; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G026250 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G026250
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationchr02:32672392..32673684
RNA-Seq ExpressionLsi02G026250
SyntenyLsi02G026250
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058670.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-12594.05Show/hide
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KAG6575655.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-12591.47Show/hide
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KAG7014205.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.5e-12591.47Show/hide
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XP_022953211.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita moschata]2.7e-12591.12Show/hide
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XP_038899359.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Benincasa hispida]2.2e-13295.72Show/hide
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        SCPLCRFKLPSDDPS+HVRCRRATTALLRARDL+HQEDSYGLRTTLEHMARRH SI+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK3 RING-type E3 ubiquitin transferase6.4e-12592.46Show/hide
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        CRFKLPSDDPS+ VRCR  T+ALLRARDLMHQEDSYGLRTTLE MARRHSSI
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase3.2e-12493.25Show/hide
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        S+AT+TA  AAERHTYWCHECDMSVTLVSP SSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSSP DSDPSSFVVVDP+PITSDD
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A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase9.8e-12694.05Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase1.3e-12591.12Show/hide
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        MSSASAAT     AAERHTYWCHECDMSVTLVSP  SSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSPPDSDPSSFV+VDP+
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        P TSDDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDF PSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKV+SA+LEEDP+LICAICKD+FLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSN
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        HDSCPLCR+KLPSD+PS+HVRCR AT ALLRARDLM QEDSYGLRTTLEHMARRHSSIF
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase4.9e-12591.09Show/hide
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        MSSASAAT     AAERHTYWCHECDMSVTLVSP SSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSPPDSDPSSFV+VDP+P
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Query:  ITSDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNH
         TSDDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDF PSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKV+SA+LEEDP+LICAICKD+FLL+VEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNH
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Query:  DSCPLCRFKLPSDDPSEHVRCRRATTALLRARDLMHQEDSYGLRTTLEHMARRHSSIF
        DSCPLCR+KLPSD+PS+HVRCR AT ALLRARDLM QEDSYGLRTTLEHMARRHSSIF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A1.2e-1642.57Show/hide
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        P    LF+QL+  +     P  P       ++++ A+PTIK+    L       C +CKD+F L  EAKQ+PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  S
        S
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O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A2.9e-1331.94Show/hide
Query:  PSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMD---------FTIPTSSSSISDHPNSSSSPPDSDPSSFVVVDPIPITSDDNYLLNSPQFLRLFQQLA--D
        PSSSSS+ S+S  + +   P  +T    +                SS  +S+  + S+     D  +   + P+P  S   +LL S  F RL  Q++  +
Subjt:  PSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMD---------FTIPTSSSSISDHPNSSSSPPDSDPSSFVVVDPIPITSDDNYLLNSPQFLRLFQQLA--D

Query:  SSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDD
         + +  + S    P +  K+++ A+P I++    L  D    CA+CK+ F+L+  A+++PC+H+YHPDCILPWL+  +SCP+CR +LP++D
Subjt:  SSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDD

P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING13.4e-1432.43Show/hide
Query:  DMSVTLVSPSSS------SSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSS-----------SSISDHPNSSSSPPDSDPSSFVVVD-------PIPIT
        D+ +TL  P +S       SSSS+++SSS+ + P+       +   + PT S           + I +H N   S        FV+ +        +P  
Subjt:  DMSVTLVSPSSS------SSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSS-----------SSISDHPNSSSSPPDSDPSSFVVVD-------PIPIT

Query:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS
          D ++   P   +L QQLA+ +D +   + P +     K+++ A+P + +T + L  +    CA+C D F    EAKQ+PC HLYH DC+LPWL  H+S
Subjt:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS

Query:  CPLCRFKLPSDDPSEHVRCRRA
        CP+CR +LP+DDP    R R A
Subjt:  CPLCRFKLPSDDPSEHVRCRRA

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like2.1e-1630.11Show/hide
Query:  MSSASAATVTATTAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS-PPDSDPSSFVV----
        MSS   +T +A  A E    ++C++C+ +VT+           S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +PNSS S  P +DP S ++    
Subjt:  MSSASAATVTATTAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS-PPDSDPSSFVV----

Query:  -------------------VDPIPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FVPSV-----------PFNPF
                           + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    
Subjt:  -------------------VDPIPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FVPSV-----------PFNPF

Query:  TP--IKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDP
        TP   K+++ A+PT+KVT  +L+ + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP
Subjt:  TP--IKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDP

Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF11.1e-1744.55Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK+T   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein1.0e-1845.28Show/hide
Query:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVTSALL----EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP--
        S F  S PF    NPF   + S     + ++PTIK++S++L     +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP  
Subjt:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVTSALL----EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP--

Query:  -SDDPS
         S+D S
Subjt:  -SDDPS

AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein7.9e-1944.55Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK+T   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein7.9e-1944.55Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK+T   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  S
        S
Subjt:  S

AT3G56580.3 RING/U-box superfamily protein7.9e-1944.55Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK+T   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  S
        S
Subjt:  S

AT3G60080.1 RING/U-box superfamily protein8.4e-4540.36Show/hide
Query:  MSSASAATVTATTAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISD------HPNSSSSPPDSDPSSFVV
        MSS++  T T     ER TYWCHECDMS++L+      SSS S S SS LLCP C  DFLE MD    +SSS++ D            +  + D   +  
Subjt:  MSSASAATVTATTAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISD------HPNSSSSPPDSDPSSFVV

Query:  VDPIPITSDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKAS-VMAIPTIKVTSALL------EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLY
        VDP  + SDDN+LL+SP   RL + LA  +      S   +  + +K+S + +IPTI+++S+LL      + D VL+CA+CK+ F++   A++LPCSH+Y
Subjt:  VDPIPITSDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFVPSVPFNPFTPIKAS-VMAIPTIKVTSALL------EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLY

Query:  HPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPS------DDPSEHVRCRRATTALLRARDLMHQEDSYGLRTTLEHMARRHSSI
        H DCI+PWLS+H+SCPLCRF+LP+            +R R +  A + A     ++D  G+R  L  +ARRH  +
Subjt:  HPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPS------DDPSEHVRCRRATTALLRARDLMHQEDSYGLRTTLEHMARRHSSI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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