; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G003980 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G003980
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationchr03:4564822..4567175
RNA-Seq ExpressionLsi03G003980
SyntenyLsi03G003980
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056568.1 zinc finger protein 511 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-12688.06Show/hide
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KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-12591.16Show/hide
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XP_008441334.1 PREDICTED: zinc finger protein 511 [Cucumis melo]5.4e-13094.78Show/hide
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XP_038885473.1 zinc finger protein 511 [Benincasa hispida]2.3e-12893.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein8.4e-12994.38Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5112.6e-13094.78Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5117.9e-12788.06Show/hide
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A0A6J1BVX1 zinc finger protein 5116.3e-12489.96Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5111.3e-12490.76Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5113.3e-2133.76Show/hide
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        +H+ E HD+ FQ  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R+ H+V  H + A F F K
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5111.1e-2431.78Show/hide
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        E ++  P+ ++P + RF  +  +F  G++ R +  + +     +D++           SE  C I GC     +L+ +E HYN+ H   CS C R +P++
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        RLL +H+ E HD+ FQ  +A    MYECLVEGCGLKFK+ K R+ HL+  H + A F F K     +   +K  +K+       A   ++E+SE     +
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          E    + + +   K   S   PS+I FG+   RG
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Q8NB15 Zinc finger protein 5111.9e-2133.02Show/hide
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        RF  +  FF  G+V+R +  + V + + +  EK ++   A        C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R +P+  LL  H+ E HD+ 
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Query:  FQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRQQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQAVQG-REETSEMEVEKETIDGLISGVSKLST-SDSTP
        FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R+ H+V  H + A F F K   P K +           G R E   ME+  E +    +   +        P
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Query:  STISFGRRHTRG
        STI FG+   RG
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Q9V574 Protein lethal(2)k102011.1e-1129.45Show/hide
Query:  DHYNSRHTASCSVCPRVYPTSRLLSLHVSEAHDAFFQAKVARG-YDMYECLVEGCGLKFKSYKSRQQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQA
        D+ +   + SC  C ++ PT+ LL LH++E HD +F A V RG   M+ C +E C +KF + + R+ H +  HK  A++ F            K   KQ 
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Query:  VQGREETSEMEVEKETIDGL--ISGVSKLSTSDSTPSTISFGRRHTRGLTFVPRSVQREKVSD
         QG+ + + MEV+ E I+    +  V   S    T  +   G+    G T       +E ++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding1.2e-9065.88Show/hide
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        M V++  E  FPYW P +RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH      +  I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RV
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Query:  YPTSRLLSLHVSEAHDAFFQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRQQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQAVQGREE-------TSEME
        YPTSRLLS+H+SEAHD+FFQAKV+RGYDMYECLVEGCGLKFK+YK+R +HL+DKHKF  +FEFFKK   SKK+R+KL R+   + + E       +  ME
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Query:  VE-KETIDGLISGVSKLSTSDSTPSTISFGRRHTRGLTFVPRSVQREKVSDSSTA
        VE K ++DGL+S +S L+TSD+TPS +SFGRRH RGLTFVPRSV REK ++SS+A
Subjt:  VE-KETIDGLISGVSKLSTSDSTPSTISFGRRHTRGLTFVPRSVQREKVSDSSTA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTGAATCACAATCAGAGTTCCCGTACTGGAAGCCTTTCCAACGGAGGTTCGATCCCGATTCTCCGTTCTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGGGAAATCTTAGC
CAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTAGCAGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACT
TGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCACGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAGAGTTTACCCGACATCACGCTTACTTAGTTTACATGTGTCT
GAGGCGCATGACGCGTTCTTTCAAGCAAAAGTTGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTACAAAAGCAGACAGCA
GCATCTAGTGGATAAGCATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAGAAACAAAGACAGAAATTACATCGTAAACAAGCCGTTCAAGGAA
GGGAAGAAACCTCCGAAATGGAAGTTGAGAAGGAAACTATAGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACTTCAGACTCAACTCCTTCGACAATCAGCTTTGGC
CGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGATCAGTTCAGCGAGAAAAAGTGTCAGACTCCTCAACAGCTGGAACGAAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAATTTTAAAAGTAGAAAATTTCGGGTCGGAGCTTCTGCTGGGTGGATCTAAACGGGAAGCCACGGGGTCGAGCCCCGATCAGGCGGTTTCGTCGATTCGTTGAAGGTT
GATTAGAGTCCCTTTGGCCTTCAGCCGTTCAAAGTTCAAACCAAAATTGAAAAAAAAAAAATCTTTCGTCTGCAACGGTCCATTTCCCTGCCATGGAAGTTGAATCACAA
TCAGAGTTCCCGTACTGGAAGCCTTTCCAACGGAGGTTCGATCCCGATTCTCCGTTCTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGGGAAATCTTAGCCAAACAGGTTGCCTTGGA
TTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTAGCAGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACTTGAAATCTCTGGATGACT
TTGAAGATCATTACAATTCACGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAGAGTTTACCCGACATCACGCTTACTTAGTTTACATGTGTCTGAGGCGCATGACGCGTTC
TTTCAAGCAAAAGTTGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTACAAAAGCAGACAGCAGCATCTAGTGGATAAGCA
TAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAGAAACAAAGACAGAAATTACATCGTAAACAAGCCGTTCAAGGAAGGGAAGAAACCTCCGAAA
TGGAAGTTGAGAAGGAAACTATAGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACTTCAGACTCAACTCCTTCGACAATCAGCTTTGGCCGGAGGCACACTCGAGGG
TTAACATTTGTTCCTCGATCAGTTCAGCGAGAAAAAGTGTCAGACTCCTCAACAGCTGGAACGAAGAGATGAAAGTAGTGTATGTAGACCAAGTATGTCTGTCGTTTCTA
GCATATCTGATTCCAACTTTTGCTGCATTACTGCATAGTTTTCATTGTTGGCCCTTCTCAAGGATATCTGGTTTTGCGGCATTTCAGAGTTGGATTTTTCTTTTTCTTTT
CTTTTTTTTAATTTTCCATTTAATATTTGATCATTGACCTCATCGATGGTTGATTAATAGTCATTTTGTAGTTGGGATGTAACTTGAGATCATATGGGAAATGATAGGAA
GATATTGAGTTTCAAGATGGCAGAACTCAAGATAACGATGTATCTAGATGGATTAGGGAGGATTAGTTGCTTTGTTATGTACTTCCAATAGACTGAACAATGAAGAAAAT
ATTGGTACTATAAATGTTGGCTCTTAAAAGAGCTTGTGGAGACATAATGAGGAAGGTGTTTAGCTTATCAATTCAATTGAGATATAGAATACCAAGAAATAGAACTTCAT
TAAGTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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