CuGenDBv2

Gene ID	Lsi02G000890
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr02:743868..745766
RNA-Seq Expression	Lsi02G000890
Synteny	Lsi02G000890
Gene Ontology terms	GO:0016310 - phosphorylation (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAE8652514.1 hypothetical protein Csa_014185 [Cucumis sativus]

7.9e-85

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS
        MAGDESRSVFDW +FP      S   SMVVIRDS P DDFSVFPPSKHENLQPPS++EDER S VSFQSNSPSSSFRSS SSSSFSSFSFSDDE SHPHS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS

Query:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS
        PKPSD QI+K + ASRWL  GVQILR RITAMA       AFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLR+S+EQLKMMIKEKDEKI+ L+QQVAQLNRS
Subjt:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS

Query:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV
        L+LAQQKVLPSNWKMKQDG++
Subjt:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV

KAG6607465.1 hypothetical protein SDJN03_00807, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.4e-81

77.97

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENF-----------PQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS
        MAG E+RSVFDWENF            QQ KI+ +EWSMV IRDSLP DDFSVFPPS HENL  PSIE +ERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENF-----------PQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS

Query:  FSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDE
         SDDE SHP SP PSDCQIRKS+AASRW+ FGVQILR+RI AM        ARRTA WLFSPAGRIGLLVTL WLYKR R+RRLR STEQLKMMIKEKD+
Subjt:  FSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDE

Query:  KINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN
        KI+QLLQQVAQLNRS+LLAQQKVLPSN
Subjt:  KINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN

XP_008444586.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487835 [Cucumis melo]

4.2e-86

82.35

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS
        MA DESRSVFDW N P     +S   SMVVIRDS P DDFSVFPPSKHENLQPPSI EDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDE SHPHS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS

Query:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS
        PKPS  QI+K +  SRWL +GVQILR RITAMA       AFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLR+ST QLKMM+KEKDEKI+QL+QQVAQLNRS
Subjt:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS

Query:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV
        L+LAQQKVLPSNWKMKQDGSV
Subjt:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV

XP_011649918.1 uncharacterized protein LOC105434678 [Cucumis sativus]

3.5e-85

81.45

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS
        MAGDESRSVFDW +FP      S   SMVVIRDS P DDFSVFPPSKHENLQPPS++EDER S VSFQSNSPSSSFRSS SSSSFSSFSFSDDE SHPHS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS

Query:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS
        PKPSD QI+K + ASRWL  GVQILR RITAMA       AFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLR+S+EQLKMMIKEKDEKI+ L+QQVAQLNRS
Subjt:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS

Query:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV
        L+LAQQKVLPSNWKMKQDG+V
Subjt:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV

XP_038894063.1 uncharacterized protein LOC120082810 [Benincasa hispida]

5.6e-99

90.78

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS
        MA DESRSVFDWENF QQRKIES+EWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENL PP +EE+ERGSPVSFQSNSPS SFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS

Query:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRSLLLA
        PKPS+ QIRKS+AASRWL F +QIL +RITAMARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKI+QLLQQVAQLNRSLLL 
Subjt:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRSLLLA

Query:  QQKVLPSNWKMKQDGSV
        QQ+VLPSNWKMKQDG V
Subjt:  QQKVLPSNWKMKQDGSV

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LVK1 Uncharacterized protein

1.7e-85

81.45

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS
        MAGDESRSVFDW +FP      S   SMVVIRDS P DDFSVFPPSKHENLQPPS++EDER S VSFQSNSPSSSFRSS SSSSFSSFSFSDDE SHPHS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS

Query:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS
        PKPSD QI+K + ASRWL  GVQILR RITAMA       AFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLR+S+EQLKMMIKEKDEKI+ L+QQVAQLNRS
Subjt:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS

Query:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV
        L+LAQQKVLPSNWKMKQDG+V
Subjt:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV

A0A1S3BA65 uncharacterized protein LOC103487835

2.0e-86

82.35

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS
        MA DESRSVFDW N P     +S   SMVVIRDS P DDFSVFPPSKHENLQPPSI EDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDE SHPHS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHS

Query:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS
        PKPS  QI+K +  SRWL +GVQILR RITAMA       AFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLR+ST QLKMM+KEKDEKI+QL+QQVAQLNRS
Subjt:  PKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAMA----RRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRS

Query:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV
        L+LAQQKVLPSNWKMKQDGSV
Subjt:  LLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV

A0A6J1C560 uncharacterized protein LOC111008581

1.5e-81

77.09

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENFPQQ-----------RKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS
        MAGDE+RSVFDWENFP             RKIE +EWSMVVI DS PN+DFSVFPPS HENL  PS EEDERGSPVSFQS+SPS+SFRSSQSSSSFSSFS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENFPQQ-----------RKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS

Query:  FSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDE
        FSDDE SH HSPKPSDCQIRKS+AASRW+ +GVQILR RITAM        ARRTAFW+FSPAGRI L+VTL WLYKRAR+RRLRQS+EQL+M+IKEKD+
Subjt:  FSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDE

Query:  KINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN
        KI+QLLQQVAQLN  LLLAQQKVLPSN
Subjt:  KINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN

A0A6J1GB64 uncharacterized protein LOC111452392

2.6e-81

77.53

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENF-----------PQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS
        MAG E+RSVFDWENF            QQ KI+ +EWSMV IRDSLP DDFSVFPPS HENL  PSIE +ERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENF-----------PQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS

Query:  FSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDE
         SDDE SHP SP PSDCQIRKS+AAS+W+ FGVQILR+RI AM        ARRTA WLFSPAGRIGLLVTL WLYKR R+RRLR STEQLKMMIKEKD+
Subjt:  FSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDE

Query:  KINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN
        KI+QLLQQVAQLNRS+LLAQQKVLPSN
Subjt:  KINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN

A0A6J1K6L4 uncharacterized protein LOC111492777

9.1e-79

75.22

Show/hide

Query:  MAGDESRSVFDWENF--------------PQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFS
        +AG E+RSVFDWENF               QQ KI+ +EWSMV IRDSLP DDFSVFPPS HENL  PSIE +ERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFS
Subjt:  MAGDESRSVFDWENF--------------PQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFS

Query:  SFSFSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKE
        SFS SDDE SHP SP PSD QIRKS+AASRW+ FGVQILR+RI AM        ARRTA WLFSPAGRIGLL+TL WLYKR R+RRLR STEQLKMMIKE
Subjt:  SFSFSDDEISHPHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRTRITAM--------ARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKE

Query:  KDEKINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN
        KD+KI+QLLQQVAQLNRS+L AQQKVLPSN
Subjt:  KDEKINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G61360.1 unknown protein

5.4e-07

30.62

Show/hide

Query:  GDESRSV--FDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDS--LPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPS-SSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISH
        G+E R +   D  N PQ        + MV +R+S     DD ++FPP  HENL    +E     S  S  S+  S SSF  S S   F     S  + S 
Subjt:  GDESRSV--FDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDS--LPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPS-SSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISH

Query:  PHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRT--RITAMARRTAFWLFSPAGR--IGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTE----QLKMMIKEKDEKINQLLQQ
             P    I   I    W     +++     +     R +   FS   R    ++V  LW +KR R RR  +  E     L+  IKE+DE+I QLL Q
Subjt:  PHSPKPSDCQIRKSIAASRWLFFGVQILRT--RITAMARRTAFWLFSPAGR--IGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTE----QLKMMIKEKDEKINQLLQQ

