; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G015820 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G015820
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionsirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like
Genome locationchr02:21713730..21717245
RNA-Seq ExpressionLsi02G015820
SyntenyLsi02G015820
Gene Ontology termsGO:0006979 - response to oxidative stress (biological process)
GO:0019354 - siroheme biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051266 - sirohydrochlorin ferrochelatase activity (molecular function)
GO:0051536 - iron-sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002762 - Sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037556.1 sirohydrochlorin ferrochelatase [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-9686.6Show/hide
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KAG7033101.1 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-9686.67Show/hide
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XP_022993758.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]1.1e-9688.15Show/hide
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XP_023551685.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-9687.68Show/hide
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XP_038890885.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]7.3e-10493.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KP17 Uncharacterized protein2.5e-9484.21Show/hide
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A0A1S3C8S9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic1.6e-9686.6Show/hide
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A0A5D3BY55 Sirohydrochlorin ferrochelatase1.6e-9686.6Show/hide
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A0A6J1FHT5 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like7.9e-9687.2Show/hide
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A0A6J1K384 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like5.5e-9788.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O87690 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.1e-1229.01Show/hide
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        +V+ V HGSR  E N    EF++ M  D     +VE   +E   P++     +CV +GA+ ++V P  L P  H +  IP+   EA + +P ++++   P
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        +G+HE+ ++++  R+     +    AE+  V
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P61817 Sirohydrochlorin ferrochelatase8.6e-1534.48Show/hide
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        DAV+ V HGSR +E       F+   +      I E   +ELA P+I+  F +C+EQGA RI + P  L    H + DIP    +  + +P +  L   P
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         G+ E++VD++ +RI+
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P61819 Sirohydrochlorin cobaltochelatase8.1e-1328.78Show/hide
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        +A+++V HGSR   S  ++ E     + +  Y IVE   ME  EP+I  +    ++ GAK++IV+P FL PG H ++DIP +        E    H    
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                        G+  +   P+G  ++++D+V DR
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Q58380 Sirohydrochlorin cobaltochelatase6.8e-1229.71Show/hide
Query:  DAVIIVDHGSRRQESNLMLNEFVAMFRDKTGYRIVEPAHMELAEPSIKDSFASCVEQGAKRIIVSPFFLFPGRHWQQDIPSLTAEAAKDH----------
        +A+++V HGSR   S  +L +     +++  + IVE   ME +EP+I  +    +EQGAKRIIV P FL  G H  +DIP L      +H          
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Query:  --------------PGISYLITAPLGLHEKLVDVVNDR
                        +  +   P+G  +++VD++ DR
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Q84JH7 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic1.8e-6057.89Show/hide
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        ++L    +++  S     T R++ +  S   +K  +  GR  R           V NG        IG  D +IIVDHGSRR+ESNLML EFV MF++KT
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        GY IVEPAHMELAEPSIKD+F+ CV+QGAKR++VSPFFLFPGRHW  DIPSLTA+AAK+  GISYLITAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G A+EC 
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        VCAGT KC+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50170.1 sirohydrochlorin ferrochelatase B1.3e-6157.89Show/hide
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        ++L    +++  S     T R++ +  S   +K  +  GR  R           V NG        IG  D +IIVDHGSRR+ESNLML EFV MF++KT
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Query:  VCAGTGKCR
        VCAGT KC+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACATCGCTATCCATCACTCCTCAAATTACAGTGAAGAGTCTTTCAGCCGTGGAAACTAGAAGAACTTACACAATCGGCGCATCTCAGAAATCTCCAATTCTGATCGG
ACGGCTCTCTAGATTCAGGAATTTCACCTCGCGGTTCCGTATGAGTGTTAATAATGGAGGCTCTAATCGGAGCGGAGATCGGATTGGTGCCGGAGATGCCGTGATCATCG
TCGACCACGGCTCGCGCCGCCAGGAATCTAACCTCATGCTGAATGAGTTCGTTGCTATGTTTAGGGATAAAACTGGGTACCGTATTGTGGAGCCTGCTCACATGGAGCTG
GCTGAACCGTCAATAAAAGACTCGTTTGCATCGTGTGTTGAACAAGGGGCCAAACGTATCATTGTAAGCCCATTCTTTCTCTTCCCCGGTCGACATTGGCAACAGGATAT
TCCTTCCTTAACAGCTGAAGCTGCAAAGGATCACCCAGGAATATCGTATTTAATAACTGCTCCTCTTGGTCTTCACGAAAAACTTGTGGATGTTGTGAATGATAGAATAA
GTCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGAAGAATGTGAAGTTTGTGCTGGAACAGGCAAATGCAGATTTAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTCCACCAAGGTTCAGAAGGCTAGCTGAGGCTCTCCCTCTGCAAAGGATCAGAACCCATGACATCGCTATCCATCACTCCTCAAATTACAGTGAAGAGTCTTTCAGCCG
TGGAAACTAGAAGAACTTACACAATCGGCGCATCTCAGAAATCTCCAATTCTGATCGGACGGCTCTCTAGATTCAGGAATTTCACCTCGCGGTTCCGTATGAGTGTTAAT
AATGGAGGCTCTAATCGGAGCGGAGATCGGATTGGTGCCGGAGATGCCGTGATCATCGTCGACCACGGCTCGCGCCGCCAGGAATCTAACCTCATGCTGAATGAGTTCGT
TGCTATGTTTAGGGATAAAACTGGGTACCGTATTGTGGAGCCTGCTCACATGGAGCTGGCTGAACCGTCAATAAAAGACTCGTTTGCATCGTGTGTTGAACAAGGGGCCA
AACGTATCATTGTAAGCCCATTCTTTCTCTTCCCCGGTCGACATTGGCAACAGGATATTCCTTCCTTAACAGCTGAAGCTGCAAAGGATCACCCAGGAATATCGTATTTA
ATAACTGCTCCTCTTGGTCTTCACGAAAAACTTGTGGATGTTGTGAATGATAGAATAAGTCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGAAGAATGTGAAGTTTGTGC
TGGAACAGGCAAATGCAGATTTAATTAGTGTATGAAAGTAGGGACTTGGGATGAAATCGCTCGGTTTTTCGACGACTTCCATTTGAAGCTGCTTGACGAAGGCCTTGGCC
GCCATAAAGACATTGGCTGGAATTTCCCAGCCGCCTCCAAACACGCCATACCCTTCCTTGGGCAGTGGCTGCATCAAATACTCCAACACTTCCAGTTCCTCCTTTTCTAC
CCAATATATGCAATTCACAGGACACGATTCCACTGAAACCTGTAAGAATGAAACGAAACGGCGCTGTTTAGTGTTCTTTTATCTCTCATAATTTACCATTTTTTCTCCTT
TACCTGAATTTTCTGATCACTGTCTCCATACTGAACCTTTACTCGTGCACGGCCAAGAGTCTCATCCATGGTGAATGTATTACTTGCATTGTGTACGCATTCCCTGCACC
CTGTGAGACATTATGCAGGCCTCTCATGTTCATATTAGGAAGTGGTTTGTAATTATTAACTAAGAATAGCCAATTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSLSITPQITVKSLSAVETRRTYTIGASQKSPILIGRLSRFRNFTSRFRMSVNNGGSNRSGDRIGAGDAVIIVDHGSRRQESNLMLNEFVAMFRDKTGYRIVEPAHMEL
AEPSIKDSFASCVEQGAKRIIVSPFFLFPGRHWQQDIPSLTAEAAKDHPGISYLITAPLGLHEKLVDVVNDRISHCLSHAAGVAEECEVCAGTGKCRFN