CuGenDBv2

Gene ID	Lsi01G020580
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	chr01:28756579..28782795
RNA-Seq Expression	Lsi01G020580
Synteny	Lsi01G020580
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

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GenBank top hits

e value

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QHH23047.1 hypothetical chloroplast RF19 [Rhodiola dumulosa]

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QNC69931.1 hypothetical chloroplast RF1 [Paris polyphylla var. yunnanensis]

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QNC70189.1 hypothetical chloroplast RF1 [Paris polyphylla var. yunnanensis]

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QYF08241.1 Ycf1 [Paris luquanensis]

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A0A1L6V1P4 Protein TIC 214

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A0A7G6KPM9 Protein TIC 214

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SwissProt top hits

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A0A393 Protein TIC 214

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A6MM95 Protein TIC 214

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Q33BW4 Protein TIC 214

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Q8S8U2 Protein TIC 214

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Arabidopsis top hits

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AT2G07739.1 Ycf1 protein

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63.38

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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ATGAAAGGTTCTTCAGCTAGATGGAGTTTGGTAGAAAATACTAGCAGAAGAAGCTTGGAGAACGAGCTCCTCGAATACAATAGTGGGGCCCCACATAATGACGATGAGTT
TCAGGATATGGTTATTGAATATTGCTTAAATTATATGAAATTTTCTAATAGCAACCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCATCGTTGTGGTTGGACTCT
ATTATGGATTTTTTACCACATTCTCTATAGGGTCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCAAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAAAAAAAGCCCAAGCACTGTTTATCA
GAAGGATCAATGATGAATCAAGTTCCTTTGCCTTTGCAAGACTTGCAATTTTCTCACAAGCCACATCCAATGAGGGAGAATTCAGTATATCATCAAATTTGGCCTGTGCA
GTATCCAATGTCTCCACATGTTCTAATGTTCGATCGTAAGCACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKGSSARWSLVENTSRRSLENELLEYNSGAPHNDDEFQDMVIEYCLNYMKFSNSNLVSLCMKIINSVIVVVGLYYGFFTTFSIGSSYLFLLQARVMEEGTEKKKPKHCLS
EGSMMNQVPLPLQDLQFSHKPHPMRENSVYHQIWPVQYPMSPHVLMFDRKH

Lsi01G020580 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome