; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G023850 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G023850
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationchr02:30527567..30527923
RNA-Seq ExpressionLsi02G023850
SyntenyLsi02G023850
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.1e-4377.97Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA K+S  L F FIA  LTV ST VL T+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMDDIEF+M+S+INRRILAD+NYISYDAL+AN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]4.1e-4378.81Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA  VS  L  F +  ILTVSSTA      KTPSWVLDGA A CHGSMAECMM+DIEF+M+S+INRRILADLNYISYDALKAN+VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGCNAISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]5.7e-4580.51Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA KVS  L F  I  ILTVSSTAV   ST++PSWVLDGARA CHGSMAECMMD+IE+EMNS+INRRILA  NYISY+ALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]5.3e-4377.97Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA K+S  L F FIA  LTV STAV  T+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMDDIEF+M+S+INRRILAD+NYISYDAL+AN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]2.8e-5291.53Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA KVS  L FF +A ILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARA CHGSMAECMM DIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGCNAISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein2.0e-4378.81Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA  VS  L  F +  ILTVSSTA      KTPSWVLDGA A CHGSMAECMM+DIEF+M+S+INRRILADLNYISYDALKAN+VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGCNAISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like6.3e-4277.12Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA KVS  L  F +  ILTVSSTA       TPSWVL GA A CHGSMAECM +DIEFEM+S+INRRILADLNYISYDAL+AN+VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGCNAISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like6.3e-4277.12Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA KVS  L  F +  ILTVSSTA       TPSWVL GA A CHGSMAECM +DIEFEM+S+INRRILADLNYISYDAL+AN+VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGCNAISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 332.7e-4580.51Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA KVS  L F  I  ILTVSSTAV   ST++PSWVLDGARA CHGSMAECMMD+IE+EMNS+INRRILA  NYISY+ALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like2.6e-4377.97Show/hide
Query:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG
        MA K+S  L F FIA  LTV STAV  T+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMDDIEF+M+S+INRRILAD+NYISYDAL+AN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCNAISRCRS
        AEANPY+RGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCNAISRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.0e-2456.6Show/hide
Query:  IATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMD--DIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCN
        I  ILTV       TS  +  +V     + C+G++AEC +   + EFEM+S+INRRILA   YISY AL+ NTVPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY+RGC+
Subjt:  IATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMD--DIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCN

Query:  AISRCR
        AI+RCR
Subjt:  AISRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor1.8e-2562.35Show/hide
Query:  WVLDG-ARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCRS
        WV+   +   C GS+ EC+ ++ EFE++S+ NRRILA   YISY AL+ N+VPCSRRGASYYNC+PGA+ANPY+RGC+AI+RCRS
Subjt:  WVLDG-ARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.2e-2147.29Show/hide
Query:  SSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTP-SWVLDGARAHCHGSMAECMMD-------DI---------EFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +        D+         EFEM+S+INRRILA   YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTP-SWVLDGARAHCHGSMAECMMD-------DI---------EFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCS

Query:  RRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCR
        RRGASYYNC+ GA+ANPY+RGC+AI+RCR
Subjt:  RRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 224.8e-2352.21Show/hide
Query:  FFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARA-------HCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEAN
        + +  IL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ ++ E E +SDI+RRILA   YISY A++ N+VPCSRRGASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARA-------HCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCNAISRCR
        PY+RGC+ I+RCR
Subjt:  PYNRGCNAISRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 12.0e-2463.95Show/hide
Query:  SWVLDGAR-AHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCRS
        +W   G   + CHGS+AEC+  + E EM+S+INRRILA   YISY +LK N+VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+RGC+ I+RCRS
Subjt:  SWVLDGAR-AHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.4e-2563.95Show/hide
Query:  SWVLDGAR-AHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCRS
        +W   G   + CHGS+AEC+  + E EM+S+INRRILA   YISY +LK N+VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+RGC+ I+RCRS
Subjt:  SWVLDGAR-AHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCRS

AT1G28270.1 ralf-like 41.5e-1457.81Show/hide
Query:  DDIEFEMNSDINRRILA-DLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRC
        D++E  M+S+ NRR LA    YI YDALK N VPCSRRG SYY+C+     NPY RGC+AI+ C
Subjt:  DDIEFEMNSDINRRILA-DLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRC

AT3G05490.1 ralf-like 223.4e-2452.21Show/hide
Query:  FFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARA-------HCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEAN
        + +  IL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ ++ E E +SDI+RRILA   YISY A++ N+VPCSRRGASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARA-------HCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCNAISRCR
        PY+RGC+ I+RCR
Subjt:  PYNRGCNAISRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 238.5e-2347.29Show/hide
Query:  SSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTP-SWVLDGARAHCHGSMAECMMD-------DI---------EFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +        D+         EFEM+S+INRRILA   YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTP-SWVLDGARAHCHGSMAECMMD-------DI---------EFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCS

Query:  RRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCR
        RRGASYYNC+ GA+ANPY+RGC+AI+RCR
Subjt:  RRGASYYNCQPGAEANPYNRGCNAISRCR

AT4G15800.1 ralf-like 331.4e-2556.6Show/hide
Query:  IATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMD--DIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCN
        I  ILTV       TS  +  +V     + C+G++AEC +   + EFEM+S+INRRILA   YISY AL+ NTVPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY+RGC+
Subjt:  IATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMD--DIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGCN

Query:  AISRCR
        AI+RCR
Subjt:  AISRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCCCAAGGTTTCTTCTCCCCTGCTATTTTTCTTTATCGCTACAATCCTGACGGTCTCCTCCACCGCGGTATTGACCACCAGCACCAAGACCCCGAGCTGGGTCCT
GGATGGAGCTCGAGCTCACTGTCATGGCTCCATGGCAGAGTGCATGATGGATGATATTGAATTTGAGATGAACTCCGATATCAATAGACGCATATTGGCAGATTTAAACT
ACATAAGCTATGACGCACTCAAGGCCAACACGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTACAACCGTGGCTGC
AATGCTATTTCTCGTTGCCGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGCCCAAGGTTTCTTCTCCCCTGCTATTTTTCTTTATCGCTACAATCCTGACGGTCTCCTCCACCGCGGTATTGACCACCAGCACCAAGACCCCGAGCTGGGTCCT
GGATGGAGCTCGAGCTCACTGTCATGGCTCCATGGCAGAGTGCATGATGGATGATATTGAATTTGAGATGAACTCCGATATCAATAGACGCATATTGGCAGATTTAAACT
ACATAAGCTATGACGCACTCAAGGCCAACACGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTACAACCGTGGCTGC
AATGCTATTTCTCGTTGCCGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKVSSPLLFFFIATILTVSSTAVLTTSTKTPSWVLDGARAHCHGSMAECMMDDIEFEMNSDINRRILADLNYISYDALKANTVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGC
NAISRCRS