; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G003820 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G003820
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionGlutaredoxin
Genome locationchr02:3292955..3295021
RNA-Seq ExpressionLsi02G003820
SyntenyLsi02G003820
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0015038 - glutathione disulfide oxidoreductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055240.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold80G00820 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-4667.97Show/hide
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NP_001274139.1 glutaredoxin [Cucumis sativus]8.4e-5270.25Show/hide
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XP_008438572.1 PREDICTED: glutaredoxin [Cucumis melo]2.1e-5068.99Show/hide
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XP_022137238.1 glutaredoxin-C1 [Momordica charantia]2.3e-4967.72Show/hide
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XP_038894148.1 glutaredoxin [Benincasa hispida]5.2e-5473.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AWQ0 glutaredoxin1.0e-5068.99Show/hide
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A0A5A7UJ77 Glutaredoxin domain-containing protein6.7e-4767.97Show/hide
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A0A5D3BJ77 Glutaredoxin domain-containing protein6.7e-4767.97Show/hide
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A0A6J1C9R3 glutaredoxin-C11.1e-4967.72Show/hide
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U3RGD2 Glutaredoxin4.1e-5270.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81187 Glutaredoxin2.7e-2948.15Show/hide
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        +A+ +A+++++S+ VVVFSKT+C YC+ VK+LL +LGA++KVIEL+ +                                 SDG  +Q+ALAEWTGQ TV
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        PNVFIGGKHIGGCD  T  H +G+L+PLLTEAGA+
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P55143 Glutaredoxin4.5e-3251.85Show/hide
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        +A+ + K++++S+ VVVFSKTYC YC+ VK+LL +LGA+YKV+EL+                                   SDG  IQ+ALAEWTGQ TV
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        PNVFIGGKHIGGCD+ T KH +GQLVPLLTEAGA+
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Q6K953 Glutaredoxin-C4, chloroplastic6.1e-2948.05Show/hide
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        SS     E+LE      +AL++AK+I+ S PVVVFSKTYC +C+RVK LL  L A YK +EL+                                 V SD
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        G  +QSALA+WTGQ TVP VFI GKHIGGCD     H  G LVPLLTEAGAIA+
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Q8L8T2 Glutaredoxin-C19.0e-4155.06Show/hide
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        MGS FS N++SKEE+E+ +N+AK+I+++ PVVVFSKTYCGYC RVK+LLT+LGA +KV+EL++                                  SDG
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          IQSAL+EWTGQTTVPNVFI G HIGGCD V E + +G+LVPLLTEAGAIA N +QL
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Q9FNE2 Glutaredoxin-C22.2e-3151.43Show/hide
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        +A+ +AK+I+ S+ VVVFSKTYC YC RVKELL +LGA++K +EL+                                   SDG  IQS LAEWTGQ TV
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        PNVFIGG HIGGCDA +  H  G+LVPLLTEAGAIA   A
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein2.5e-1737.06Show/hide
