; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G008540 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G008540
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionAWPM-19-like family protein
Genome locationchr02:8021076..8024576
RNA-Seq ExpressionLsi02G008540
SyntenyLsi02G008540
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147399.3 membrane protein PM19L [Cucumis sativus]1.2e-6991.82Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MASTQMKS ATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMN+AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESL AA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLTILAMGFA KEIALDFRNARLVTMEAFFIILS TQLVYIMAIH   STR
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]3.0e-7394.34Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MASTQMKSIATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMN+AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILS TQLVYIMAIH  +STR
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

XP_022140126.1 uncharacterized protein LOC111010860 [Momordica charantia]4.4e-6988.68Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+ RL+TMEAFFIILSVTQL+YIMAIH   S R
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

XP_022994911.1 uncharacterized protein LOC111490495 [Cucurbita maxima]1.1e-6788.05Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA++QMK IATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLT+LAMGFA KEI LD RN+RLVTMEAFF+ILS TQLVYIMAIH  V+TR
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]3.0e-7394.34Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MASTQMKS+ATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        ++AAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILS TQLVYI+AIH  VSTR
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV01 AWPM19-like protein1.1e-7091.82Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MASTQMKS ATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMN+AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESL AA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLTILAMGFA KEIALDFRNARLVTMEAFFIILS TQLVYIMAIH  +STR
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC1110108602.2e-6988.68Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+ RL+TMEAFFIILSVTQL+YIMAIH   S R
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

A0A6J1K0L0 uncharacterized protein LOC1114904955.3e-6888.05Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA++QMK IATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLT+LAMGFA KEI LD RN+RLVTMEAFF+ILS TQLVYIMAIH  V+TR
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

A0A6J1KGN7 uncharacterized protein LOC1114956046.9e-6888.96Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAAASAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAA+SAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAAASAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RN RL+TMEAFFIILS TQL+YI AIH  VSTR
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

A5Y734 AWPM19-like protein1.4e-7394.34Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MASTQMKSIATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMN+AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR
        +SAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILS TQLVYIMAIH  +STR
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L8.5e-2344.83Show/hide
Query:  LLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAAASAAVFAWTLTI
        LL+LN  MY I++G   W +N  I +G    PG+             GN AT +F+ FA+LA V GAAS ++G++H+RSW A SL A A++A+ AW +T 
Subjt:  LLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAAASAAVFAWTLTI

Query:  LAMGFACKEIAL-DFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGV
        LA G ACKEI +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  +H G+
Subjt:  LAMGFACKEIAL-DFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein2.2e-2646.15Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+T  ++IA  LL LN  MY I+LG   W +N+ I+       G      F       GN AT FF+TF++LAAV G AS ++G NHIR W  +SL AA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIAL-DFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSG
         ++++ AW +T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+M IH+G
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIAL-DFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSG

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein1.4e-5775.82Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA  Q+K +A+ LL+LNFCMY I+LGIGGWAMNRAIDHGF +GP L LPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAAS ISGL+HIRSW+  SL AA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIH
        A+AA  AWTLT+LAMGFA KEI L  RNA+L TMEAF IILSVTQL+YI A+H
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIH

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein1.6e-2946.15Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MAS   KS A +LL+LN  +Y +I  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFV F L+A V G A++++G+ ++  W + +L +A
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGV
        A++++ +W+LT+LAMG ACKEI + +  A L T+E   II+S TQL+   AIH+GV
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein6.2e-5368.63Show/hide
Query:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        M   QMK +A+ LL+LNFCMYAI+LGIG W+MN+AI+HGF+IG    LPAHFSPI+FPMGNAATGFF+ FAL+A V GAAS ISG++H++SW+  SL AA
Subjt:  MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIH
         SAA  AW+LT+LAMGF CKEI L  RNARL TMEAF IILS TQL+YI AI+
Subjt:  ASAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAGTACACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTTAACTTTTGCATGTATGCAATTATTTTGGGCATTGGTGGCTGGGCCATGAACAGAGCCATTGA
TCATGGCTTCATTATTGGTCCCGGGTTACGACTACCGGCTCATTTTTCACCAATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCCGCAATCTCAGGATTGAACCATATTCGCTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGGGCAGCAGCTTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTATCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGCACTGGATTTCAGAAACGCAAGACTGGTAACAATGGAAGCTTTCTTCATTATTCTCTCTGTTACACAGCTAGT
TTACATAATGGCCATCCATAGTGGTGTTTCCACAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGAACATGAAGCATTATCCTTCTCTTTACAACTCCAAAGAGCCCTTTGGACACTGCAGGCTTAGCAAGTAAAGAACCAGAACCTTACTTTTCATCCCCATTTATAACCA
TCTCTGCCCTTTCCTTTTACTTACACATTACAGTTCTCTTCAAATCCCTAACTTTTGGGTCTTGATTCTTGGGAAACTCCTGATCTTTTTCTTTTCTCTCTTCAAAACCA
GCCTTTTCTTTCTGAAAACTCACTGCACAAATGGCTAGTACACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTTAACTTTTGCATGTATGCAATTATTTTGGGCAT
TGGTGGCTGGGCCATGAACAGAGCCATTGATCATGGCTTCATTATTGGTCCCGGGTTACGACTACCGGCTCATTTTTCACCAATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCA
CTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGGCTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCCGCAATCTCAGGATTGAACCATATTCGCTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGGGCAGCA
GCTTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTCACTATCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGCACTGGATTTCAGAAACGCAAGACTGGTAACAATGGAAGCTTT
CTTCATTATTCTCTCTGTTACACAGCTAGTTTACATAATGGCCATCCATAGTGGTGTTTCCACAAGATGAGAGCTGAATGATGGAACATTTGTTTGATTCATTGCCCATT
TTCATTTGTCTTTTGCTGTTATTTTCCTTGGTTTTAACTTCCCATCTGCAAGAAGCTTAATTTAGAACATTATTTTTTGTGATTTGTGTGGTGTGATTTCATTTGTATAA
ATATTCACAATAAACATTGGTTTGGTATTTGATTTAAAGGATTCACTCACTCTGTTTCTCTCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNRAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAAASAAVFAWTL
TILAMGFACKEIALDFRNARLVTMEAFFIILSVTQLVYIMAIHSGVSTR