; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G019790 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G019790
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionAcyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein
Genome locationchr02:25658660..25662427
RNA-Seq ExpressionLsi02G019790
SyntenyLsi02G019790
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7025053.1 hypothetical protein SDJN02_13876, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.8e-3359.85Show/hide
Query:  KKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNW---------------------------IKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCN
        +K+ +KK+K  +  IPWE+KKE+IDKEE+QLHKDLDQLTNW                           IKMVDSMNDEKLK+YLQ  P +FKILKIP+CN
Subjt:  KKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNW---------------------------IKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCN

Query:  PKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWKFHKQDNDQ-QLS
        P+R  Q+ ED KYW SYGIMASVWKFHKQDN+Q QLS
Subjt:  PKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWKFHKQDNDQ-QLS

XP_016902781.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991884 isoform X1 [Cucumis melo]1.4e-4180Show/hide
Query:  RRNKKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYW
        R NKKE+E SEM      KKIKKG IIIPWEQKKE+IDKEEIQ+ KDLDQLTNWIKMVD+MNDEKLKEYLQDTPQ+ KI+KI KCN KR  QKIE+ KY 
Subjt:  RRNKKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYW

Query:  ASYGIMASVWKFHKQDNDQQ
        ASYGIMASVWKFHKQDNDQQ
Subjt:  ASYGIMASVWKFHKQDNDQQ

XP_022937006.1 uncharacterized protein LOC111443429 [Cucurbita moschata]1.1e-3870.83Show/hide
Query:  KKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASY
        KKE +   ++ +K+ +K  K +  IPWE+KKE+IDKEE+QLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLK+YLQD P +FKILKIP+CNP+R  Q+ ED KYW SY
Subjt:  KKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASY

Query:  GIMASVWKFHKQDNDQ-QLS
        GIMASVWKFHKQDN+Q QLS
Subjt:  GIMASVWKFHKQDNDQ-QLS

XP_022975889.1 uncharacterized protein LOC111476458 [Cucurbita maxima]1.6e-3775.45Show/hide
Query:  KKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWKFH
        +K+ +KK+K  +  IPWE+KKE+IDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLK+YLQ  P +FKILKIP+CNP+R  Q+ ED KYW SYGIMASVWKFH
Subjt:  KKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWKFH

Query:  KQDNDQ-QLS
        KQDN+Q QLS
Subjt:  KQDNDQ-QLS

XP_023535574.1 uncharacterized protein LOC111796971 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.1e-3870.83Show/hide
Query:  KKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASY
        KKE +   ++ +K+ +K  K +  IPWE+KKE+IDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLK+YLQ  P +FKILKIP+CNP+R  Q+ ED KYW SY
Subjt:  KKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASY

Query:  GIMASVWKFHKQDNDQ-QLS
        GIMASVWKFHKQDN+Q QLS
Subjt:  GIMASVWKFHKQDNDQ-QLS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E3H5 uncharacterized protein LOC107991884 isoform X16.6e-4280Show/hide
Query:  RRNKKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYW
        R NKKE+E SEM      KKIKKG IIIPWEQKKE+IDKEEIQ+ KDLDQLTNWIKMVD+MNDEKLKEYLQDTPQ+ KI+KI KCN KR  QKIE+ KY 
Subjt:  RRNKKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYW

Query:  ASYGIMASVWKFHKQDNDQQ
        ASYGIMASVWKFHKQDNDQQ
Subjt:  ASYGIMASVWKFHKQDNDQQ

A0A1S4E3H8 uncharacterized protein LOC107991884 isoform X23.0e-2673.74Show/hide
Query:  RRNKKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKY
        R NKKE+E SEM      KKIKKG IIIPWEQKKE+IDKEEIQ+ KDLDQLTNWIKMVD+MNDEKLKEYLQDTPQ+ KI+KI KCN KR   K   S Y
Subjt:  RRNKKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKY

A0A6J1CPG1 uncharacterized protein LOC111013524 isoform X23.5e-2760.91Show/hide
Query:  MKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWK
        M KK KKK I        W++KK++ D+E+I L KDLDQL NWI+MVDSMNDE+LK+YL + P++ K LKI + N +R  +KIED +YWASYGIMASVWK
Subjt:  MKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWK

Query:  FHKQDNDQQL
        FHKQDN+ QL
Subjt:  FHKQDNDQQL

A0A6J1F930 uncharacterized protein LOC1114434295.3e-3970.83Show/hide
Query:  KKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASY
        KKE +   ++ +K+ +K  K +  IPWE+KKE+IDKEE+QLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLK+YLQD P +FKILKIP+CNP+R  Q+ ED KYW SY
Subjt:  KKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASY

Query:  GIMASVWKFHKQDNDQ-QLS
        GIMASVWKFHKQDN+Q QLS
Subjt:  GIMASVWKFHKQDNDQ-QLS

A0A6J1ILW6 uncharacterized protein LOC1114764587.6e-3875.45Show/hide
Query:  KKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWKFH
        +K+ +KK+K  +  IPWE+KKE+IDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLK+YLQ  P +FKILKIP+CNP+R  Q+ ED KYW SYGIMASVWKFH
Subjt:  KKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYLQDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWKFH

Query:  KQDNDQ-QLS
        KQDN+Q QLS
Subjt:  KQDNDQ-QLS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72030.1 Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein9.9e-0677.78Show/hide
Query:  VWGFKFLALSAYEDDYGARNLYSKAGY
        +WGFK LAL AYEDD  ARNLYS AGY
Subjt:  VWGFKFLALSAYEDDYGARNLYSKAGY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTGGGAAGGTTTGGGGATTCAAATTTTTGGCATTAAGTGCATATGAAGATGATTATGGGGCTCGTAATTTGTATAGTAAAGCAGGCTATCAGTCTAAAACTCAGAT
GAATTCCCTAAGAAGAAACAAGAAAGAAAATGAAGTTTCAGAGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTAAGAAGGGATCAATTATTATTCCATGGGAGCAAAAGA
AAGAAATGATTGATAAAGAAGAAATTCAACTCCACAAAGACTTGGATCAACTTACAAATTGGATAAAAATGGTGGATTCCATGAATGATGAGAAGCTGAAAGAATATCTA
CAAGATACACCACAAAAATTCAAGATTCTCAAAATCCCAAAGTGCAACCCTAAGCGCACTGGGCAAAAAATTGAGGATTCTAAATATTGGGCTTCTTACGGGATAATGGC
TTCTGTTTGGAAGTTTCACAAGCAAGACAATGACCAGCAGCTTTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTGGGAAGGTTTGGGGATTCAAATTTTTGGCATTAAGTGCATATGAAGATGATTATGGGGCTCGTAATTTGTATAGTAAAGCAGGCTATCAGTCTAAAACTCAGAT
GAATTCCCTAAGAAGAAACAAGAAAGAAAATGAAGTTTCAGAGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTAAGAAGGGATCAATTATTATTCCATGGGAGCAAAAGA
AAGAAATGATTGATAAAGAAGAAATTCAACTCCACAAAGACTTGGATCAACTTACAAATTGGATAAAAATGGTGGATTCCATGAATGATGAGAAGCTGAAAGAATATCTA
CAAGATACACCACAAAAATTCAAGATTCTCAAAATCCCAAAGTGCAACCCTAAGCGCACTGGGCAAAAAATTGAGGATTCTAAATATTGGGCTTCTTACGGGATAATGGC
TTCTGTTTGGAAGTTTCACAAGCAAGACAATGACCAGCAGCTTTCTTAATACTTTAATTACTTGCCAAATATTTTTAAATGTAGTTTTAATTTTGTTGAAGAAATTAATG
AGAAAGATGTAGTAAATTATTAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLGKVWGFKFLALSAYEDDYGARNLYSKAGYQSKTQMNSLRRNKKENEVSEMKKKKKKKKIKKGSIIIPWEQKKEMIDKEEIQLHKDLDQLTNWIKMVDSMNDEKLKEYL
QDTPQKFKILKIPKCNPKRTGQKIEDSKYWASYGIMASVWKFHKQDNDQQLS