; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G026000 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G026000
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description60S ribosomal protein L6
Genome locationchr02:32399466..32400962
RNA-Seq ExpressionLsi02G026000
SyntenyLsi02G026000
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0002181 - cytoplasmic translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000915 - 60S ribosomal protein L6E
IPR005568 - Ribosomal protein L6, N-terminal
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR041997 - Ribosomal Protein L6, KOW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_011659463.1 60S ribosomal protein L6-1 [Cucumis sativus]2.6e-11896.97Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PKA APAEK PKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNS+KFDDKYFSKE QKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPA+KKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIE VPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

XP_022954334.1 60S ribosomal protein L6-3-like [Cucurbita moschata]3.4e-11896.54Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK KADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKVDISGVN++KFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSI+GVPELKAYL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

XP_022991926.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita maxima]1.0e-11997.4Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKVDISGVN++KFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIEGVPELKAYL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

XP_023548320.1 uncharacterized protein LOC111806995 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-11896.54Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHD K KADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKVDISGVN++KFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIEGVPELKAYL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

XP_038896966.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Benincasa hispida]8.9e-11996.97Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAP EK PKFYPADDVKKPLVNKRK KLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNS+KFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKS LPADKKDDQ+AVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIE VPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9V0 60S ribosomal protein L61.3e-11896.97Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PKA APAEK PKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNS+KFDDKYFSKE QKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPA+KKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIE VPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

A0A1S3CEA6 60S ribosomal protein L66.2e-11896.54Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKA  PAEK PKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNS+KFDDKYFSKE QKKKKK EGEFFEAEKEEKSALPA+KKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIE VPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1GSP4 60S ribosomal protein L6-3-like1.6e-11896.54Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK KADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKVDISGVN++KFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSI+GVPELKAYL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1H5C5 60S ribosomal protein L62.0e-11694.81Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PKADA  EK PKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKV+ISGVN++KFDDKYFSKEVQKKKKK EGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIEGVPELKAYL ARFSLK+GMKPHEL F
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1JS55 60S ribosomal protein L6-1-like5.1e-12097.4Show/hide
Query:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF
        MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKA+LTKLRASITPGTVLIILAGRF
Subjt:  MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSY IATSTKVDISGVN++KFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPAD+KDDQKAVDTPL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPL

Query:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IKSIEGVPELKAYL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P34091 60S ribosomal protein L61.3e-10182.02Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        + P V+RNP+L+RG+GKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFP+H  K       EK PKFYPADDVKKPL+NKRK K TKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVIATSTKVDISGVN +KFDDKYF K+ +KK KKGEGEFFEAEK+E + LP +KKDDQKAVD  L+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

Q2YGT9 60S ribosomal protein L61.5e-4746Show/hide
Query:  PRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPA-------------------EKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLT----K
        P  +RNP L+RG+G+YSRS MY ++ L+  K K      + + K K    A                    K P++YP +DV + L++  K   +    K
Subjt:  PRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPA-------------------EKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLT----K

Query:  LRASITPGTVLIILAGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVN-SDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEE
        LRASITPGT+LIIL GR +GKRV+FLKQL SGLLLVTGP  +N VPLRR +Q +VIATSTK+DISGV   +   D YF K+  +K +  EGE F+ EK E
Subjt:  LRASITPGTVLIILAGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVN-SDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEE

Query:  KSALPADKKDDQKAVDTPLIKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        K  +   +K DQKAVD+ +++ I+ VP+L+ YL + F+L  G+ PH+LVF
Subjt:  KSALPADKKDDQKAVDTPLIKSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C5 60S ribosomal protein L6-31.4e-10385.09Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K DAP EK PKFYPA+DVKKPL N+R AK TKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDISGV  DKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IE VPELK YLGARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C6 60S ribosomal protein L6-22.7e-10284.21Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +T +V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K DAP EK PKFYPA+DVKKPL N+R AK  KLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDISGV  DKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IE VPELK YLGARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

Q9FZ76 60S ribosomal protein L6-11.1e-10383.04Show/hide
Query:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFK
        A +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK DAP EK  KFYPA+DVKKPLVN+RK K TKL+ASITPGTVLIILAGRFK
Subjt:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DISGVN++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +P +KK+DQK VD  LI
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI

Query:  KSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        KSIE VPELK YLGARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18540.1 Ribosomal protein L6 family protein7.8e-10583.04Show/hide
Query:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFK
        A +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK DAP EK  KFYPA+DVKKPLVN+RK K TKL+ASITPGTVLIILAGRFK
Subjt:  APKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DISGVN++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +P +KK+DQK VD  LI
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLI

Query:  KSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        KSIE VPELK YLGARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74050.1 Ribosomal protein L6 family protein1.0e-10485.09Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +TP+V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K DAP EK PKFYPA+DVKKPL N+R AK TKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDISGV  DKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IE VPELK YLGARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74060.1 Ribosomal protein L6 family protein1.9e-10384.21Show/hide
Query:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK
        +T +V RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K DAP EK PKFYPA+DVKKPL N+R AK  KLRASITPGTVLIILAGRFKGK
Subjt:  KTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDISGV  DKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +P  KKDDQKAVD  LIK+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKS

Query:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF
        IE VPELK YLGARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEGVPELKAYLGARFSLKAGMKPHELVF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCCCAAAACCCCTAGAGTTACAAGAAACCCGGATCTAATCCGCGGTGTCGGCAAGTACTCGAGGTCTAAGATGTATCACAAGCGAGGTCTCTGGGCCATCAAGGC
CAAAAATGGCGGAGTGTTCCCTCGTCACGATGCCAAGCCGAAAGCTGATGCCCCAGCCGAGAAGTCACCTAAGTTTTACCCTGCCGATGATGTGAAGAAGCCCCTTGTTA
ACAAGCGCAAGGCCAAGCTCACGAAGCTCAGAGCTAGCATTACTCCTGGTACTGTGTTGATAATCCTTGCTGGAAGGTTCAAGGGGAAGAGAGTTGTGTTTTTGAAACAG
CTGCCATCTGGGTTGCTTTTGGTCACTGGGCCATTCAAGATCAATGGTGTTCCTCTAAGACGGGTGAACCAATCGTATGTGATTGCAACCTCCACCAAAGTTGACATCTC
TGGAGTGAACTCCGACAAGTTCGACGACAAGTACTTTTCCAAGGAAGTCCAGAAGAAGAAGAAGAAGGGTGAAGGGGAATTTTTTGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAAAGTG
CTCTGCCAGCTGACAAGAAGGATGACCAGAAAGCTGTGGATACACCATTGATAAAGTCGATCGAGGGGGTTCCAGAGTTGAAGGCTTACTTGGGAGCAAGATTTTCTCTC
AAGGCTGGAATGAAACCTCATGAGCTTGTCTTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGCCCAAAACCCCTAGAGTTACAAGAAACCCGGATCTAATCCGCGGTGTCGGCAAGTACTCGAGGTCTAAGATGTATCACAAGCGAGGTCTCTGGGCCATCAAGGC
CAAAAATGGCGGAGTGTTCCCTCGTCACGATGCCAAGCCGAAAGCTGATGCCCCAGCCGAGAAGTCACCTAAGTTTTACCCTGCCGATGATGTGAAGAAGCCCCTTGTTA
ACAAGCGCAAGGCCAAGCTCACGAAGCTCAGAGCTAGCATTACTCCTGGTACTGTGTTGATAATCCTTGCTGGAAGGTTCAAGGGGAAGAGAGTTGTGTTTTTGAAACAG
CTGCCATCTGGGTTGCTTTTGGTCACTGGGCCATTCAAGATCAATGGTGTTCCTCTAAGACGGGTGAACCAATCGTATGTGATTGCAACCTCCACCAAAGTTGACATCTC
TGGAGTGAACTCCGACAAGTTCGACGACAAGTACTTTTCCAAGGAAGTCCAGAAGAAGAAGAAGAAGGGTGAAGGGGAATTTTTTGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAAAGTG
CTCTGCCAGCTGACAAGAAGGATGACCAGAAAGCTGTGGATACACCATTGATAAAGTCGATCGAGGGGGTTCCAGAGTTGAAGGCTTACTTGGGAGCAAGATTTTCTCTC
AAGGCTGGAATGAAACCTCATGAGCTTGTCTTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKTPRVTRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKADAPAEKSPKFYPADDVKKPLVNKRKAKLTKLRASITPGTVLIILAGRFKGKRVVFLKQ
LPSGLLLVTGPFKINGVPLRRVNQSYVIATSTKVDISGVNSDKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPADKKDDQKAVDTPLIKSIEGVPELKAYLGARFSL
KAGMKPHELVF