| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004135834.1 probable histone H2A variant 3 isoform X2 [Cucumis sativus] | 4.1e-59 | 84.18 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_010033915.1 probable histone H2A variant 3 [Eucalyptus grandis] | 7.1e-59 | 84.18 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSASN+KDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022152569.1 probable histone H2A variant 3 [Momordica charantia] | 1.9e-59 | 84.81 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022953233.1 probable histone H2A variant 3 [Cucurbita moschata] | 4.1e-59 | 84.18 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_031406453.1 probable histone H2A variant 3 [Punica granatum] | 6.6e-57 | 83.54 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSA NKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K6F6 Histone H2A | 2.0e-59 | 84.18 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A5D3CH66 Histone H2A | 2.0e-59 | 84.18 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1DGE3 Histone H2A | 9.0e-60 | 84.81 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1GMV1 Histone H2A | 2.0e-59 | 84.18 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1JQN2 Histone H2A | 2.0e-59 | 84.18 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQ FPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23628 Histone H2A variant 1 | 2.1e-53 | 71.88 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
M+GKG KGL+ K +A+ +KDKDKKKP+SRS+RAG+Q FPVGR+HRQLK+RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAE
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
Query: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q84MP7 Probable histone H2A variant 3 | 3.0e-52 | 73.29 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTA
M+GKG KGL+ K+ S KDK KK PVSRSSRAGLQ FPVGR+HRQLK R ANGRVGATAAVY+AAILEYLTA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTA
Query: EVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
EVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: EVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8H7Y8 Probable histone H2A variant 1 | 3.0e-52 | 73.46 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLT
M+GKG KGL+ K+ S +KDKDKKK PVSRSSRAGLQ FPVGR+HRQLKSR +A+GRVGATAAVY+AAILEYLT
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLT
Query: AEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK+SKE
Subjt: AEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8S857 Probable histone H2A variant 2 | 2.3e-52 | 72.39 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKS----ASNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYL
M+GKG KGL+ K+ A+ +KDKD+KK PVSRSSRAG+Q FPVGR+HRQLK RV+ANGRVGATAAVYTAAILEYL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKS----ASNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYL
Query: TAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
TAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: TAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q9C944 Probable histone H2A variant 3 | 1.3e-55 | 75.95 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGK + ++KDKDKKKP++RSSRAGLQ FPVGRVHR LK+R A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G52740.1 histone H2A protein 9 | 9.2e-57 | 75.95 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
MSGKGAKGLIMGK + ++KDKDKKKP++RSSRAGLQ FPVGRVHR LK+R A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVL
Query: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
ELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: ELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.1 histone H2A 8 | 1.2e-51 | 70 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
M+GKG KGL+ K +A+ NKD KKK +SRSSRAG+Q FPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAE
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
Query: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.2 histone H2A 8 | 1.2e-51 | 70 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
M+GKG KGL+ K +A+ NKD KKK +SRSSRAG+Q FPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAE
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
Query: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.3 histone H2A 8 | 1.2e-51 | 70 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
M+GKG KGL+ K +A+ NKD KKK +SRSSRAG+Q FPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAE
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
Query: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT3G54560.1 histone H2A 11 | 1.5e-54 | 71.88 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
M+GKG KGL+ K +A+ +KDKDKKKP+SRS+RAG+Q FPVGR+HRQLK+RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAE
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQRSRNSMRSSVDESFGGVRLRIFRGFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAE
Query: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: VLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
