; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G011270 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G011270
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionFAS1 domain-containing protein
Genome locationchr02:13180052..13180453
RNA-Seq ExpressionLsi02G011270
SyntenyLsi02G011270
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036378 - FAS1 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023520235.1 FAS1 domain-containing protein SELMODRAFT_448915-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-5481.95Show/hide
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XP_038893487.1 FAS1 domain-containing protein SELMODRAFT_448915-like [Benincasa hispida]5.6e-6595.49Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTE3 Uncharacterized protein3.3e-5590.76Show/hide
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A0A1S3CJM9 FAS1 domain-containing protein SELMODRAFT_448915-like4.7e-6291.73Show/hide
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A0A5D3E4N2 FAS1 domain-containing protein9.6e-5591.6Show/hide
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A0A6J1EI57 FAS1 domain-containing protein SELMODRAFT_448915-like9.6e-5581.95Show/hide
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A0A6J1KFG1 FAS1 domain-containing protein SELMODRAFT_448915-like2.8e-5481.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G26730.1 Fasciclin-like arabinogalactan family protein4.9e-1938.4Show/hide
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          PNVC +S  I CHG++ VI + +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAGCCAAATCCTTCTATGGCTTTGCCATCCTTCTCCAAATGCTCAACATCACCACCCAACTAACCCTAAAAGAAATCACCTTCTTCATCCCTCAAGACCCTCAGCT
CTCCAATATCTCCATCGCGGTCGACCATCTCGAGGCCTTTATCCTCAGCCATTTGATCGTCATGCCGCTTCAATTCGGCGACTTGATTCGATTTCCGACCGGTTCCATCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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