Query:  VAQLNRSLL
        + Q+N  L+
Subjt:  VAQLNRSLL

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGGTGATGAATCCAGATCGGTTTTCGACTGGGAAAACTTCCCTCAACAGCGGAAAATCGAATCCAGAGAATGGTCAATGGTGGTGATTAGGGATTCTCTTCCCAA
TGATGACTTCTCCGTTTTCCCACCTTCAAAACACGAGAATCTACAGCCCCCATCGATTGAAGAAGACGAACGAGGAAGCCCAGTTTCATTTCAATCCAATTCGCCATCAT
CGTCGTTTAGGTCGTCCCAATCATCCTCATCCTTCTCGTCTTTCTCATTTTCTGATGACGAGATTTCACATCCACACTCACCGAAGCCATCTGATTGTCAAATCCGAAAA
TCCATAGCGGCTTCTAGGTGGCTGTTTTTTGGGGTTCAGATTCTACGCACACGGATTACTGCAATGGCGCGTAGAACGGCATTTTGGTTGTTTTCCCCTGCAGGAAGGAT
TGGGTTATTGGTGACTCTTTTGTGGCTGTACAAGAGAGCTCGTAAGCGCCGTTTACGTCAAAGTACTGAGCAATTAAAGATGATGATCAAGGAGAAAGATGAGAAAATCA
ATCAACTACTGCAACAAGTTGCACAATTGAATCGATCACTGTTATTAGCGCAACAGAAAGTACTGCCTTCAAATTGGAAGATGAAACAAGATGGTAGTGTTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATGGACTGATGGAGCTTCTTTTGTTTGGGCCTTCTCTCATGGACATGGACATTTAGGGCACCAAAAAAGCAAAGATCTTGAAGAGGAATTTTGGATTTGCTGTAATTTCC
CTTAGTTCTAATGGATAGACTCCACCAAAATCCACCAATTGGAACTTCAAACTTTCAGGAGTTCCTTCCTTCCTCTTCTGTTTGTTGCATGAACAGCGCAGCCCAAAGCC
TTTTTTTTGCCTTCTGATTCTGAAATTTCTCCTCCATTTCTCCTCCATTTCTTATTTGCTTCTATTATCTATGTCGAAACAGTAATTGGGTCACCGTGTTAATGGCGGGT
GATGAATCCAGATCGGTTTTCGACTGGGAAAACTTCCCTCAACAGCGGAAAATCGAATCCAGAGAATGGTCAATGGTGGTGATTAGGGATTCTCTTCCCAATGATGACTT
CTCCGTTTTCCCACCTTCAAAACACGAGAATCTACAGCCCCCATCGATTGAAGAAGACGAACGAGGAAGCCCAGTTTCATTTCAATCCAATTCGCCATCATCGTCGTTTA
GGTCGTCCCAATCATCCTCATCCTTCTCGTCTTTCTCATTTTCTGATGACGAGATTTCACATCCACACTCACCGAAGCCATCTGATTGTCAAATCCGAAAATCCATAGCG
GCTTCTAGGTGGCTGTTTTTTGGGGTTCAGATTCTACGCACACGGATTACTGCAATGGCGCGTAGAACGGCATTTTGGTTGTTTTCCCCTGCAGGAAGGATTGGGTTATT
GGTGACTCTTTTGTGGCTGTACAAGAGAGCTCGTAAGCGCCGTTTACGTCAAAGTACTGAGCAATTAAAGATGATGATCAAGGAGAAAGATGAGAAAATCAATCAACTAC
TGCAACAAGTTGCACAATTGAATCGATCACTGTTATTAGCGCAACAGAAAGTACTGCCTTCAAATTGGAAGATGAAACAAGATGGTAGTGTTTAGCTTGTATCACAGAGA
GAGGCAGCAAGAAATATTGCAGCTATTCTGAATGCCTCGCACCGTCAGCGCGAATTCTTGTTCGGATTTATTATACTATAGATGATATTCCAGTAGCAGCAGATTGGAAC
GGAGACAAAAGCTCCTGCCTTTTGCAGTGCGTTGAAGCACAGAGCAAGACTATAAGACACCATCTACACCTCAATCGAGTGGAATCTGTTTGTGCTGCACAAAAACAGAT
TATCAGTTCACAGCTGGAATGTATACAGTTGATTTGTTTTGATTTTTTCAGTATTTGTTCCAATATAAATGTGCGATTAAAAGTCTTTATATTGTCAGTCATTTATCAAC
TTGGTTTACTGACTGGGAAGCTTATTATTATGCACCAGTATATTGGATTTGTAAATAGATATGATTTTCCTGTAATGTTAGACTAAACTAAGTACTTCCTGAAGAGCATG
CTTTTACTAAAAGCTGATCGATAGAAGCACAAACAAAATATGAGACTTTAAGAAGA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAGDESRSVFDWENFPQQRKIESREWSMVVIRDSLPNDDFSVFPPSKHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDEISHPHSPKPSDCQIRK
SIAASRWLFFGVQILRTRITAMARRTAFWLFSPAGRIGLLVTLLWLYKRARKRRLRQSTEQLKMMIKEKDEKINQLLQQVAQLNRSLLLAQQKVLPSNWKMKQDGSV

Lsi02G000890 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome