; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G014630 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G014630
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionVesicle transport v-SNARE family protein
Genome locationchr02:20327860..20332040
RNA-Seq ExpressionLsi02G014630
SyntenyLsi02G014630
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0012507 - ER to Golgi transport vesicle membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0031902 - late endosome membrane (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007705 - Vesicle transport v-SNARE, N-terminal
IPR010989 - SNARE
IPR027027 - GOSR2/Membrin/Bos1
IPR038407 - Vesicle transport v-SNARE, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578564.1 Vesicle transport v-SNARE 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.4e-10798.19Show/hide
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KAG7016122.1 Vesicle transport v-SNARE 13 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.8e-10797.74Show/hide
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XP_022939644.1 vesicle transport v-SNARE 13-like [Cucurbita moschata]3.4e-10798.19Show/hide
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XP_022993669.1 vesicle transport v-SNARE 13 [Cucurbita maxima]2.2e-10697.74Show/hide
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XP_038891108.1 vesicle transport v-SNARE 13-like [Benincasa hispida]3.7e-10698.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUA8 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein1.2e-10596.83Show/hide
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A0A1S3C9G1 vesicle transport v-SNARE 115.2e-10697.29Show/hide
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A0A5D3BNH0 Vesicle transport v-SNARE 115.2e-10697.29Show/hide
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A0A6J1FHT9 vesicle transport v-SNARE 13-like1.6e-10798.19Show/hide
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A0A6J1K0S2 vesicle transport v-SNARE 131.1e-10697.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O89116 Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A1.8e-2633.64Show/hide
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        MS  FEGYE+ +  L+A ++ K      L  ++KKQ V+ V+  ++EA  L+ +MDLE R +PP  + +   ++R YK ++  L+++ KR        A 
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         DE+    + D   +S +QR+ L+  TERL +SS R++   +  +ETE++G  +L++L   R+ +  A + L   D N+GKS RILT M RR+ +N+ ++
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          + +++V+AI+  + F
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Q96AJ9 Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A1.8e-2632.58Show/hide
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         DE+    + D   +S +QR+ L+  TERL +SS R++   +  +ETE++G  +L++L   R+ +  A   L   D N+GKS RILT M RR+ +N+ ++
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          + +++V+ I++ + F + +
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Q9LVP9 Vesicle transport v-SNARE 137.3e-8977.38Show/hide
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        MS+ FE YERQYCE+SANLS+KCTSA AL+GEQKKQ +SE+K+G++EAEAL++KMDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SGNLNA  
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        RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ LG+++DRIK+SRRT+LETEELGVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW +
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         +II VLVLAII ILYFKL++
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Q9SEL5 Vesicle transport v-SNARE 121.1e-7670.59Show/hide
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        MS+VFEGYERQYCELS NLSRKC SAS L NGE+KK K++E+K+GIDEA+ LIRKMDLEARSL P+ KAV L+KLREYKSDLN LK E KR+ S +   +
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        +R+EL+ESGMAD    SADQR RL  + ERL +SSDRI+ESRR MLETEE+G+SI+QDL  QRQ+LLHAHN LHGVDD I KSK++LT MSRRM +NKWI
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        +TS+IV LVLAIILI+ +KLS
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Q9SEL6 Vesicle transport v-SNARE 111.4e-8775.11Show/hide
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        MS+VF+GYERQYCELSA+LS+KC+SA +L+GEQKKQK+SE+K+G++ AE LIRKMDLEAR+LPPN+K+ LL KLRE+KSDLNN K+EVKRI SG LNAA 
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        RDELLE+GMADT TASADQR+RLM +TERLG+++DR+K+SRRTM+ETEE+GVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDNIGKSK+ILT+M+RRMNKNKW +
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         +II+ L+ AI +ILYFKL+K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26670.1 Vesicle transport v-SNARE family protein7.8e-7870.59Show/hide
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        MS+VFEGYERQYCELS NLSRKC SAS L NGE+KK K++E+K+GIDEA+ LIRKMDLEARSL P+ KAV L+KLREYKSDLN LK E KR+ S +   +
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        +R+EL+ESGMAD    SADQR RL  + ERL +SSDRI+ESRR MLETEE+G+SI+QDL  QRQ+LLHAHN LHGVDD I KSK++LT MSRRM +NKWI
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        +TS+IV LVLAIILI+ +KLS
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AT3G29100.1 vesicle transport V-snare 132.8e-6778.24Show/hide
Query:  IRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGNLNAATRDELLESGMADTLTASADQRSRLMTTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELG
        ++KMDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SGNLNA  RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ LG+++DRIK+SRRT+LETEELG
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Query:  VSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIVVLVLAIILILYFKLSK
        VSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW + +II VLVLAII ILYFKL++
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AT3G29100.2 vesicle transport V-snare 133.1e-6679.04Show/hide
Query:  MDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGNLNAATRDELLESGMADTLTASADQRSRLMTTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELGVSI
        MDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SGNLNA  RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ LG+++DRIK+SRRT+LETEELGVSI
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Query:  LQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIVVLVLAIILILYFKLSK
        LQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW + +II VLVLAII ILYFKL++
Subjt:  LQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIVVLVLAIILILYFKLSK

AT5G39510.1 Vesicle transport v-SNARE family protein9.8e-8975.11Show/hide
Query:  MSEVFEGYERQYCELSANLSRKCTSASALNGEQKKQKVSEVKTGIDEAEALIRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGNLNAAT
        MS+VF+GYERQYCELSA+LS+KC+SA +L+GEQKKQK+SE+K+G++ AE LIRKMDLEAR+LPPN+K+ LL KLRE+KSDLNN K+EVKRI SG LNAA 
Subjt:  MSEVFEGYERQYCELSANLSRKCTSASALNGEQKKQKVSEVKTGIDEAEALIRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGNLNAAT

Query:  RDELLESGMADTLTASADQRSRLMTTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIV
        RDELLE+GMADT TASADQR+RLM +TERLG+++DR+K+SRRTM+ETEE+GVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDNIGKSK+ILT+M+RRMNKNKW +
Subjt:  RDELLESGMADTLTASADQRSRLMTTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIV

Query:  TSIIVVLVLAIILILYFKLSK
         +II+ L+ AI +ILYFKL+K
Subjt:  TSIIVVLVLAIILILYFKLSK

AT5G39630.1 Vesicle transport v-SNARE family protein2.2e-4045.93Show/hide
Query:  MSEVFEGYERQYCELSANLSRKCTSASALNGEQKKQKVSEVKTGIDEAEALIRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGNLNAAT
        MS VF  Y++QY ELS NLS+KC+ A +L G +KK+K+SE+   ++ AE LI KMD  A +LPPN+K++LL KL+E KS L  L++E+KR  S NL   T
Subjt:  MSEVFEGYERQYCELSANLSRKCTSASALNGEQKKQKVSEVKTGIDEAEALIRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGNLNAAT

Query:  RDELLESGMADTLTASADQRSRLMTTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIV
        R+E+LE+  AD     ADQRSRLM +TE L ++ + IK+S+R +LETE +G+SIL++L  Q++SL ++   LH +DD + +S+ I+ ++     K  + V
Subjt:  RDELLESGMADTLTASADQRSRLMTTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIV

Query:  TSIIVVLVL
        T+ I++  L
Subjt:  TSIIVVLVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGAGGTGTTTGAAGGGTACGAACGCCAATACTGCGAACTCTCGGCGAACCTTTCAAGAAAGTGCACTTCGGCTAGTGCCCTAAATGGAGAGCAAAAGAAGCAAAA
GGTTTCTGAAGTAAAGACAGGGATTGATGAGGCAGAAGCTCTGATTCGAAAAATGGATCTTGAGGCCAGAAGTTTGCCGCCTAATGTCAAGGCTGTCCTTCTAGCTAAAT
TAAGAGAGTACAAATCTGACCTCAACAATTTGAAAAGTGAAGTTAAACGCATTGAATCTGGAAACTTAAATGCAGCCACTAGAGATGAGTTGCTGGAATCAGGAATGGCT
GATACATTGACGGCATCAGCTGACCAAAGATCGAGATTAATGACCACAACAGAGAGGCTAGGTAAGTCTAGTGATAGAATCAAGGAAAGCCGAAGAACCATGCTAGAAAC
AGAAGAACTTGGAGTTTCAATTCTTCAAGATTTGCACTCGCAGCGACAGTCTCTCTTGCATGCTCATAATACGCTTCATGGAGTAGATGACAATATTGGGAAGAGTAAGA
GAATTTTAACCAACATGTCAAGAAGGATGAACAAGAACAAATGGATTGTTACATCCATAATTGTTGTTCTTGTCTTGGCCATCATCCTGATTTTGTACTTCAAACTTTCC
AAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTCGAGACGCCGTTGGCCAACGAAGCCTTAATTCATTTGTCAACAACAAAAGTTTGGTGCTTCGTGACGGGGGTCCGTACGCATTCCTCTTCCGGTTTAATTGTTCCAA
TCGCTAACCCACCGATTTTCTCGTTCTACAATTCCTCCTCCTCTGGGCTTTGCCATCTCTGATCGAATTGGGTTTGGGCACGATGAGTGAGGTGTTTGAAGGGTACGAAC
GCCAATACTGCGAACTCTCGGCGAACCTTTCAAGAAAGTGCACTTCGGCTAGTGCCCTAAATGGAGAGCAAAAGAAGCAAAAGGTTTCTGAAGTAAAGACAGGGATTGAT
GAGGCAGAAGCTCTGATTCGAAAAATGGATCTTGAGGCCAGAAGTTTGCCGCCTAATGTCAAGGCTGTCCTTCTAGCTAAATTAAGAGAGTACAAATCTGACCTCAACAA
TTTGAAAAGTGAAGTTAAACGCATTGAATCTGGAAACTTAAATGCAGCCACTAGAGATGAGTTGCTGGAATCAGGAATGGCTGATACATTGACGGCATCAGCTGACCAAA
GATCGAGATTAATGACCACAACAGAGAGGCTAGGTAAGTCTAGTGATAGAATCAAGGAAAGCCGAAGAACCATGCTAGAAACAGAAGAACTTGGAGTTTCAATTCTTCAA
GATTTGCACTCGCAGCGACAGTCTCTCTTGCATGCTCATAATACGCTTCATGGAGTAGATGACAATATTGGGAAGAGTAAGAGAATTTTAACCAACATGTCAAGAAGGAT
GAACAAGAACAAATGGATTGTTACATCCATAATTGTTGTTCTTGTCTTGGCCATCATCCTGATTTTGTACTTCAAACTTTCCAAATAGTAAGGTTATCTTCTTCATTTGG
GTTTGTCATATTTGAGTGTTGTTGAAACATGAGTTCATGTTTTATGTATTTCTCTGGGTCTATTGTGAGTTTGTACATGGCTTATGTCATGATTAATTATTTTTTGCCTG
AATCTTAGTCTTCTTCAAGATTGGCAAGTGTTCACAAAGCAATATTAATGGTGTAAGGTTTTCTCAACGTTTTATATTACTCTGTCTAATATACTCTGGGATATCGTATT
TGCTTACTTTGACAGCTTAAATTGAGAATCTACAGAGATGGTTTAAGCTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEVFEGYERQYCELSANLSRKCTSASALNGEQKKQKVSEVKTGIDEAEALIRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGNLNAATRDELLESGMA
DTLTASADQRSRLMTTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIVVLVLAIILILYFKLS
K