; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G008800 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G008800
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationchr02:8319931..8321959
RNA-Seq ExpressionLsi02G008800
SyntenyLsi02G008800
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008444193.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucumis melo]4.8e-14496.24Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL  N  RV+MRKS++KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

XP_022139935.1 chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic-like [Momordica charantia]2.8e-14496.27Show/hide
Query:  LIVMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRE
        L+ MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRE
Subjt:  LIVMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRE

Query:  LEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDP
        LEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDP
Subjt:  LEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDP

Query:  LGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG
        LGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPG
Subjt:  LGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG

XP_022142169.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Momordica charantia]1.6e-14496.99Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

XP_038877609.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]9.3e-14897.74Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL NGGRVSMRKS+SKS+SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

XP_038882052.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]1.8e-14395.49Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKL+P++PE+  N GRVSMRK++SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.3e-14496.24Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL  N  RV+MRKS++KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

A0A5D3DAQ5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.3e-14496.24Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL  N  RV+MRKS++KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1CDN4 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.4e-14496.27Show/hide
Query:  LIVMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRE
        L+ MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRE
Subjt:  LIVMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRE

Query:  LEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDP
        LEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDP
Subjt:  LEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDP

Query:  LGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG
        LGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPG
Subjt:  LGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG

A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic7.9e-14596.99Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

A0A6M3WGX2 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.0e-14394.36Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKL+PS+PEL+ N GRVSMRK++SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IH RWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07370 Chlorophyll a-b binding protein 1B, chloroplastic4.5e-13788.35Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAA+TMALSSPS AG+AVKL+PS+ E+  N GR++MRK+ +KS  S SPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLG+V DP+YPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        A+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)3.1e-13892.19Show/hide
Query:  PSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGA
        P+LAG+AVKL+P++PE+  N  + +MRK++SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGA
Subjt:  PSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGA

Query:  LGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAEL
        LGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAEL
Subjt:  LGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAEL

Query:  KVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        KVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  KVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic4.6e-14293.21Show/hide
Query:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        AAS+MALSSPSLAGKAVKL PS+PE+    GRVSMRK+ +K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLA PV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic6.3e-13989.1Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAA+TMALSSPS AG+AVKL+PS+PE+  N GRVSMRK+ +K V+S SPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AGGPLG+V DP+YPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        A+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic4.8e-13989.93Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
        MAASTMALSSPS AGKAVKL+PSS E+  N G+V+MRK++S  K+VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL