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        SS+  S   LE      K  +  +PVVV+SKT+C Y S+VK L   L     V+EL+Q                                + S+G  +Q+
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         L + TGQ TVPNVFIGGKHIGGC    + H+KG+L  +L EA
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AT2G20270.2 Thioredoxin superfamily protein3.8e-1839.73Show/hide
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        SS+  S   LE      K  +  +PVVV+SKT+C Y S+VK L   L     V+EL+Q   L    L H++ +    K              F  S+G  
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        +Q+ L + TGQ TVPNVFIGGKHIGGC    + H+KG+L  +L EA
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein1.6e-3251.43Show/hide
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        +A+ +AK+I+ S+ VVVFSKTYC YC RVKELL +LGA++K +EL+                                   SDG  IQS LAEWTGQ TV
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        PNVFIGG HIGGCDA +  H  G+LVPLLTEAGAIA   A
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AT5G40370.2 Glutaredoxin family protein7.6e-2750.81Show/hide
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        + SKTYC YC RVKELL +LGA++K +EL+                                   SDG  IQS LAEWTGQ TVPNVFIGG HIGGCDA 
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        +  H  G+LVPLLTEAGAIA   A
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein6.4e-4255.06Show/hide
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        MGS FS N++SKEE+E+ +N+AK+I+++ PVVVFSKTYCGYC RVK+LLT+LGA +KV+EL++                                  SDG
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Query:  DTIQSALAEWTGQTTVPNVFIGGKHIGGCDAVTEKHHKGQLVPLLTEAGAIASNPAQL
          IQSAL+EWTGQTTVPNVFI G HIGGCD V E + +G+LVPLLTEAGAIA N +QL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGTCGTGGTTCAGCTCAAACAAATTGAGTAAAGAAGAGCTGGAATTGGCGCTTAACGAAGCCAAGAAGATAATCACATCTGACCCTGTTGTTGTTTTCAGTAAGAC
TTATTGTGGGTATTGTTCTCGTGTCAAGGAGCTTCTCACACGGCTTGGAGCTAGGTATAAGGTCATTGAATTGAACCAAAAAAGTATTCTTTTACTAAAACATAATCTTG
TTATATCTCGAAAGCTGAAAATTGAATTGACTGATGAGATTGAAATTTTAAAAGGAGATGAGTTTGTTTCAAGTGATGGAGATACAATTCAGTCAGCTTTAGCGGAGTGG
ACGGGCCAAACCACGGTGCCTAATGTGTTTATCGGAGGAAAGCACATCGGTGGTTGCGATGCGGTTACAGAGAAACACCACAAAGGTCAGTTGGTGCCACTTCTAACTGA
GGCTGGTGCCATTGCCAGTAACCCTGCTCAGCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTACTCTTTCAGCAAGTGAAATTGACATCAAAATTCGTTTCTTTTGACATTAAAATTGTTCTTCTCTATTTCCAAATTCATACCCATTTCTTAATAGCAAAGAATCCT
CGAAACTCTCCCGTTTAATCTTATTAAGCGAGGTCATGGGGTCGTGGTTCAGCTCAAACAAATTGAGTAAAGAAGAGCTGGAATTGGCGCTTAACGAAGCCAAGAAGATA
ATCACATCTGACCCTGTTGTTGTTTTCAGTAAGACTTATTGTGGGTATTGTTCTCGTGTCAAGGAGCTTCTCACACGGCTTGGAGCTAGGTATAAGGTCATTGAATTGAA
CCAAAAAAGTATTCTTTTACTAAAACATAATCTTGTTATATCTCGAAAGCTGAAAATTGAATTGACTGATGAGATTGAAATTTTAAAAGGAGATGAGTTTGTTTCAAGTG
ATGGAGATACAATTCAGTCAGCTTTAGCGGAGTGGACGGGCCAAACCACGGTGCCTAATGTGTTTATCGGAGGAAAGCACATCGGTGGTTGCGATGCGGTTACAGAGAAA
CACCACAAAGGTCAGTTGGTGCCACTTCTAACTGAGGCTGGTGCCATTGCCAGTAACCCTGCTCAGCTGTAAGCTTTGGTTCACTGCTTCACAATCTAGAAATGAAACAA
ATGTATGTTGATGGATTTGAGGTGTGTACAAAACAGTTGTGAAAATGTTTAATGCGGCTTTTTTAATGATTTAAAATGTGGAAGCTGAAGAAATCTATGGCTATGGTTGA
ATTCCTGCATAGATAAATAAATATTTGGAACACAATGATGGATTGTTCTTGGTTCTGCTTTGCTTTACCGCTACCGTGCTACGGTTGGCTTAACCACGAGGGTTGATCAA
GTGGTTAAAAAGACAAGTAATTTGTTTGAGTTCATGAATTCAAACTTATAGTAGTGTGAGTGCCAAATGTTGTGAGGTTAAGTTCGTCGTCTAAAGAGTAGTGATAGAGT
CAGTTTTAAATTTAATTTCAATAACATTTATTATATATGAAACTTATAATAAAATTATCTTGGATTAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSWFSSNKLSKEELELALNEAKKIITSDPVVVFSKTYCGYCSRVKELLTRLGARYKVIELNQKSILLLKHNLVISRKLKIELTDEIEILKGDEFVSSDGDTIQSALAEW
TGQTTVPNVFIGGKHIGGCDAVTEKHHKGQLVPLLTEAGAIASNPAQL