; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G002730 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G002730
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationchr03:3348935..3349636
RNA-Seq ExpressionLsi03G002730
SyntenyLsi03G002730
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]1.1e-9788.99Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]2.1e-9989.13Show/hide
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]9.6e-9788.31Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]2.7e-7574.46Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]1.3e-9889.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein1.0e-9989.13Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein4.7e-9788.31Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein4.7e-9788.31Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein1.3e-7574.46Show/hide
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        PR  PR+SR +  SFS    S+S SSS +SWSSSRSSSSSSP    +  FFKRRR  SD+PSLPFEYSFDD DGDE G     NSPTSTLCFGG++SSRA
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        S F GCYQLVSVKNA LS+VGHGSA RGT+N
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A0A6J1FGK5 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like2.7e-6880.69Show/hide
Query:  KEANSSINSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSETSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSKATLLSSIFPRFTPRKSRTTSPSFSSFSGSSSSSSSL
        KEANS+ NSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHT+S+TSIPPLTPPPSYYSSSHSTSK S K T  +SIF     RKSRT S SF SFS SSSSSSS 
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Query:  ASWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCFGGSTSS-RASLFGGCYQLVSVKNALLSIVGHGSATR
        ASWSSSR    SSPSAFVRPKFFK RR FS+SPSLPFE SFDDN+GDE  VGS P+SPTSTLCFGG +SS RASLF GCY+LVSVKNALLSIVGHGSA+R
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Query:  GT
        GT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein2.9e-0635.76Show/hide
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        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ S+ + P   PLTPPPSY+ +S S++K               +P+K+ T   S  S + S  SS +
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Query:  LASWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCF
            SSS SSSSS PS+ +R      RRR     S+ FE       G  +  GS  NS  S+ C+
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AT2G40475.1 unknown protein3.6e-1741.41Show/hide
Query:  NSSINSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHT-FSET-SIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSKATLLSSIFPRFTPRKSRTTSPSFSSFSGSSSSSSSLA
        +S +NSS R+YY G   ++PF WE+RPGTPKH  FSE+  +PPLTPPPSYYSSS S+    SKA  +       T      + PSFS  S SSSSSSS  
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Query:  SWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCFGGSTSSRASLFGGCYQLVSVKNALLSIVGHGSATR
                SSSSP + V     + R+ +S S S    Y  +D++ + V      +SPTSTLC+    SS          + S+K AL S++ HGS+ +
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AT3G56260.2 unknown protein7.3e-1040.62Show/hide
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        E + +I+     YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  S++S+P PLTPPPSYYSS   ST +  SK     S F  F+       S    S  GS  ++S
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Query:  SLASWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCFGGSTSSRASLFGGCYQLVSVKNALLS
        S  SWSS+ SSSS S S    P   K  +R S     P  Y+  + D          +SPTSTLC      S     G    + SV  AL S
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AT5G01790.1 unknown protein5.1e-1144.33Show/hide
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        PN       S    K +   F+  L  +K+  SS+++   SFR+ YY GA GA+PF WES PGTPKH  SE  ++PPLTPPPS++S S    +  SK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAACTACTCCAAACTATGACCAAATTTCTCAAAAATCTTTCCAAACTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCACTAGAGCTCTATCTAAAGAGGCTAATTCC
TCCATCAACTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGTGCTACCGGTGCGATTCCGTTCCGATGGGAGTCTCGACCCGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGAAACT
TCAATCCCTCCTCTTACTCCTCCTCCTTCTTACTATTCCTCTTCACATTCTACTTCAAAGGCTTCTTCCAAAGCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGGTTC
ACGCCGAGGAAATCTCGAACAACTTCCCCATCTTTTTCTTCCTTCTCTGGCTCCTCCTCCTCGTCATCTTCCTTAGCATCCTGGTCATCCTCTCGCTCATCGTCC
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GGGGACGAGGTGGGGGTTGGGAGTCGTCCCAATTCTCCTACATCAACTTTGTGCTTTGGTGGTTCTACTTCAAGTAGAGCTTCATTGTTTGGTGGTTGTTATCAG
TTAGTGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCCATTGTTGGCCATGGATCTGCAACCAGAGGTACTCTTAATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAACTACTCCAAACTATGACCAAATTTCTCAAAAATCTTTCCAAACTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCACTAGAGCTCTATCTAAAGAGGCTAATTCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQTTPNYDQISQKSFQTTKHEDRFFTRALSKEANSSINSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSETSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSKATLLSSIFPRF
TPRKSRTTSPSFSSFSGSSSSSSSLASWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCFGGSTSSRASLFGGCYQ
LVSVKNALLSIVGHGSATRGTLN