Query:  EVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        EVIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYR+AGGPLG+V DP+YPGGSFDPL
Subjt:  EVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 37.6e-13285.45Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 27.6e-13285.45Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 12.0e-13285.82Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSP+ AGKAVKL+P++ E+L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B28.4e-13185.45Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MA+STMALSSP+ AGKAVK  P++ ++L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B12.8e-13486.14Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+L GKAVKL+P++ E+    GR++MRK+S  +  SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAACAATCTTCTGTTATTTAATAATTGAATCTCAACGGCTTTTATCATCACAACCGCAAGTAAGCAACTTCAGCTCTAACGGTAAACACATTTTCATTTCTGCAAA
ATTTTTAATTGTAATGGCGGCCTCAACAATGGCTCTCTCTTCTCCGTCGCTTGCTGGAAAGGCAGTGAAACTCACTCCCTCTTCGCCGGAGCTTCTCGACAATGGCGGCA
GAGTCAGCATGAGGAAATCCTCCTCCAAATCTGTTTCTTCTGGTAGCCCTTGGTATGGACCTGACCGTGTCAAGTACTTGGGACCATTCTCCGGCGAGCCTCCGTCTTAT
CTCACTGGTGAGTTTCCCGGTGACTATGGCTGGGATACTGCTGGACTTTCTGCAGATCCCGAGACCTTCGCTAAGAACCGTGAGCTTGAAGTCATTCACTCTAGGTGGGC
CATGCTGGGAGCATTGGGCTGTGTGTTTCCGGAGCTTCTTTCCCGCAACGGCGTAAAGTTCGGAGAAGCAGTGTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGTGAAGGTG
GGCTCGATTACTTTGGGAACCCGAGCTTGATCCACGCCCAAAGCATTCTAGCCATTTGGGCCTCCCAGGTGGTTCTCATGGGAGCCGTCGAGGGATACCGTATCGCCGGT
GGCCCACTTGGGAAGGTGACCGACCCAATTTACCCGGGCGGGAGCTTTGACCCGTTAGGCCTTGCAGATGACCCGGAAGCCTTTGCAGAGCTGAAAGTGAAGGAGCTGAA
GAATGGAAGGTTGGCCATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTCGTTCAAGCCATCGTGACTGGAAAAGGCCCACTTGAGAATCTTGCTGATCATCTTGCTGACCCAGTCAGCA
ATAATGCTTGGGCTTATGCTACCAACTTCGTTCCTGGAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTGTTTGTAGCCATAGGAACTGCCACATGGAGATTCACAACCAATGAAATCGTAGACATTGATTTTCCCATGATAACAATCTTCTGTTATTTAATAATTGAATCTCA
ACGGCTTTTATCATCACAACCGCAAGTAAGCAACTTCAGCTCTAACGGTAAACACATTTTCATTTCTGCAAAATTTTTAATTGTAATGGCGGCCTCAACAATGGCTCTCT
CTTCTCCGTCGCTTGCTGGAAAGGCAGTGAAACTCACTCCCTCTTCGCCGGAGCTTCTCGACAATGGCGGCAGAGTCAGCATGAGGAAATCCTCCTCCAAATCTGTTTCT
TCTGGTAGCCCTTGGTATGGACCTGACCGTGTCAAGTACTTGGGACCATTCTCCGGCGAGCCTCCGTCTTATCTCACTGGTGAGTTTCCCGGTGACTATGGCTGGGATAC
TGCTGGACTTTCTGCAGATCCCGAGACCTTCGCTAAGAACCGTGAGCTTGAAGTCATTCACTCTAGGTGGGCCATGCTGGGAGCATTGGGCTGTGTGTTTCCGGAGCTTC
TTTCCCGCAACGGCGTAAAGTTCGGAGAAGCAGTGTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGTGAAGGTGGGCTCGATTACTTTGGGAACCCGAGCTTGATCCACGCC
CAAAGCATTCTAGCCATTTGGGCCTCCCAGGTGGTTCTCATGGGAGCCGTCGAGGGATACCGTATCGCCGGTGGCCCACTTGGGAAGGTGACCGACCCAATTTACCCGGG
CGGGAGCTTTGACCCGTTAGGCCTTGCAGATGACCCGGAAGCCTTTGCAGAGCTGAAAGTGAAGGAGCTGAAGAATGGAAGGTTGGCCATGTTCTCTATGTTTGGATTCT
TCGTTCAAGCCATCGTGACTGGAAAAGGCCCACTTGAGAATCTTGCTGATCATCTTGCTGACCCAGTCAGCAATAATGCTTGGGCTTATGCTACCAACTTCGTTCCTGGA
AAATGAGCCATAACATAATTTTGTGAAAATTAAAACCTTAAATTTGTTTGTTTGTAGAGTGGTATTCAGAGTGAAAGTTGTGTGTTTTGTTTAGTGAATCTTTTTATGCA
GTACAGAAAAATGTGCATTGCCTGTAATTTTATTTATATAAATGAGTAATTTTCATGGTTGAAATCAAGGGTTAAAATGTTGATGTTGCCATAAATATTAATAGAAATAT
TGATAAAATGTCAATGTCGATGTCGATGGCTATTTTATGAAAAAGTTATAAAAACAAAAATATCAAAAGTTTATTTAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MITIFCYLIIESQRLLSSQPQVSNFSSNGKHIFISAKFLIVMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSY
LTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG
GPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK