; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G003600 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G003600
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationchr03:4254165..4256704
RNA-Seq ExpressionLsi03G003600
SyntenyLsi03G003600
Gene Ontology termsGO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133545.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]1.0e-10090.45Show/hide
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XP_022955559.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita moschata]2.5e-9989.09Show/hide
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XP_023552471.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-9989.55Show/hide
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XP_038883977.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Benincasa hispida]5.6e-9984.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA71 Uncharacterized protein3.9e-9889.09Show/hide
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A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X15.0e-10190.45Show/hide
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A0A6J1GU31 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X13.6e-9988.64Show/hide
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A0A6J1GWM1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X21.2e-9989.09Show/hide
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A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X28.8e-9888.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr324.2e-1243.75Show/hide
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        L G+DFSGK+L    F  + L  +NF  A L GA F  + L G  ADL  ADL  G  +  S   A+L+NA L  A+    T F  + I GADF+   L 
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          + + LC  ADGVNP TG +TRE+L C
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O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic5.5e-7368.58Show/hide
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        L N SL  CC+ S+   +P +  P S S+H   +    Q          R++V S+GE  SK +  A +SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSG
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        R YLCKVADGVN TTGNATR+TLLC+
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P73709 Uncharacterized protein slr18191.7e-0537.39Show/hide
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        G DL G D SG TL         ++Q+ K        +IL +A+ +GA + G     ADL+   A+L +A+LR  D  L  A+LS ANL+GAL T + + 
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Query:  RGSTINGADFTDVPL
         G+ +NGAD  +  L
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Q8H1Q1 Thylakoid lumenal protein TL20.3, chloroplastic2.1e-0830.35Show/hide
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        N +++ + N       SA   T+   LSA+  +A   +A   G P  A +      TRG+            DLS    S +   + +F ++ +R+++F 
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Query:  GAKLLGASFFDADLTGLRADLSDADLRGA---DFSLANANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLL
        G+   GA    A     +A+ S ADL         L  ANL+NA L  ++ T  +   G+ I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L 
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Query:  C
        C
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Q9SE95 FH protein interacting protein FIP25.8e-0638.94Show/hide
Query:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGLR---ADLSDADLRGADFSLANANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTINGA
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADL  A L+ AD  L NANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A
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            V LRE   E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.1 Pentapeptide repeat-containing protein1.5e-0930.35Show/hide
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        N +++ + N       SA   T+   LSA+  +A   +A   G P  A +      TRG+            DLS    S +   + +F ++ +R+++F 
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Query:  GAKLLGASFFDADLTGLRADLSDADLRGA---DFSLANANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLL
        G+   GA    A     +A+ S ADL         L  ANL+NA L  ++ T  +   G+ I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L 
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Query:  C
        C
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AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein1.5e-0933.57Show/hide
Query:  GPYGAGVTR---GQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGLRADLSDADLRGA---DFSLANANLSNANLEGALATGNTSFR
        G +G G        DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A     +A+ S ADL         L  ANL+NA L  ++ T  +   
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        G+ I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.3e-5365.08Show/hide
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        L N SL  CC+ S+   +P +  P S S+H   +    Q          R++V S+GE  SK +  A +SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSG
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Query:  KDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGLRADLSDADLRGADFSLAN---ANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGA
        KDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG  ADLS+ADLRGADFSLAN    NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA
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AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein3.9e-7468.58Show/hide
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        L N SL  CC+ S+   +P +  P S S+H   +    Q          R++V S+GE  SK +  A +SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSG
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Query:  KDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGLRADLSDADLRGADFSLAN---ANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQ
        KDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG  ADLS+ADLRGADFSLAN    NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQ
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        R YLCKVADGVN TTGNATR+TLLC+
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AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein4.1e-0738.94Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADL  A L+ AD  L NANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A
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Query:  DFTDVPLREDQRE
            V LRE   E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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