; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G004490 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G004490
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPectinesterase
Genome locationchr02:3750459..3751677
RNA-Seq ExpressionLsi02G004490
SyntenyLsi02G004490
Gene Ontology termsGO:0042545 - cell wall modification (biological process)
GO:0045490 - pectin catabolic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0030599 - pectinesterase activity (molecular function)
GO:0045330 - aspartyl esterase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000070 - Pectinesterase, catalytic
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055283.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-1366.67Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YI V+P TY+ER++IP TK FI LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSD ATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
KAA0055287.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-1469.57Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YIRV+P TY+ER++IP TK FI LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + + FI  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
KAA0055288.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]8.9e-1569.57Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YIRV+P TY+ER++IP TK FI LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
TYJ99206.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-1466.67Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YI V+P TY+ER++IP TK F+ LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
XP_016903572.1 PREDICTED: probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 40 [Cucumis melo]3.4e-1466.67Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YI V+P TY+ER++IP TK F+ LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E5T0 Pectinesterase1.6e-1466.67Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YI V+P TY+ER++IP TK F+ LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
A0A5A7UH51 Pectinesterase6.2e-1466.67Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YI V+P TY+ER++IP TK FI LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSD ATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
A0A5D3BHF7 Pectinesterase9.6e-1569.57Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YIRV+P TY+ER++IP TK FI LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + + FI  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
A0A5D3BJD0 Pectinesterase1.6e-1466.67Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YI V+P TY+ER++IP TK F+ LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
A0A5D3BKF8 Pectinesterase4.3e-1569.57Show/hide
Query:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
        YIRV+P TY+ER++IP TK FI LIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATL+  + N F+  + T  N
Subjt:  YIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTN
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LYT5 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 359.6e-0434.57Show/hide
Query:  IRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFN------TFIISATTNTNVESCFRM
        I ++  TY E + IPS +K + L+GD    T+IV  RSN  G+ T  SAT++           TF+ SA  N+      R+
Subjt:  IRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFN------TFIISATTNTNVESCFRM
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G43050.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily4.4e-0443.48Show/hide
Query:  TYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLS
        TY+E I IP+ +K + L+GD    T+IV  RSN  G+ T  +AT++
Subjt:  TYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLS
AT2G47550.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily9.9e-0438Show/hide
Query:  IRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSAT
        I V+   Y E +E+P  K+++ +IGD    T+I  +RS   G+ T +SAT
Subjt:  IRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSAT
AT3G59010.1 pectin methylesterase 616.8e-0534.57Show/hide
Query:  IRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFN------TFIISATTNTNVESCFRM
        I ++  TY E + IPS +K + L+GD    T+IV  RSN  G+ T  SAT++           TF+ SA  N+      R+
Subjt:  IRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFN------TFIISATTNTNVESCFRM

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAACCGCAGCCGCTCCAGTACATTCGTGTGAGTCCTGAAACTTACAATGAACGTATTGAAATTCCATCTACCAAGAAGTTTATTACTTTGATTGGCGATAATGCACT
CACAACCATTATCGTCGACGATAGAAGCAACGCTCGTGGGTTTAAGACCAGTGACTCTGCAACTCTGAGTAAATGGGATTTCAATACGTTTATTATAAGTGCCACGACTA
ACACGAATGTAGAATCGTGTTTTAGAATGGTCTGGAGCGGCTGCGATTGCATCGCTAATGCTTTTGAAATCGGCAGATCCATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAACCGCAGCCGCTCCAGTACATTCGTGTGAGTCCTGAAACTTACAATGAACGTATTGAAATTCCATCTACCAAGAAGTTTATTACTTTGATTGGCGATAATGCACT
CACAACCATTATCGTCGACGATAGAAGCAACGCTCGTGGGTTTAAGACCAGTGACTCTGCAACTCTGAGTAAATGGGATTTCAATACGTTTATTATAAGTGCCACGACTA
ACACGAATGTAGAATCGTGTTTTAGAATGGTCTGGAGCGGCTGCGATTGCATCGCTAATGCTTTTGAAATCGGCAGATCCATCTAACGACACCATTGTATTAAAATTGAT
GGAATCAATAAGTACTGGAGAATTGAAGATACAAAAAAACAGAACATGCAACAAGCTGGAAAAATGCCATATCTTTCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAAAGGCAATCA
AATTAAAAGGACACAGAAGAACTGAGAGAGGAAGAGGGCTTGTTGAAGCTCAAATTCAAAAGCAAAGTGTATATTTGGTGAGGTTTTTAGCCTCAATGGGAACCAACATA
TTATATTTAATTGAAAGTACTCTTTAATTATTAATTGAATAATTTCTTTTGTTATAAGTTGAAATTGGTTTGAGTTAATTGAGAAAATTATGAGGAAAAGGAATCTTTTT
TGTCTTTTGGTATATTGAAAAATATTATTGAAATAAAAAAAGGGTAAAATGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQPQPLQYIRVSPETYNERIEIPSTKKFITLIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLSKWDFNTFIISATTNTNVESCFRMVWSGCDCIANAFEIGRSI