; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G007610 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G007610
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationchr02:7019129..7019902
RNA-Seq ExpressionLsi02G007610
SyntenyLsi02G007610
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056997.1 VQ motif-containing protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-12290.27Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]6.0e-13296.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV54 VQ domain-containing protein5.7e-12090.08Show/hide
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A0A1S3B685 VQ motif-containing protein 4 isoform X11.6e-11990.04Show/hide
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A0A1S3B6X5 VQ motif-containing protein 4 isoform X21.6e-11990.04Show/hide
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A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X21.6e-12290.27Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like3.4e-11788.51Show/hide
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        ME+SSI QENPCP     SSLLPSPSSRMT+S+TSSSSTS GLQ + P P    H LHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 132.5e-3248.73Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
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        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  S
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Q5M750 VQ motif-containing protein 41.4e-6257.52Show/hide
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        ME S  ++E     ++L+PSP    +N+S   SS+S   +  PPT P +          TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+
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        KP P     D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFD
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        RSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 335.6e-3245.45Show/hide
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        M  S++S SS    +Q  PP  + P    Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP  V N++  S   IPPIK
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Query:  SLPRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTAHSG--FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGL
             + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S  
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Query:  ANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
           S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.9e-1132.61Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGVPNSDSQSKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLN-KLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILS
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E    A+   A  +  +  +  T                KL+ERR  +  KL+I      F  T  +  S   +  L 
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Query:  PSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPG
         S +  P+   S ++ +  +P               +   + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFP+TSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 191.6e-3446.67Show/hide
Query:  TNSSTSSSSTSNGLQIMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGVPNSDSQSKTHIPPIKSLPRR
        ++SS+ SSS  NG           LH       ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P P  P+   +    IPPIK+   +
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Query:  QQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDA
        + SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                  
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Query:  EAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
          EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein9.7e-6457.52Show/hide
Query:  METSSIHQENPCPPSSLLPSPSSRMTNSSTSSSSTSNGLQIMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ-ASV
        ME S  ++E     ++L+PSP    +N+S   SS+S   +  PPT P +          TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+
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        KP P     D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFD
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Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSTS
        RSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.2e-6157.14Show/hide
Query:  METSSIHQENPCPPSSLLPSPSSRMTNSSTSSSSTSNGLQIMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ-ASV
        ME S  ++E     ++L+PSP    +N+S   SS+S   +  PPT P +          TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+
Subjt:  METSSIHQENPCPPSSLLPSPSSRMTNSSTSSSSTSNGLQIMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ-ASV

Query:  KPAPGVPNSD---SQSKTHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFD
        KP P     D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFD
Subjt:  KPAPGVPNSD---SQSKTHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFD

Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        RSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein1.8e-3348.73Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGVPNSDSQSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSTAHS
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGVPNSDSQSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSTAHS

Query:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSS
        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  S
Subjt:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSS

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein1.1e-3546.67Show/hide
Query:  TNSSTSSSSTSNGLQIMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGVPNSDSQSKTHIPPIKSLPRR
        ++SS+ SSS  NG           LH       ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P P  P+   +    IPPIK+   +
Subjt:  TNSSTSSSSTSNGLQIMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGVPNSDSQSKTHIPPIKSLPRR

Query:  QQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDA
        + SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                  
Subjt:  QQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDA

Query:  EAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
          EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  EAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein4.0e-3345.45Show/hide
Query:  MTNSSTSSSSTSNGLQIMPP--TPPPQLHQLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPG-VPNSDSQSKTHIPPIK
        M  S++S SS    +Q  PP  + P    Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP  V N++  S   IPPIK
Subjt:  MTNSSTSSSSTSNGLQIMPP--TPPPQLHQLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPG-VPNSDSQSKTHIPPIK

Query:  SLPRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTAHSG--FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGL
             + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S  
Subjt:  SLPRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTAHSG--FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGL

Query:  ANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
           S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  ANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCAATTCATCAAGAAAACCCATGCCCTCCTTCTTCTCTACTTCCTTCTCCAAGCAGTCGCATGACTAACAGCAGTACCAGCAGTAGCAGCACTAGCAA
TGGACTCCAAATCATGCCTCCAACTCCTCCGCCTCAATTGCATCAGTTGCATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACCTTCGTTC
AAGCCGATACTTCCTCTTTTAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACTGCCAAGCAAGCCTCCGTCAAGCCTGCTCCCGGTGTTCCCAACTCTGATTCT
CAGTCCAAAACCCACATTCCACCCATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTTAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCCGT
GTTTCCCGTTTTTGGTTCTACTGCTCATTCTGGGTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCCAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTTACGC
CGTTAATTCCTGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGTTATTTGAAGAATGGGAATGCTAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAG
GGGTTCTACTTGCATCCATCGCCGACTACCACTCCTCGGGATTCCGAGCCTCGGTTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTTCCAGGTTCATCTTCCACTTC
ATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACCTCTTCAATTCATCAAGAAAACCCATGCCCTCCTTCTTCTCTACTTCCTTCTCCAAGCAGTCGCATGACTAACAGCAGTACCAGCAGTAGCAGCACTAGCAA
TGGACTCCAAATCATGCCTCCAACTCCTCCGCCTCAATTGCATCAGTTGCATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACCTTCGTTC
AAGCCGATACTTCCTCTTTTAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACTGCCAAGCAAGCCTCCGTCAAGCCTGCTCCCGGTGTTCCCAACTCTGATTCT
CAGTCCAAAACCCACATTCCACCCATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTTAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCCGT
GTTTCCCGTTTTTGGTTCTACTGCTCATTCTGGGTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCCAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTTACGC
CGTTAATTCCTGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGTTATTTGAAGAATGGGAATGCTAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAG
GGGTTCTACTTGCATCCATCGCCGACTACCACTCCTCGGGATTCCGAGCCTCGGTTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTTCCAGGTTCATCTTCCACTTC
ATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSIHQENPCPPSSLLPSPSSRMTNSSTSSSSTSNGLQIMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGVPNSDS
QSKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEK
GFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSTS