; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi01G018580 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi01G018580
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF642
Genome locationchr01:20296892..20305263
RNA-Seq ExpressionLsi01G018580
SyntenyLsi01G018580
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR006946 - Domain of unknown function DUF642


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6603218.1 40S ribosomal protein S5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.4e-7792.26Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPPMQ DHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRES I+QIIQTVP K+YNLTFT+GDARNGCHGSMDVQAFAA+QTIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRGLGRSKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHD+ HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

KAG7033526.1 hypothetical protein SDJN02_03248, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-7792.26Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPPMQ DHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRES I+QIIQTVP K+YNLTFT+GDARNGCHGSMDVQAFAA+QTIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRGLGRSKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHD+ HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

XP_022928598.1 uncharacterized protein LOC111435456 [Cucurbita moschata]3.4e-7792.26Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPPMQ DHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRES I+QIIQTVP K+YNLTFT+GDARNGCHGSMDVQAFAA+QTIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRGLGRSKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHD+ HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

XP_023544406.1 uncharacterized protein LOC111804000 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-7791.61Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPPMQ DHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRES I+QIIQTVP K+YNLTFT+GDARNGCHGSMDVQAFAA+QTIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FI+RGLGRSKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHD+ HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

XP_038877149.1 uncharacterized protein LOC120069455 [Benincasa hispida]8.9e-7892.26Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPP+QADHISPLPGWIIESLKP+KYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRES I+QII+TVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQ IKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRG+GRSKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHDF HLCG +LDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KW43 Uncharacterized protein3.1e-7692.26Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPP+Q DHISPLPGWIIESLKPVKYIDR HFFVPSGNAAIELVAGRES ISQII T+P KFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRGLG SKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHDF HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

A0A1S3CD87 uncharacterized protein LOC1034995302.6e-7590.32Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPP+Q DHISPLPGWIIESLKPVKY+DR HFFVPSGNAAIELVAGRES ISQII+T+PKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQ +IKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRGLG SKTASLKFQA SV TRITFYSAYYHTKLHDF HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

A0A5A7TJE0 Uncharacterized protein2.6e-7590.32Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPP+Q DHISPLPGWIIESLKPVKY+DR HFFVPSGNAAIELVAGRES ISQII+T+PKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQ +IKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRGLG SKTASLKFQA SV TRITFYSAYYHTKLHDF HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

A0A6J1EPI4 uncharacterized protein LOC1114354561.6e-7792.26Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPPMQ DHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRES I+QIIQTVP K+YNLTFT+GDARNGCHGSMDVQAFAA+QTIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FISRGLGRSKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHD+ HLCG VLDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

A0A6J1HW77 uncharacterized protein LOC1114672228.1e-7790.97Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        SF+NGILLPPMQ DHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRES I+QIIQTVP K+YNLTFT+GDARNGCHGSMDVQAFAA+QTIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        FI+RGLGRSKTASLKFQA SVSTRITFYSAYYHTKLHD+ HLCG +LDNVIVVPA
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41800.1 Protein of unknown function, DUF6422.8e-5363.23Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        +FS GIL+P    D ISPLPGWI+ESLKPVKYIDR HF VP G  A+ELVAGRES I+QII+T+  K Y L+F +GDA+NGCHGSM V+AFA ++  K+ 
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        F+S G G  KT   +F A S  TR+TFYSA+YHTKLHDF HLCG VLD+V+V  A
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA

AT2G41810.1 Protein of unknown function, DUF6421.3e-5065.79Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        +FS GIL+P    D ISPLPGWI+ESLKPVKYID  HF VPSG AAIELVAGRES I+QII+TV  K Y L+F +GDA NGCHGSM V+AFA     KV 
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIV
        F S   G  K     F+A S  TRITFYS +YHTKLHDF HLCG VLDNV V
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIV

AT3G08030.1 Protein of unknown function, DUF6421.3e-4760Show/hide
Query:  SNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVPFI
        + G+LLPP Q D  SPLPGWIIESLK VK+ID  +F VP G+AAIELVAG+ES I+Q+I+T P + Y L+F +GDA+N CHGSM V+AFAA+ T+KVP  
Subjt:  SNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVPFI

Query:  SRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIV
        S G G  KTAS KF+A    TRITF+S +YHTK  D   LCG V+D ++V
Subjt:  SRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIV

AT3G08030.2 Protein of unknown function, DUF6421.3e-4760Show/hide
Query:  SNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVPFI
        + G+LLPP Q D  SPLPGWIIESLK VK+ID  +F VP G+AAIELVAG+ES I+Q+I+T P + Y L+F +GDA+N CHGSM V+AFAA+ T+KVP  
Subjt:  SNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVPFI

Query:  SRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIV
        S G G  KTAS KF+A    TRITF+S +YHTK  D   LCG V+D ++V
Subjt:  SRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIV

AT4G32460.1 Protein of unknown function, DUF6428.1e-4552.9Show/hide
Query:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP
        + S+G+L+PP   D  SPLPGW++ESLK VKYID  HF VP G  A+ELVAG+ES ++Q+++T+P K Y L+F++GDA N C GSM V+AFA + TIKVP
Subjt:  SFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVP

Query:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA
        + S+G G  K +SL+F A S  TR+ FYS +Y  +  DF  LCG V+D+V ++ A
Subjt:  FISRGLGRSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACCCTTAGCTTTTCCAATGGAATTCTCCTTCCTCCAATGCAAGCTGATCACATTTCCCCACTCCCAGGTTGGATCATTGAGTCTCTAAAGCCTGTAAAGTACATTGA
CAGAGGCCATTTCTTTGTCCCTTCAGGGAATGCAGCCATTGAATTGGTTGCAGGAAGAGAAAGTGTCATTTCCCAAATAATCCAAACAGTTCCCAAAAAGTTTTATAATC
TAACCTTCACCATTGGAGATGCTAGAAATGGATGCCATGGCTCCATGGATGTCCAAGCTTTTGCTGCCCAACAAACCATCAAAGTTCCTTTCATTTCTAGAGGCCTTGGA
AGGTCCAAAACTGCAAGTTTGAAGTTCCAAGCAGCTTCAGTTAGCACAAGGATTACATTTTACAGTGCTTATTATCACACCAAGCTTCATGACTTTGACCATTTGTGTGG
CCTTGTCTTGGACAATGTTATAGTTGTTCCAGCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACCCTTAGCTTTTCCAATGGAATTCTCCTTCCTCCAATGCAAGCTGATCACATTTCCCCACTCCCAGGTTGGATCATTGAGTCTCTAAAGCCTGTAAAGTACATTGA
CAGAGGCCATTTCTTTGTCCCTTCAGGGAATGCAGCCATTGAATTGGTTGCAGGAAGAGAAAGTGTCATTTCCCAAATAATCCAAACAGTTCCCAAAAAGTTTTATAATC
TAACCTTCACCATTGGAGATGCTAGAAATGGATGCCATGGCTCCATGGATGTCCAAGCTTTTGCTGCCCAACAAACCATCAAAGTTCCTTTCATTTCTAGAGGCCTTGGA
AGGTCCAAAACTGCAAGTTTGAAGTTCCAAGCAGCTTCAGTTAGCACAAGGATTACATTTTACAGTGCTTATTATCACACCAAGCTTCATGACTTTGACCATTTGTGTGG
CCTTGTCTTGGACAATGTTATAGTTGTTCCAGCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTLSFSNGILLPPMQADHISPLPGWIIESLKPVKYIDRGHFFVPSGNAAIELVAGRESVISQIIQTVPKKFYNLTFTIGDARNGCHGSMDVQAFAAQQTIKVPFISRGLG
RSKTASLKFQAASVSTRITFYSAYYHTKLHDFDHLCGLVLDNVIVVPA