; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G002120 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G002120
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X2
Genome locationchr02:1751250..1762307
RNA-Seq ExpressionLsi02G002120
SyntenyLsi02G002120
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137488.1 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X2 [Cucumis sativus]2.7e-19094.49Show/hide
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XP_008461518.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X2 [Cucumis melo]5.6e-18893.66Show/hide
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XP_011650643.1 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X1 [Cucumis sativus]6.6e-18994.23Show/hide
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XP_038894453.1 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X1 [Benincasa hispida]8.3e-20096.23Show/hide
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XP_038894454.1 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X2 [Benincasa hispida]3.4e-20196.49Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQF5 RING-type domain-containing protein1.3e-19094.49Show/hide
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A0A1S3CER0 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X16.7e-18793.41Show/hide
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A0A1S3CET5 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X22.7e-18893.66Show/hide
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A0A1S3CEY2 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X31.5e-18393.31Show/hide
Query:  MKFRKPKSHLNHLNKPISESDPNPSSIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSII-TNRKKNNFSSATLRGLGCTTAASQQVSVPAVIRT
        MK R+P+S L+HLN+PISESDPNP SIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSG NESLPSSII TNRKKNNFSSATLRGLGCTTAASQQVSVPAVIRT
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        TLLFLDSDSDL TARSLELSR+RYYRHVRHPSPDGLAE IMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKM
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A0A5D3BIX1 E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 isoform X22.7e-18893.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49500 E3 ubiquitin-protein ligase MBR21.4e-2435.89Show/hide
Query:  GPGIGFSADAAASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQRERSCLGRRTVNPETLLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGG
        GP +  S++ AA+     +R H S + +  L  + +R+   L  R +       L +D+D    R+  +S  R          +   E  M    L+  G
Subjt:  GPGIGFSADAAASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQRERSCLGRRTVNPETLLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGG

Query:  RFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRK-CSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQW
          ++HD+ R++RLDVDNMSYEELL LGERIG VSTGL E+ I + +++ K       ++   S  D + C +CQE+Y   D++G L CGH +H  C+KQW
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Query:  LAQKNTCPV
        L  KN CP+
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Q5QLR5 Probable E3 ubiquitin-protein ligase ZFP11.5e-1835.62Show/hide
Query:  LLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKP
        +LF +S+          L+    +R++R   P+  A IM F     +    D H   R++RLD+D+M+YEELL L E+IG V+TGL +  I   ++    
Subjt:  LLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKP

Query:  LVVNELTTHLLSQMDRK---CSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV
        +  +   ++  S+   +   C ICQE+Y+  + +G L+CGH YH  CIKQWL  KN CP+
Subjt:  LVVNELTTHLLSQMDRK---CSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV

Q7XTV7 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HIP14.4e-2648.28Show/hide
Query:  SLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLL--SQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYH
        S+  GG  D+HD+ R++RLD+DNMSYEELL L ERIG+VSTGL E+E+ + +++ K       ++  L  S  +  C ICQE+Y   D++G L+CGH +H
Subjt:  SLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLL--SQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYH

Query:  IHCIKQWLAQKNTCPV
        + C++QWL  KNTCP+
Subjt:  IHCIKQWLAQKNTCPV

Q9FMM4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A2.8e-2545.97Show/hide
Query:  LAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRK-CSICQEDYEPDDEMGK
        L ++M+   S+L  G    HD++R++RLDVDNMSYEELL L ERIG V TG+ E+ I   +++ K        ++  S  D + C +CQE+Y   ++MG 
Subjt:  LAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRK-CSICQEDYEPDDEMGK

Query:  LECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV
        LECGH +H  CIK+WL QKN CP+
Subjt:  LECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV

Q9ZQF9 E3 ubiquitin-protein ligase MBR18.8e-2743.75Show/hide
Query:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ
        R+  +S  R   H      +   E  M    L+  G  D+HD+ RE+RLDVDNMSYEELL LGERIG VSTGL E+ I + +++ K    +  +  L   
Subjt:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ

Query:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV
        ++  C ICQE+Y   D +G L+CGH +H  CIKQW+  KN CP+
Subjt:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17970.1 RING/U-box superfamily protein2.3e-6241.95Show/hide
Query:  TSTVGEHMKFRKPKSH-LNHLNKPISESDPNPSSIP-SIIQSTR-CKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIITNRKKNNFSSATLRGLGC---TTAA
        ++T+GEH++ R+ ++  + HL+   ++ DP  S +   I Q  R C S +SS     F    TS  NES         +K  + +++ RG+GC     AA
Subjt:  TSTVGEHMKFRKPKSH-LNHLNKPISESDPNPSSIP-SIIQSTR-CKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIITNRKKNNFSSATLRGLGC---TTAA

Query:  SQQVSVPAVIRTSADWEKKKTKKKKQKNSKNKTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQ
        +Q+VSVP+VIR SAD + +  K KK+K  K+K ++     S+   +  I S    D  DVWC PG+GFS DA    SVD    R   S R KID++    
Subjt:  SQQVSVPAVIRTSADWEKKKTKKKKQKNSKNKTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQ

Query:  RE---RSCLGRRTVNPETLL--FLDSDSDLPTARSLE--LSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGER
              S L  R +N ET      +SDS   T+   E  +  SR   H+    PD L E+ M Q+  +MG   D  D + ELRLDVD+MSYE+LLELG+R
Subjt:  RE---RSCLGRRTVNPETLL--FLDSDSDLPTARSLE--LSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGER

Query:  IGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV
        IG+V+TGLKE EI RC+ K+KP V + L       +DRKCSICQ++YE +DE+G+L CGHS+H+HC+KQWL++KN CPV
Subjt:  IGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV

AT1G45180.1 RING/U-box superfamily protein5.1e-3044.7Show/hide
Query:  HVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDY
        H+R      L ++M+   S+++G   D+HD++R++RLDVDNM+YEELL L ERIG V TGL E+ I   +++ K       ++   SQ    C +CQE+Y
Subjt:  HVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDY

Query:  EPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV
        + ++E+G+LECGH +H  CIK+WL QKN CP+
Subjt:  EPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV

AT1G73760.1 RING/U-box superfamily protein3.1e-7545.36Show/hide
Query:  PIATHTSTVGEHMKFRKPKSHLNHLNKPISESD----PNPSSIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIITNRKKNNFSSATLRGLGCT
        P ++ ++T+G+HM+ ++P++H N    PIS +D    P PS +         KS +SS  L              LP    T +KK N  +A+ RGLGCT
Subjt:  PIATHTSTVGEHMKFRKPKSHLNHLNKPISESD----PNPSSIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIITNRKKNNFSSATLRGLGCT

Query:  TAASQQVSVPAVIRTSADWEKKKTK-KKKQKNSKNKTQQGIVDAS--HFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVA---RRHASGRG
        T+ASQQVSVPAVIR+SADW+    K KK +K +KNK        S       S  +S +C    DVWCGPG+GFS DA    S+D VV+   RR+   R 
Subjt:  TAASQQVSVPAVIRTSADWEKKKTK-KKKQKNSKNKTQQGIVDAS--HFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADA--AASVDCVVA---RRHASGRG

Query:  KIDLEKITQRER-------SCLGRRTVNPETLLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSY
        KID +K             S L RR++N E+  + DSDS   T+R+ +    RY+RH+R P PDGLAE+MM Q+  +MGG     DQFR++RL+VDNM+Y
Subjt:  KIDLEKITQRER-------SCLGRRTVNPETLLFLDSDSDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSY

Query:  EELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV
        E+LLELGERIGHV+TGL E +I  C+RK+KP    + TT      DRKC ICQ++YE  DE+G+L CGH +HI C+ QWL +KN+CPV
Subjt:  EELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV

