; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G027150 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G027150
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr02:33489344..33492196
RNA-Seq ExpressionLsi02G027150
SyntenyLsi02G027150
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593392.1 hypothetical protein SDJN03_12868, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-4175.81Show/hide
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XP_023004358.1 uncharacterized protein LOC111497700 isoform X1 [Cucurbita maxima]2.4e-4175.81Show/hide
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XP_038899182.1 uncharacterized protein LOC120086544 [Benincasa hispida]4.7e-5388.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8T0 Uncharacterized protein8.6e-5385.83Show/hide
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A0A1S3CE06 uncharacterized protein LOC1034997982.6e-4984.55Show/hide
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A0A6J1CXJ1 uncharacterized protein LOC1110151782.6e-4172.95Show/hide
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A0A6J1H516 uncharacterized protein LOC111460643 isoform X11.5e-4175.81Show/hide
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A0A6J1KZ93 uncharacterized protein LOC111497700 isoform X11.2e-4175.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G52550.1 unknown protein6.1e-1134.13Show/hide
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AT3G15780.1 unknown protein1.7e-1343.01Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTTGCATCGTCGCCGCCTTTCATATCTCTTGCTCTCCTCCGATTCTTCTGCTAAATCGGCCGTTTGCAGCGCAGCAGTACGGCCGCCACCGGACTCCGATCCGCCTCCCG
AGGACGATCCGATTCGTCTAACAGGTTTTCCAGCAATTTTCTCAAAATTTCGGGACAGAGTACAAATTTTCCTTGCTGTGTTATTCTGGATGTCTCTCTTCTTCTGGACT
TCTGCATTAGATGGAAAAAGTAAACCTAATAAGGGCTCTCGATTTAGACGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAATAACTTAAGAATCGTGGGTGGTTTCTCTCTCTTCGTAATGGCAACGCTCTCAAGCTCTCTCCACCGTTCTTCACAGTCCGTTACCGCCTCTTCAATCGCCCTTCCTC
TCTGTTCAACCTTCCATACTCGGCCGGAAATCTGCTTCTCTTTGCATCGTCGCCGCCTTTCATATCTCTTGCTCTCCTCCGATTCTTCTGCTAAATCGGCCGTTTGCAGC
GCAGCAGTACGGCCGCCACCGGACTCCGATCCGCCTCCCGAGGACGATCCGATTCGTCTAACAGGTTTTCCAGCAATTTTCTCAAAATTTCGGGACAGAGTACAAATTTT
CCTTGCTGTGTTATTCTGGATGTCTCTCTTCTTCTGGACTTCTGCATTAGATGGAAAAAGTAAACCTAATAAGGGCTCTCGATTTAGACGATAGTTTCGTAAACAAGCAT
TCTTTTGTAAAGGATTGTAGGTTAATATAATAGTGTTAGGCTACTTGATTAAATCTAAAGATATACTTCAGCCTTTGACGAGGTAGATAAAGCTTGCTCCATGATGTTGA
TACCAAAGATGCAAGGCTGTATACCCTGTATATTGTGTAGCTGCAAAGGAGATACTGAATGGAATGGTTATAATAAATGAAAGTGAAACTGTCATGGAAAGTCGTATTTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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