CuGenDBv2

Gene ID	Lsi02G023460
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Shikimate_dh_N domain-containing protein
Genome location	chr02:30097100..30098619
RNA-Seq Expression	Lsi02G023460
Synteny	Lsi02G023460
Gene Ontology terms	GO:0003855 - 3-dehydroquinate dehydratase activity (molecular function) GO:0004764 - shikimate 3-dehydrogenase (NADP+) activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004148887.1 uncharacterized protein LOC101222027 [Cucumis sativus]

9.6e-78

81.87

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P ++HVSITNSS+    FS P  SRKRAI F   CPQI+HCN   H Q T RSYIRNGPPYGEEDDDPE++VESLRVPD+WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNV+ISKVAA SYYNSLLKK T+LG+ILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

XP_008451429.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492727 [Cucumis melo]

6.0e-80

84.62

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P S+HVSITNSS F   FS   +SRKRAINF   CPQ LH NG  H Q T RSYIRNGPPYGEEDDDPE++VESLRVPD+WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKK T+LG+ILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

XP_022150155.1 uncharacterized protein LOC111018405 [Momordica charantia]

2.2e-82

84.62

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+PAS+HVS++NSS F SDF +P T+ KRAINF++SCPQILH NG+RH Q TPRSY R GPPYGEEDDDPE+QVESLRVPDDWSVP+KALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEIS+VAANSYYNSLL+KRT+LGDILL MARELESISYKESFHGAF +ANAAVNLIAQ+IELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

XP_023515033.1 uncharacterized protein LOC111779179 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.6e-77

84.07

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLILVP+S+HVSITNSS F SDFS+  TSRKRA+NF++S PQIL CN +   + TPRSYIR GPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLL+KRTEL DILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

XP_038896861.1 uncharacterized protein LOC120085084 [Benincasa hispida]

9.2e-89

91.21

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+PAS+HV ITNSSLF S FS+P TSRKRAINFQ  CPQILHCNGLRH Q TPRSYI NGPPYGEEDDDPE+QVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LR TLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRT+LGDILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K5Q9 Uncharacterized protein

4.6e-78

81.87

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P ++HVSITNSS+    FS P  SRKRAI F   CPQI+HCN   H Q T RSYIRNGPPYGEEDDDPE++VESLRVPD+WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNV+ISKVAA SYYNSLLKK T+LG+ILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

A0A1S3BS97 uncharacterized protein LOC103492727

2.9e-80

84.62

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P S+HVSITNSS F   FS   +SRKRAINF   CPQ LH NG  H Q T RSYIRNGPPYGEEDDDPE++VESLRVPD+WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKK T+LG+ILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

A0A5D3D403 Uncharacterized protein

2.9e-80

84.62

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P S+HVSITNSS F   FS   +SRKRAINF   CPQ LH NG  H Q T RSYIRNGPPYGEEDDDPE++VESLRVPD+WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKK T+LG+ILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1D9Y8 uncharacterized protein LOC111018405

1.1e-82

84.62

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+PAS+HVS++NSS F SDF +P T+ KRAINF++SCPQILH NG+RH Q TPRSY R GPPYGEEDDDPE+QVESLRVPDDWSVP+KALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEIS+VAANSYYNSLL+KRT+LGDILL MARELESISYKESFHGAF +ANAAVNLIAQ+IELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1H695 uncharacterized protein LOC111460840

5.1e-77

83.52

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLILVP+S+HVSITNSS F SDF +  TSRKRA+NF++S PQIL CN +   + TPRSYIR GPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLL+KRTEL DILLNMARELESISYKESFHGAFS+ANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIELS

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G03150.1 unknown protein

1.5e-41

46.96

Show/hide

Query:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYI-RNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESE
        M S +    +++V  ++          P T R+R+++F ++  +      +    K P   + ++     E ++D E  V++L +P++W +PS+A+EESE
Subjt:  MESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYI-RNGPPYGEEDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESE

Query:  WLRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIE
        WLRVTLHKWLDDEYCPE TNVEIS+VAA SYY+SLL+K +++G+ILL MA++L SISY+ESFHGAF++ANAA+NLI  RIE
Subjt:  WLRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

GTTGAGCTCAGCGATCACTATAATTCATCCAATTTCACCGATAAATCATATCCACACGTCTCAATCGCCCTGCCATCAACTGTTTGGGAGCTTGGAAAATCACAGAGAAC
ACAGCAAGAAATGGAGTCTCTGATTTTGGTTCCAGCCAGTCAACACGTTTCAATCACAAATTCTTCTCTATTCTTCTCCGATTTCTCCCTTCCACTAACTTCTAGAAAGC
GCGCCATCAATTTTCAATCATCTTGTCCGCAGATTCTCCATTGCAATGGCCTTCGACACGGGCAAAAAACTCCGAGGTCTTATATTCGAAATGGCCCGCCGTATGGAGAG
GAAGACGATGATCCTGAAATGCAGGTTGAAAGCCTCAGGGTTCCTGATGATTGGTCGGTTCCTTCCAAGGCATTGGAGGAATCAGAATGGCTTAGGGTTACCTTGCACAA
ATGGTTAGATGATGAGTATTGTCCAGAGGAAACTAATGTAGAGATAAGCAAGGTTGCTGCAAATTCATACTACAATTCTTTGTTAAAGAAGAGGACAGAGCTAGGCGATA
TTTTGTTGAATATGGCAAGAGAATTGGAATCTATTTCCTACAAGGAAAGTTTTCATGGTGCATTCTCTGCTGCCAATGCAGCAGTGAACTTAATTGCTCAGAGAATAGAG
CTGTCTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

VELSDHYNSSNFTDKSYPHVSIALPSTVWELGKSQRTQQEMESLILVPASQHVSITNSSLFFSDFSLPLTSRKRAINFQSSCPQILHCNGLRHGQKTPRSYIRNGPPYGE
EDDDPEMQVESLRVPDDWSVPSKALEESEWLRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLKKRTELGDILLNMARELESISYKESFHGAFSAANAAVNLIAQRIE
LS

Lsi02G023460 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome