; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G025730 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G025730
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF538
Genome locationchr02:32176872..32178910
RNA-Seq ExpressionLsi02G025730
SyntenyLsi02G025730
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007493 - Protein of unknown function DUF538
IPR036758 - At5g01610-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646401.1 hypothetical protein Csa_016514 [Cucumis sativus]9.9e-6591.91Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPK GGIVK+GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKE+GYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYD+EITG++LNKRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAG
        PPVNDI ++DP TGKIHFKSLAGVTKTFP+QAFAAG
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAG

XP_004136119.1 uncharacterized protein LOC101210896 [Cucumis sativus]2.6e-6591.97Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPK GGIVK+GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKE+GYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYD+EITG++LNKRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDI ++DP TGKIHFKSLAGVTKTFP+QAFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

XP_008461296.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499927 [Cucumis melo]2.4e-6692.7Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPK GGIVK+GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKE+GYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYD+EITG++LNKRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDI++DDP TGKIHFKSLAGVTKTFP+QAFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

XP_022986045.1 uncharacterized protein LOC111483899 [Cucurbita maxima]6.4e-6489.78Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPKEGGIVK G EEGL LA+ALLKEFELPEGLLPLADV EVGYVK++GYVWIVQRKKVEH FKMVSKLVSYD+EITG++L KRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDIY+DDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPV+AFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

XP_038896279.1 uncharacterized protein LOC120084552 [Benincasa hispida]1.4e-6694.16Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPKEGGIVKRG EEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKE+GYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITG++LNKRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDIY+DD  TGKIHFKSLAGVTKTFP+QAFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBG0 Uncharacterized protein1.3e-6591.97Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPK GGIVK+GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKE+GYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYD+EITG++LNKRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDI ++DP TGKIHFKSLAGVTKTFP+QAFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

A0A1S3CE01 uncharacterized protein LOC1034999271.1e-6692.7Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPK GGIVK+GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKE+GYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYD+EITG++LNKRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDI++DDP TGKIHFKSLAGVTKTFP+QAFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

A0A5D3CFZ8 Uncharacterized protein1.1e-6692.7Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPK GGIVK+GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKE+GYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYD+EITG++LNKRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDI++DDP TGKIHFKSLAGVTKTFP+QAFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

A0A6J1D7L8 uncharacterized protein LOC1110180201.2e-6391.73Show/hide
Query:  KEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVN
        KEGG+VK+G EEGLELAV+LL+EFELPEGLLPLA+VVEVGYVKE+GYVWI+QRKKVEHEFKMVSKLVSYD+EITGY+LNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVN
Subjt:  KEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVN

Query:  DIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        DI VDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
Subjt:  DIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

A0A6J1JCY7 uncharacterized protein LOC1114838993.1e-6489.78Show/hide
Query:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW
        MADPKEGGIVK G EEGL LA+ALLKEFELPEGLLPLADV EVGYVK++GYVWIVQRKKVEH FKMVSKLVSYD+EITG++L KRIKKLKGVKAKEFLLW
Subjt:  MADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLW

Query:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ
        PPVNDIY+DDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPV+AFAAGQ
Subjt:  PPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09310.1 Protein of unknown function, DUF5385.5e-2950.41Show/hide
Query:  GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVNDIYVDDPP
        G E   E     LKE  +P GLLPL D+ EVGY +ESG VW+ Q+K + H+F  + KLVSY +E+T  +   +IKKL GVKAKE L+W  +N+IY ++PP
Subjt:  GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVNDIYVDDPP

Query:  TGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF
        T KI FK+   +++TFPV AF
Subjt:  TGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF

AT1G30020.1 Protein of unknown function, DUF5381.9e-2148.35Show/hide
Query:  LELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVNDIYV
        L+ A  LL   +LP GLLPL D+ EVGY K  G+VW+  R K+EH F+ + + V YD+EIT ++ ++R+++L GVK+KE ++W PVNDI++
Subjt:  LELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVNDIYV

AT1G56580.1 Protein of unknown function, DUF5381.5e-2645.9Show/hide
Query:  GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVNDIYVDDP-
        G E   E     LKE  +P GLLPL D+ EVGY +E+G VW+ Q+K + H+F+ + KLVSY +E+   +   +IKKL GVKAKE L+W  +N++ ++ P 
Subjt:  GQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVNDIYVDDP-

Query:  PTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF
         +GKI+F++  G+++TFPV AF
Subjt:  PTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF

AT4G24130.1 Protein of unknown function, DUF5382.6e-2336.57Show/hide
Query:  IMADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLL
        ++   +EG  +  G EE  + ++ LL+E   P+G++PL ++VE G V+ +GYVW+ Q    EH F+  +  VSY  E+T Y+    +KK+ GVK+K+  L
Subjt:  IMADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLL

Query:  WPPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF
        W P+ ++ +++P + KI+FK+  G+ ++FPV  F
Subjt:  WPPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF

AT5G46230.1 Protein of unknown function, DUF5386.7e-2740.15Show/hide
Query:  ADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWP
        +D +EG  +  G+    + A  +L    LP+GLLPL ++ E+G+ K +GYVWI  + KV+H FK + + VSYDSE+T  + N+R+ +L G+K+KE L+W 
Subjt:  ADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFKMVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWP

Query:  PVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF
         +++I+V+     +I F +  G+++TFPV AF
Subjt:  PVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCACAAACGTCCCCATGACGATACCCTAACGGCTCAGTACGGCTCCGTCATGGTTAAGAATTTGATCATCCATTCCTGCAATTATATTTTATTTGTTCTTCAACACAC
ACACACAGTGAAAGTAACAAGAATAATGGCAGATCCAAAAGAAGGTGGGATAGTGAAAAGAGGGCAAGAGGAAGGGCTTGAACTGGCGGTAGCCCTTCTGAAAGAGTTCG
AGTTGCCGGAGGGGCTGCTCCCACTGGCCGACGTGGTGGAAGTCGGGTACGTGAAGGAGAGTGGCTACGTTTGGATTGTGCAGAGGAAAAAAGTGGAGCACGAGTTCAAA
ATGGTGAGTAAGTTAGTGAGTTATGACTCGGAGATTACTGGGTACATGTTGAATAAGAGAATTAAGAAACTTAAGGGCGTTAAGGCTAAAGAGTTTCTGCTTTGGCCACC
TGTTAATGATATCTACGTCGATGATCCTCCCACAGGAAAGATTCACTTCAAGAGCCTTGCTGGCGTCACCAAAACTTTCCCGGTTCAAGCCTTTGCTGCAGGCCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCACAAACGTCCCCATGACGATACCCTAACGGCTCAGTACGGCTCCGTCATGGTTAAGAATTTGATCATCCATTCCTGCAATTATATTTTATTTGTTCTTCAACACAC
ACACACAGTGAAAGTAACAAGAATAATGGCAGATCCAAAAGAAGGTGGGATAGTGAAAAGAGGGCAAGAGGAAGGGCTTGAACTGGCGGTAGCCCTTCTGAAAGAGTTCG
AGTTGCCGGAGGGGCTGCTCCCACTGGCCGACGTGGTGGAAGTCGGGTACGTGAAGGAGAGTGGCTACGTTTGGATTGTGCAGAGGAAAAAAGTGGAGCACGAGTTCAAA
ATGGTGAGTAAGTTAGTGAGTTATGACTCGGAGATTACTGGGTACATGTTGAATAAGAGAATTAAGAAACTTAAGGGCGTTAAGGCTAAAGAGTTTCTGCTTTGGCCACC
TGTTAATGATATCTACGTCGATGATCCTCCCACAGGAAAGATTCACTTCAAGAGCCTTGCTGGCGTCACCAAAACTTTCCCGGTTCAAGCCTTTGCTGCAGGCCAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MHKRPHDDTLTAQYGSVMVKNLIIHSCNYILFVLQHTHTVKVTRIMADPKEGGIVKRGQEEGLELAVALLKEFELPEGLLPLADVVEVGYVKESGYVWIVQRKKVEHEFK
MVSKLVSYDSEITGYMLNKRIKKLKGVKAKEFLLWPPVNDIYVDDPPTGKIHFKSLAGVTKTFPVQAFAAGQ