; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G015780 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G015780
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionglutaredoxin
Genome locationchr02:21683092..21686566
RNA-Seq ExpressionLsi02G015780
SyntenyLsi02G015780
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0004362 - glutathione-disulfide reductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR011767 - Glutaredoxin active site
IPR011899 - Glutaredoxin, eukaryotic/virial
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578661.1 Isocitrate dehydrogenase [NADP], chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-4489.72Show/hide
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KAG7016200.1 hypothetical protein SDJN02_21305 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-4489.72Show/hide
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XP_008458784.1 PREDICTED: glutaredoxin-C6 [Cucumis melo]2.5e-4488.79Show/hide
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XP_022993774.1 glutaredoxin isoform X1 [Cucurbita maxima]6.7e-4590.65Show/hide
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XP_038889541.1 glutaredoxin-like [Benincasa hispida]1.4e-4794.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KR45 Glutaredoxin6.1e-4486.92Show/hide
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A0A1S3C8S5 glutaredoxin-C61.2e-4488.79Show/hide
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A0A5A7T277 Glutaredoxin-C61.2e-4488.79Show/hide
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A0A6J1FDX0 glutaredoxin2.8e-4488.79Show/hide
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A0A6J1K114 glutaredoxin isoform X13.2e-4590.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P55142 Glutaredoxin-C63.1e-3773.79Show/hide
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P55143 Glutaredoxin4.8e-3873.53Show/hide
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        MA+ KTKE+V+SN V VFSKTYCPYC  VK+LL +LGA +K VELDTESDGSE+Q ALA++TGQRTVPNVFIGGKHIGGCD+T A + +G LVPLL EAG
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Q6K953 Glutaredoxin-C4, chloroplastic5.4e-3773.58Show/hide
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        MAL+K KEIVAS+PV VFSKTYCP+C +VKRLL +L AS+KAVELD ESDGSE+Q+ALA +TGQRTVP VFI GKHIGGCD T+A++  G LVPLL EAG
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Q9FNE2 Glutaredoxin-C24.1e-3772.9Show/hide
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        MA++K KEIV S  V VFSKTYCPYCV+VK LL +LGA FKAVELDTESDGS++Q+ LA++TGQRTVPNVFIGG HIGGCDAT  L+  G LVPLL EAG
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Q9ZR41 Glutaredoxin6.8e-4076.42Show/hide
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        M+L K KEIV+ NPV VFSKTYCP+CV VK LL+KLGA+FKAVELD+E DGSE+QAALA++TGQRTVPNVFIG KHIGGCDAT AL+ +G L+PLL EAG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein3.2e-2155.67Show/hide
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        E  K  VA NPV V+SKT+C Y  QVK L   L      VELD   S+GS++Q  L + TGQ TVPNVFIGGKHIGGC  T+ L+ KG L  +LAEA
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein4.7e-2050.52Show/hide
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        E  ++ V  N V ++SKT+C YC +VK L  +LG     VELD     G ++Q  L + TGQ TVPNVF+ GKHIGGC  TV LN KG L  +LAEA
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein2.9e-3872.9Show/hide
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        MA++K KEIV S  V VFSKTYCPYCV+VK LL +LGA FKAVELDTESDGS++Q+ LA++TGQRTVPNVFIGG HIGGCDAT  L+  G LVPLL EAG
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AT5G40370.2 Glutaredoxin family protein1.8e-3273.63Show/hide
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein1.8e-3262.62Show/hide
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        + + K KEIV++ PV VFSKTYC YC +VK+LLT+LGA+FK +ELD  SDG E+Q+AL+++TGQ TVPNVFI G HIGGCD  +  N +G LVPLL EAG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTGGAGAAGACTAAAGAGATTGTGGCTTCCAATCCCGTCACCGTCTTCAGCAAGACGTATTGTCCGTACTGCGTCCAGGTGAAGAGATTGTTGACTAAACTGGG
AGCTAGTTTTAAGGCTGTTGAATTGGACACTGAGAGTGATGGAAGTGAGGTACAAGCAGCACTTGCTCAGTTCACTGGACAGCGGACCGTGCCCAATGTGTTCATAGGTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTCTTGTTCTGTTTCTCATTTCTTTCAGAGCTCTCAATCGTTAGGGTTACAAATCTAGGAAATTCGATCATGGCGTTGGAGAAGACTAAAGAGATTGTGGCTTCCAAT
CCCGTCACCGTCTTCAGCAAGACGTATTGTCCGTACTGCGTCCAGGTGAAGAGATTGTTGACTAAACTGGGAGCTAGTTTTAAGGCTGTTGAATTGGACACTGAGAGTGA
TGGAAGTGAGGTACAAGCAGCACTTGCTCAGTTCACTGGACAGCGGACCGTGCCCAATGTGTTCATAGGTGGGAAGCACATTGGTGGCTGTGATGCAACGGTGGCCTTAA
ATGGTAAAGGGGGACTGGTTCCTCTGCTGGCTGAAGCGGGAGCAATTGCCAAAGTTTCTGCTTAGAGAAGGAGTCTGAATTTATGTTATTAGTATATTACATAGTCCAAT
TAGATAAATAAACCTTCTACTTTGTGCTTTTCTTGCTCTTCTGTTGCCATTTCTACTCAAGAAAATGCTTTCAGACTGGACCTTTCAGTTGTTTGTATAAATAACTGGAA
GGAACCTATATATGCTTCGAGCTTCCTTTGCATCTAATCATAAATGTCTCGGCTTTCCTGTAATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTAGTAATAACAAGAATTATTGT
AATCTAAAATTAAGTAAAAATTAGGGGTTTTTAAAAATAGAAAAAAATTATTTATAAAATAGCATAATTTTTAAATAATTGTAATAGGTGCTAAGTCGTGTTGTTCTACA
AGTACATAAGCTGTATATCTACAAGTACATCGTAAGACGAATGCATATAGAATTTGTTAAAAAGTATACACGTCTGGTTCGGTGTTTAGTATGTACATGCCATTTTACCT
AAATCATAGAAACATTTCAAAATCTTTTACTCTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALEKTKEIVASNPVTVFSKTYCPYCVQVKRLLTKLGASFKAVELDTESDGSEVQAALAQFTGQRTVPNVFIGGKHIGGCDATVALNGKGGLVPLLAEAGAIAKVSA