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Lsi02G008650 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G008650
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationchr02:8121698..8122580
RNA-Seq ExpressionLsi02G008650
SyntenyLsi02G008650
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0004497 - monooxygenase activity (molecular function)
GO:0005506 - iron ion binding (molecular function)
GO:0016705 - oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (molecular function)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
BBH01089.1 Ribosomal protein S11 family protein [Prunus dulcis]8.3e-4392.16Show/hide
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KAB1221343.1 hypothetical protein CJ030_MR2G005416 [Morella rubra]1.1e-4289.42Show/hide
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KAG6573353.1 hypothetical protein SDJN03_27240, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.4e-4487.07Show/hide
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KAG6583920.1 hypothetical protein SDJN03_19852, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-4394.95Show/hide
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PPR93772.1 hypothetical protein GOBAR_AA26900 [Gossypium barbadense]8.3e-4394.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2P5WRP6 Uncharacterized protein4.0e-4394.85Show/hide
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A0A4Y1RA67 Ribosomal protein S11 family protein4.0e-4392.16Show/hide
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A0A6A1W8Y3 Uncharacterized protein5.2e-4389.42Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-26.8e-43100Show/hide
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A0A6J1KQN4 40S ribosomal protein S14-2-like6.8e-43100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S141.2e-4496.77Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S142.7e-4495.7Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-32.0e-4495.7Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-22.0e-4495.7Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-12.0e-4495.7Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein1.5e-4595.7Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein1.5e-4595.7Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein1.5e-4595.7Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S112.1e-0432.05Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRLTETVKEEFLALV