| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG0463006.1 hypothetical protein HPP92_021482 [Vanilla planifolia] | 1.6e-45 | 95.92 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
M+SGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVG+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNIS+VGELDEELD+NLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_004137538.1 sm-like protein LSM8 [Cucumis sativus] | 4.3e-46 | 98.98 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MASGPGL+SLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_011621662.1 sm-like protein LSM8 isoform X1 [Amborella trichopoda] | 9.5e-46 | 95.92 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
M+SGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVG+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNIS++GELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_022155134.1 sm-like protein LSM8 [Momordica charantia] | 1.9e-46 | 100 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_042494798.1 sm-like protein LSM8 [Macadamia integrifolia] | 5.6e-46 | 97.96 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
M+SGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVG+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LT86 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.1e-46 | 98.98 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MASGPGL+SLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A1S3ATI1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.1e-46 | 98.98 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MASGPGL+SLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1DPC5 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 9.3e-47 | 100 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1GT46 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 9.3e-47 | 100 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1K221 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 9.3e-47 | 100 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O95777 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-30 | 63.04 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q3ZCE0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-30 | 63.04 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q5RCP3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-30 | 63.04 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q6ZWM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.6e-30 | 63.04 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
LE+ +++T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q8VYI0 Sm-like protein LSM8 | 1.3e-42 | 85.71 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G19120.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.2e-11 | 43.06 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
L + +D+ + V+ DGR ++G+L+ FDQ N +L+E++ERV + + LGLYIIRG+N+ ++GELD E
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
| AT1G65700.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 9.5e-44 | 85.71 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.2 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 9.5e-44 | 85.71 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.3 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-37 | 59.57 | Show/hide |
Query: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQL
MA+ GLE+LVDQ ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STK EGVQQ
Subjt: MASGPGLESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQL
Query: VLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: VLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT3G14080.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 4.7e-11 | 43.06 | Show/hide |
Query: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
L S +D+ + V+ DGR ++G L+ FDQ N +L+ + ERV E + LGLY+IRG+N+ ++GELD E
Subjt: LESLVDQTISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
