDVDLISLRRDSEV-ASSSYGNA---AVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSK
        MALGDLM SR SQSS+++VSNH   +DC S+HDD     S R+DSE  +SSSYGN       TAT+M YLPQTIVLCELRHDA EA  P G S+  LV K
Subjt:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL--DDCASNHDDDVDLISLRRDSEV-ASSSYGNA---AVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSK

Query:  WRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNP
        WR K+RMKTGCVALVLCLNI+VDPPDVIKISPCAR+E WI                                                          +P
Subjt:  WRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNP

Query:  FSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRF
        FSMAP KALE+IGK LS QYERWQPRARYKVQLDPTV+EV+KLC TCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTA+GEIW+FNK                     
Subjt:  FSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRF

Query:  FMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTEIHD
            SYTQYIPLPIS+LDSWLKTPSIYVFDCSAA MI+NAF E+HD
Subjt:  FMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTEIHD

AT5G01770.1 HEAT repeat ;WD domain, G-beta repeat protein protein7.4e-8450.58Show/hide
Query:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL----DDCASNHDDDVDLISLRRDSEVASSSYGNAAVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSKWR
        MALGDLM SR+SQSS+ VV+NHL    D+CAS+  DD   +S+     VASSSY N  ++ AT+M YLPQT+VLC+LRHD          SD     +WR
Subjt:  MALGDLMASRISQSSLAVVSNHL----DDCASNHDDDVDLISLRRDSEVASSSYGNAAVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSKWR

Query:  PKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNPFS
         K+RMKTGCVALV+CL+I+VDPPDVIKISPCAR+ECWI                                                          +PFS
Subjt:  PKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNPFS

Query:  M-APQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRFF
        M  P++ALE+IG+ LS+QYERW  RARYKV+LDPT ++V+KLC +CRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPT +GEIW++NK                      
Subjt:  M-APQKALESIGKTLSVQYERWQPRARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRFF

Query:  MVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE
           ++TQYIPLP+S+LDSWLKTP+IYVFDCSAA +I+NAF E
Subjt:  MVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVNAFTE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATTGGGGGATTTGATGGCCTCTCGGATTTCTCAATCTTCCTTAGCTGTGGTCTCAAATCACTTGGATGACTGTGCTTCCAACCACGATGACGATGTGGATTTAAT
TTCCCTCAGAAGGGATTCCGAGGTTGCTAGTAGTAGTTATGGCAATGCTGCCGTCACTACTGCCACAACCATGGTTTACTTGCCCCAGACTATAGTGTTATGTGAGCTTC
GTCACGATGCATTTGAGGCTTGCTTGCCTGCCGGCCCATCTGATAGCGGATTGGTCTCTAAATGGAGACCTAAAGACCGAATGAAGACAGGATGTGTAGCTCTAGTATTA
TGTTTAAACATTAGTGTTGATCCACCTGATGTAATTAAGATTTCTCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTGGATAGTGTTAAACATAAACACGGTGATGTTTTCAGCCCTTTT
ATTTTTACTATTGGTCTTAGGGCTGCCTTTGCACGATCTTTCTGTGGGCTTTTTTTTTTTTTTTGTTATTTTCACAAAGGAAATGATGCAAATTGTTTGTGATAGGAATT
GGGATTCACATTTCCGTTCTGGTTCCAATCCGTTTTCTATGGCACCCCAAAAAGCACTTGAAAGTATTGGAAAAACATTGAGTGTACAGTATGAGAGGTGGCAACCCAGG
GCTCGCTATAAAGTTCAGCTGGATCCCACTGTGGAAGAGGTAAAAAAGCTTTGTAGTACATGTCGCAAGTATGCAAAGACTGAACGGGTTCTCTTCCATTATAATGGACA
TGGTGTTCCGAAGCCAACTGCCAGCGGTGAAATTTGGCTTTTCAACAAGGTCTATATATTCATATATTATAGTTTTCTGTTAATGCCTGTTATTGTCTTATTCTCACGGT
TTTTCATGGTGCAGAGTTATACCCAGTATATCCCCTTACCTATTAGTGATCTGGATTCGTGGTTGAAGACACCTTCCATTTACGTGTTTGATTGTTCTGCTGCTGGGATG
ATAGTTAATGCCTTCACTGAGATTCATGATGTTCATACTCTTAATTACATCAATATCATTCTTTTTTATAGCTTCACGATCCCTCTGGATCAACAAGGGATTGCATTTTG
CTTGCAGCATGTGAATCACACGAAACTCTTCCCCAAAGAGCTGAATTTCCTGCAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACAAACTCACCAGAAAAAAGACTCTCTCTTTTGTTTGTGTTTTCTCTCTCTTGGAGTTTGACAAAATCGTAATGCAAAAGAGCTGAGTTTTTATTTCCGTTGGTGCCGC
CACGGTTTTATGCGCCTCCATCCTCTTCTCTTCTTCTTCACCTTCTAGGGTTATCAGACTCTTCTTCTCTGGGTTTCCTAGGGTTTTTCGAGCTGGATTCTCTCTCATTC
CTTCGTCGAATCTCCACGCGCCGCTGGTTAAGCGGCTTCGTCGATTAGCTACCTTCCAATTCCCTTCTTTTCTCTCTCCTTCTCCCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTA
CCTTCCTCTACCTTTCAAACCGATCTACAAAAGCGTCTTCACAAACCTTATATGCTTTTCCTTATCCGTTTAGGACGAGGGGGTATGGTTCTACGATTAGGGCAAGGTTG
ATATTGGGCGTTTTCCAGATTGGTTTTGTGTTTCGAGGGTTTTGGATTTGGATGGCATTGGGGGATTTGATGGCCTCTCGGATTTCTCAATCTTCCTTAGCTGTGGTCTC
AAATCACTTGGATGACTGTGCTTCCAACCACGATGACGATGTGGATTTAATTTCCCTCAGAAGGGATTCCGAGGTTGCTAGTAGTAGTTATGGCAATGCTGCCGTCACTA
CTGCCACAACCATGGTTTACTTGCCCCAGACTATAGTGTTATGTGAGCTTCGTCACGATGCATTTGAGGCTTGCTTGCCTGCCGGCCCATCTGATAGCGGATTGGTCTCT
AAATGGAGACCTAAAGACCGAATGAAGACAGGATGTGTAGCTCTAGTATTATGTTTAAACATTAGTGTTGATCCACCTGATGTAATTAAGATTTCTCCTTGTGCCAGAAT
GGAGTGCTGGATAGTGTTAAACATAAACACGGTGATGTTTTCAGCCCTTTTATTTTTACTATTGGTCTTAGGGCTGCCTTTGCACGATCTTTCTGTGGGCTTTTTTTTTT
TTTTTGTTATTTTCACAAAGGAAATGATGCAAATTGTTTGTGATAGGAATTGGGATTCACATTTCCGTTCTGGTTCCAATCCGTTTTCTATGGCACCCCAAAAAGCACTT
GAAAGTATTGGAAAAACATTGAGTGTACAGTATGAGAGGTGGCAACCCAGGGCTCGCTATAAAGTTCAGCTGGATCCCACTGTGGAAGAGGTAAAAAAGCTTTGTAGTAC
ATGTCGCAAGTATGCAAAGACTGAACGGGTTCTCTTCCATTATAATGGACATGGTGTTCCGAAGCCAACTGCCAGCGGTGAAATTTGGCTTTTCAACAAGGTCTATATAT
TCATATATTATAGTTTTCTGTTAATGCCTGTTATTGTCTTATTCTCACGGTTTTTCATGGTGCAGAGTTATACCCAGTATATCCCCTTACCTATTAGTGATCTGGATTCG
TGGTTGAAGACACCTTCCATTTACGTGTTTGATTGTTCTGCTGCTGGGATGATAGTTAATGCCTTCACTGAGATTCATGATGTTCATACTCTTAATTACATCAATATCAT
TCTTTTTTATAGCTTCACGATCCCTCTGGATCAACAAGGGATTGCATTTTGCTTGCAGCATGTGAATCACACGAAACTCTTCCCCAAAGAGCTGAATTTCCTGCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALGDLMASRISQSSLAVVSNHLDDCASNHDDDVDLISLRRDSEVASSSYGNAAVTTATTMVYLPQTIVLCELRHDAFEACLPAGPSDSGLVSKWRPKDRMKTGCVALVL
CLNISVDPPDVIKISPCARMECWIVLNINTVMFSALLFLLLVLGLPLHDLSVGFFFFFVIFTKEMMQIVCDRNWDSHFRSGSNPFSMAPQKALESIGKTLSVQYERWQPR
ARYKVQLDPTVEEVKKLCSTCRKYAKTERVLFHYNGHGVPKPTASGEIWLFNKVYIFIYYSFLLMPVIVLFSRFFMVQSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGM
IVNAFTEIHDVHTLNYINIILFYSFTIPLDQQGIAFCLQHVNHTKLFPKELNFLQ