; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G000720 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G000720
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionMini zinc finger
Genome locationchr02:631833..632138
RNA-Seq ExpressionLsi02G000720
SyntenyLsi02G000720
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVI9 ZF-HD dimerization-type domain-containing protein1.2e-4190.29Show/hide
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A0A1S3B557 mini zinc finger protein 13.2e-4291.26Show/hide
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A0A5A7SZK7 Mini zinc finger protein 13.2e-4291.26Show/hide
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A0A5D3BJJ4 Mini zinc finger protein 13.2e-4291.26Show/hide
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A0A6J1K9G7 mini zinc finger protein 14.2e-3479.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 15.3e-1853.57Show/hide
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Q0J5F8 Mini zinc finger protein 42.5e-2071.19Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 34.7e-2763.37Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 15.1e-2967.33Show/hide
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 23.4e-2562.75Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14440.1 homeobox protein 314.1e-1856.72Show/hide
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AT1G18835.1 mini zinc finger3.4e-2863.37Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 13.6e-3067.33Show/hide
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AT2G02540.1 homeobox protein 213.7e-1962.5Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 22.4e-2662.75Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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