; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi02G029300 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi02G029300
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionBeta-galactosidase
Genome locationchr02:35501239..35501704
RNA-Seq ExpressionLsi02G029300
SyntenyLsi02G029300
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016592 - mediator complex (cellular component)
GO:0048046 - apoplast (cellular component)
GO:0003712 - transcription coregulator activity (molecular function)
GO:0004565 - beta-galactosidase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GFY97164.1 hypothetical protein Acr_11g0014700 [Actinidia rufa]2.9e-0979.25Show/hide
Query:  SCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGF
        SCFDP  AAVAAAVMAA AAP FAPPAAF  PA  ANAAIPPTS A +ATVGF
Subjt:  SCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGF

KAF2323557.1 hypothetical protein GH714_036098 [Hevea brasiliensis]9.0e-1173.77Show/hide
Query:  ESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM
        E+SF SCFDP  AA+AA VMA  AAP+ APPAAFIAPA  AN AIPPTS A KATVGFTA+
Subjt:  ESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM

KAF5751271.1 hypothetical protein HS088_TW02G00283 [Tripterygium wilfordii]6.7e-1474.63Show/hide
Query:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM
        +FG  + +SF SC DP  AA+AAAVMAA AAPNFAPPAAFIAPAILA AAIPPTS A KATVGFT++
Subjt:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM

OMO70788.1 Glycoside hydrolase, family 35 [Corchorus capsularis]4.8e-1269.12Show/hide
Query:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAMF
        +F  CL++SF SCFDP  AA AAAVMA  AAP+FAPPAAFIAPA  AN A PPTS A  ATVG TA+F
Subjt:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAMF

TQE07827.1 hypothetical protein C1H46_006586 [Malus baccata]1.0e-0673.21Show/hide
Query:  SCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM
        SC  P  AAVAAAVMAA A P  APPAA  APA LANAAIPPT+ A KATVGFTA+
Subjt:  SCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A9AVP8 Uncharacterized protein7.7e-0856.76Show/hide
Query:  PKLQRGVHFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM
        P +    HF    E S +  F P  AA AAAV AA AAP F PPAAFIAPAI ANAA PPT  AR+AT+G  +M
Subjt:  PKLQRGVHFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM

A0A1R3HKH2 Beta-galactosidase2.3e-1269.12Show/hide
Query:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAMF
        +F  CL++SF SCFDP  AA AAAVMA  AAP+FAPPAAFIAPA  AN A PPTS A  ATVG TA+F
Subjt:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAMF

A0A6A6NEJ0 Beta-galactosidase4.4e-1173.77Show/hide
Query:  ESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM
        E+SF SCFDP  AA+AA VMA  AAP+ APPAAFIAPA  AN AIPPTS A KATVGFTA+
Subjt:  ESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM

A0A7J0FEN3 Uncharacterized protein1.4e-0979.25Show/hide
Query:  SCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGF
        SCFDP  AAVAAAVMAA AAP FAPPAAF  PA  ANAAIPPTS A +ATVGF
Subjt:  SCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGF

A0A7J7DYC5 Uncharacterized protein3.2e-1474.63Show/hide
Query:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM
        +FG  + +SF SC DP  AA+AAAVMAA AAPNFAPPAAFIAPAILA AAIPPTS A KATVGFT++
Subjt:  HFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAACGATCTTCCCTACCAAAATTACAAAGAGGGGTTCATTTTGGAGAGTGTTTAGAATCATCCTTCTGGTCTTGTTTTGATCCTGCCAAAGCTGCAGTTGCTGCTGC
TGTCATGGCAGCTGTGGCTGCACCTAACTTTGCACCACCAGCAGCTTTCATTGCACCAGCAATTTTAGCAAACGCTGCAATTCCTCCAACAAGTACAGCTCGCAAGGCAA
CAGTTGGTTTTACTGCCATGTTTTTGGTTTTGGGTTTATCTGCAGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAACGATCTTCCCTACCAAAATTACAAAGAGGGGTTCATTTTGGAGAGTGTTTAGAATCATCCTTCTGGTCTTGTTTTGATCCTGCCAAAGCTGCAGTTGCTGCTGC
TGTCATGGCAGCTGTGGCTGCACCTAACTTTGCACCACCAGCAGCTTTCATTGCACCAGCAATTTTAGCAAACGCTGCAATTCCTCCAACAAGTACAGCTCGCAAGGCAA
CAGTTGGTTTTACTGCCATGTTTTTGGTTTTGGGTTTATCTGCAGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MERSSLPKLQRGVHFGECLESSFWSCFDPAKAAVAAAVMAAVAAPNFAPPAAFIAPAILANAAIPPTSTARKATVGFTAMFLVLGLSAV