AT2G15530.4 RING/U-box superfamily protein4.8e-2838.37Show/hide
Query:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ
        R+  +S  R   H      +   E  M    L+  G  D+HD+ RE+RLDVDNMSYEELL LGERIG VSTGL E+ I + +++ K    +  +  L   
Subjt:  RSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQ

Query:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPVYFIAFLHEQKHSFICVKLSYLLIMNMMG
        ++  C ICQE+Y   D +G L+CGH +H  CIKQW+  KN CP++   F  E++     +++  +++   +G
Subjt:  MDRKCSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPVYFIAFLHEQKHSFICVKLSYLLIMNMMG

AT4G31450.1 RING/U-box superfamily protein1.1e-2947.62Show/hide
Query:  EIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIR----KMKPLVVNELT-THLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEM
        ++++ ++ LL+GG    HDQ R++RLD+DNMSYEELL L ERIG VST L E+ I +C++    +MKPL    +T +   ++ D KCSICQE+Y   DE+
Subjt:  EIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIR----KMKPLVVNELT-THLLSQMDRKCSICQEDYEPDDEM

Query:  GKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV
        G+L C H+YH+ C+++WL  K+ CP+
Subjt:  GKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTATTGCTACACACACTTCCACAGTTGGTGAACACATGAAATTCAGAAAACCCAAGAGCCATTTGAACCATTTGAACAAACCCATTTCAGAATCAGATCCAAACCC
ATCATCAATCCCTTCTATAATTCAATCCACTCGCTGCAAATCCACCATTTCTTCTCTTCTGCTCTCTACTTTTTCCAATAATACAACTAGCGGTGGAAATGAATCTTTAC
CCTCTTCCATTATCACCAACAGGAAGAAGAACAACTTTTCTTCTGCAACTCTCAGGGGACTCGGTTGTACCACCGCCGCTTCTCAGCAGGTATCTGTCCCGGCTGTAATT
CGAACTTCAGCGGATTGGGAAAAGAAGAAGACGAAGAAAAAAAAGCAGAAGAATTCCAAGAACAAAACCCAACAAGGAATTGTTGATGCCTCTCATTTTCACCCTAATTC
GAATATCAACTCTGCTAGCTGTTTAGACGCTCAAGATGTTTGGTGTGGCCCTGGAATTGGATTCTCTGCTGATGCGGCTGCTTCTGTGGATTGTGTTGTTGCTAGAAGAC
ATGCTTCTGGAAGGGGGAAAATAGATTTGGAGAAGATAACTCAGAGGGAGCGTTCTTGTTTAGGAAGGCGAACAGTGAACCCCGAGACCCTCTTATTTTTGGATTCTGAT
TCTGATCTTCCAACTGCTCGATCATTGGAACTGTCTCGGAGTCGGTATTATCGCCATGTTCGTCATCCATCCCCCGATGGCCTTGCTGAGATTATGATGTTTCAGAGCAG
TTTGCTGATGGGTGGAAGGTTCGATCTACACGACCAATTTAGGGAATTACGACTTGACGTCGATAACATGTCGTATGAGGAGCTGCTTGAACTCGGCGAAAGGATCGGCC
ATGTCAGTACCGGGCTGAAAGAAGACGAGATAGGAAGATGTATTAGAAAAATGAAGCCCCTTGTTGTGAATGAGCTAACAACTCATTTGTTATCTCAAATGGATAGGAAG
TGCAGCATCTGTCAGGAGGACTATGAACCAGATGATGAAATGGGTAAGCTGGAATGTGGGCACAGCTACCATATACACTGTATAAAACAGTGGCTTGCACAGAAGAATAC
GTGCCCTGTCTATTTCATTGCCTTTTTACATGAGCAAAAGCATTCGTTCATTTGTGTGAAGCTTTCCTATCTGCTTATAATGAATATGATGGGCGCCATTTTCTTGTTCC
TCAGTTCTCTAGAGGTTTCATGTTATGGTGATTTTGGATTGACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGAATCATGCCTATTGCTACACACACTTCCACAGTTGGTGAACACATGAAATTCAGAAAACCCAAGAGCCATTTGAACCATTTGAACAAACCCATTTCAGAATCAGATC
CAAACCCATCATCAATCCCTTCTATAATTCAATCCACTCGCTGCAAATCCACCATTTCTTCTCTTCTGCTCTCTACTTTTTCCAATAATACAACTAGCGGTGGAAATGAA
TCTTTACCCTCTTCCATTATCACCAACAGGAAGAAGAACAACTTTTCTTCTGCAACTCTCAGGGGACTCGGTTGTACCACCGCCGCTTCTCAGCAGGTATCTGTCCCGGC
TGTAATTCGAACTTCAGCGGATTGGGAAAAGAAGAAGACGAAGAAAAAAAAGCAGAAGAATTCCAAGAACAAAACCCAACAAGGAATTGTTGATGCCTCTCATTTTCACC
CTAATTCGAATATCAACTCTGCTAGCTGTTTAGACGCTCAAGATGTTTGGTGTGGCCCTGGAATTGGATTCTCTGCTGATGCGGCTGCTTCTGTGGATTGTGTTGTTGCT
AGAAGACATGCTTCTGGAAGGGGGAAAATAGATTTGGAGAAGATAACTCAGAGGGAGCGTTCTTGTTTAGGAAGGCGAACAGTGAACCCCGAGACCCTCTTATTTTTGGA
TTCTGATTCTGATCTTCCAACTGCTCGATCATTGGAACTGTCTCGGAGTCGGTATTATCGCCATGTTCGTCATCCATCCCCCGATGGCCTTGCTGAGATTATGATGTTTC
AGAGCAGTTTGCTGATGGGTGGAAGGTTCGATCTACACGACCAATTTAGGGAATTACGACTTGACGTCGATAACATGTCGTATGAGGAGCTGCTTGAACTCGGCGAAAGG
ATCGGCCATGTCAGTACCGGGCTGAAAGAAGACGAGATAGGAAGATGTATTAGAAAAATGAAGCCCCTTGTTGTGAATGAGCTAACAACTCATTTGTTATCTCAAATGGA
TAGGAAGTGCAGCATCTGTCAGGAGGACTATGAACCAGATGATGAAATGGGTAAGCTGGAATGTGGGCACAGCTACCATATACACTGTATAAAACAGTGGCTTGCACAGA
AGAATACGTGCCCTGTCTATTTCATTGCCTTTTTACATGAGCAAAAGCATTCGTTCATTTGTGTGAAGCTTTCCTATCTGCTTATAATGAATATGATGGGCGCCATTTTC
TTGTTCCTCAGTTCTCTAGAGGTTTCATGTTATGGTGATTTTGGATTGACTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPIATHTSTVGEHMKFRKPKSHLNHLNKPISESDPNPSSIPSIIQSTRCKSTISSLLLSTFSNNTTSGGNESLPSSIITNRKKNNFSSATLRGLGCTTAASQQVSVPAVI
RTSADWEKKKTKKKKQKNSKNKTQQGIVDASHFHPNSNINSASCLDAQDVWCGPGIGFSADAAASVDCVVARRHASGRGKIDLEKITQRERSCLGRRTVNPETLLFLDSD
SDLPTARSLELSRSRYYRHVRHPSPDGLAEIMMFQSSLLMGGRFDLHDQFRELRLDVDNMSYEELLELGERIGHVSTGLKEDEIGRCIRKMKPLVVNELTTHLLSQMDRK
CSICQEDYEPDDEMGKLECGHSYHIHCIKQWLAQKNTCPVYFIAFLHEQKHSFICVKLSYLLIMNMMGAIFLFLSSLEVSCYGDFGLT