; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G003460 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G003460
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionras-related protein Rab2BV-like
Genome locationchr03:4125825..4127658
RNA-Seq ExpressionLsi03G003460
SyntenyLsi03G003460
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022134462.1 ras-related protein Rab2BV-like [Momordica charantia]1.3e-10896.3Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VANLSGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_022938534.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita moschata]2.2e-10895.83Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_022962630.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita moschata]8.3e-10894.91Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKR+CCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_022993834.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita maxima]3.7e-10895.37Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_038884346.1 ras-related protein Rab2BV-like [Benincasa hispida]1.3e-10896.3Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA+TPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VANLSGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C222 ras-related protein Rab2BV-like6.2e-10996.3Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VANLSGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1FEC9 ras-related protein Rab2BV-like1.1e-10895.83Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1HFM9 ras-related protein Rab2BV-like4.0e-10894.91Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKR+CCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1JTM8 ras-related protein Rab2BV-like4.0e-10894.91Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKR+CCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1K193 ras-related protein Rab2BV-like1.8e-10895.37Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39434 Ras-related protein Rab2BV1.9e-9486.11Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA +VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST-PGLPHGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DL HLRAVS ED Q LAEKEGLSFLETSALEA+N+EKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEA+S  PG   GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST-PGLPHGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        NVA+ S N  +RSCCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

Q40193 Ras-related protein Rab11C4.2e-9483.8Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLRAVS +D   L+EKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL +IYHI+SKKALAAQEA +   +P  GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        NVA+ SGN  K+ CCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

Q40523 Ras-related protein Rab11A6.7e-9282.87Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA +VDHEYDYLFK+VLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL YDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI
        DNVQRWLRELRDH DSNIVI++AGNK+DL HLRAVS +D Q L +KEGLSFLETSALEALNV+KAFQTIL DIYHIISKKALAAQEAA++  LP  GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        NV++ S N  KR CCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

Q96283 Ras-related protein RABA2c2.8e-9082.27Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        M ++VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT Q       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED Q LAEKEGLSFLETSALEA NVEKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN
        TTINV + SG   KR+CCS+
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN

Q9FIF9 Ras-related protein RABA2d2.8e-9081.74Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLR+V+ ED Q LAE EGLSFLETSALEA NVEKAFQT+L +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCS
        TTINV + SG   KR CCS
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B4.4e-9181.48Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA ++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI
        +NV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED + LAEKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA + PG   GT I
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        N+++ S   N++ CCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C4.0e-8472.69Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA + D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLRAV+ EDAQ  AEKEGLSF+ETSALEALNVEKAFQTIL ++Y IISKK++++ +  +   +  G TI+
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VA  S +  K+ CCS+
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C2.0e-9182.27Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        M ++VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT Q       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED Q LAEKEGLSFLETSALEA NVEKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN
        TTINV + SG   KR+CCS+
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D2.0e-9181.74Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ       AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ-------AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLR+V+ ED Q LAE EGLSFLETSALEA NVEKAFQT+L +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCS
        TTINV + SG   KR CCS
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F1.7e-7466.36Show/hide
Query:  AYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTL-------QAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFD
        AY+ D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEF LESKSTIGVEFATR++       +AQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+T+  TF+
Subjt:  AYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTL-------QAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFD

Query:  NVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINV
        NV+RWL+ELRDH D+NIVIM  GNKADL HLRAVS EDA+  AE+E   F+ETSALE++NVE AF  +L  IY ++S+KAL   +      LP G TINV
Subjt:  NVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINV

Query:  ANLS--GNYNKRSCCSN
         +        K  CCSN
Subjt:  ANLS--GNYNKRSCCSN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTACAAGGTGGATCATGAATACGATTATCTCTTCAAGATTGTCTTGATCGGTGATTCTGGCGTTGGAAAGTCCAATATTCTCTCCAGGTTTACGCGGAACGAGTT
CTGTTTGGAATCAAAGTCCACCATTGGGGTTGAATTCGCTACGCGGACTTTGCAGGCTCAAATATGGGACACGGCAGGGCAAGAGAGATACCGAGCCATAACAAGTGCTT
ATTACAGGGGAGCAGTGGGAGCACTTTTGGTATATGATATAACCAAGAGACAAACCTTTGACAATGTCCAAAGATGGCTACGCGAACTGAGAGACCATGCTGATTCAAAT
ATCGTGATCATGATGGCCGGAAACAAGGCGGATCTGAACCATCTCCGGGCGGTTTCCGCCGAAGATGCTCAGCTTTTGGCAGAGAAAGAAGGGCTGTCATTTCTCGAGAC
CTCAGCTTTGGAGGCTTTGAATGTTGAGAAAGCTTTTCAGACCATTTTGCTTGACATTTATCATATCATTAGCAAGAAAGCTTTGGCAGCTCAGGAAGCTGCTTCCACCC
CCGGCCTCCCTCACGGCACCACCATCAACGTCGCTAATCTCTCAGGCAATTACAACAAGAGAAGTTGTTGCTCTAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTATTTAAAAAAGTTTTATGAATTTATAGCTATTCTGAATTCTGTGCCACATGAAGGGCCGCCTTCAGTGCCTTTCCCTCCGTTATTCCGTTTTCGTTTCATTGGTTCT
GTAAAATCCCTCATTTTCTTCTTTCCCCTTTTCCTTAAAACTCGCTAATAAAATTTCCAAGAAATTTCAAAAAATTCCTAATCCAATTACCACTCTCCCTTCCCAATCCA
TTCACCATTTTTCTTTATGGTGTTAGGCTCGGAATTTGATTAGGAATTTGATCAAATGGCTTACAAGGTGGATCATGAATACGATTATCTCTTCAAGATTGTCTTGATCG
GTGATTCTGGCGTTGGAAAGTCCAATATTCTCTCCAGGTTTACGCGGAACGAGTTCTGTTTGGAATCAAAGTCCACCATTGGGGTTGAATTCGCTACGCGGACTTTGCAG
GCTCAAATATGGGACACGGCAGGGCAAGAGAGATACCGAGCCATAACAAGTGCTTATTACAGGGGAGCAGTGGGAGCACTTTTGGTATATGATATAACCAAGAGACAAAC
CTTTGACAATGTCCAAAGATGGCTACGCGAACTGAGAGACCATGCTGATTCAAATATCGTGATCATGATGGCCGGAAACAAGGCGGATCTGAACCATCTCCGGGCGGTTT
CCGCCGAAGATGCTCAGCTTTTGGCAGAGAAAGAAGGGCTGTCATTTCTCGAGACCTCAGCTTTGGAGGCTTTGAATGTTGAGAAAGCTTTTCAGACCATTTTGCTTGAC
ATTTATCATATCATTAGCAAGAAAGCTTTGGCAGCTCAGGAAGCTGCTTCCACCCCCGGCCTCCCTCACGGCACCACCATCAACGTCGCTAATCTCTCAGGCAATTACAA
CAAGAGAAGTTGTTGCTCTAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFDNVQRWLRELRDHADSN
IVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINVANLSGNYNKRSCCSN