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Lsi02G008780 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G008780
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationchr02:8302534..8306562
RNA-Seq ExpressionLsi02G008780
SyntenyLsi02G008780
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023001458.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucurbita maxima]3.7e-8295.73Show/hide
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A0A1S3BAK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.0e-8295.12Show/hide
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A0A5D3DAQ5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.0e-8295.12Show/hide
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A0A6J1CDN4 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.4e-8294.01Show/hide
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A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.4e-8295.73Show/hide
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A0A6J1KQK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.8e-8295.73Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07370 Chlorophyll a-b binding protein 1B, chloroplastic2.0e-7886.5Show/hide
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P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic4.7e-8090.18Show/hide
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P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic1.5e-7887.12Show/hide
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P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic3.6e-8089.7Show/hide
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P92919 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.0e-7888.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 36.5e-7784.24Show/hide
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AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 26.5e-7784.24Show/hide
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AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 11.7e-7784.85Show/hide
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AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B29.4e-7684.24Show/hide
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AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B12.0e-7884.15Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGAAGATTGGCAATGTTCTCAATGTTCAGGAAAGGGCCCACTAGAGAATCTTGCCGACCATCTTGCTGACCCAGTTAATAACAATGCTTGGGCTTACGCTACCAACTTTG
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ATATCTTTTTTTTTTCCAAC
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