| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6571679.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.1e-129 | 81.55 | Show/hide |
Query: FQGPFSSIFSNPNPSLHLPTNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
FQGPF S+ SNPNP+LH PTNMSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Subjt: FQGPFSSIFSNPNPSLHLPTNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Query: TPATLFFSHCLILLLSSPSASTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGR
VVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGK+SE+FPKSRYRSRSRSPRRRHRDD++DRDYRRRSRSRSRSRSLD+ D DRRGR
Subjt: TPATLFFSHCLILLLSSPSASTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGR
Query: ERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRS----------RGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPE
ERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERRSRSRSRSRS RGR RSVDS SPGR+SPSP RS SP+RSPSPRGESPE
Subjt: ERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRS----------RGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPE
Query: RNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
RNG+GG RSPTSRSVSPRGQPADSRSPS NSDVDK
Subjt: RNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 3.8e-131 | 89.74 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
T+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDY+D+DYRRRSRSRSRSRSLDK+DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
PDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGNG RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQN
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
Query: SD
SD
Subjt: SD
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 7.7e-132 | 90.07 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
T+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRRRSRSRSRSRSLD+SDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
PDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGNGG RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQN
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
Query: SD
SD
Subjt: SD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 1.9e-122 | 83.6 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
TVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRR RSRSRSRSLD+SDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRG
PDYSKGRGRGRY DERR+RSRS SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPRGESPERNG+GG RSPT RSVSPRG
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRG
Query: QPADSRSPSPQNSDVDK
QPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: QPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 5.0e-131 | 88.27 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
T+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRR+RDDY+DRDYRRRSRSRSRSRS D+SDRDRRGRE+ERER+YRRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDER--RSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSP
PDYSKGRGRGRYDDER RSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR+SPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRG SPERNGNGG RSPTSRSVSPRG+P DSRSPSP
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDER--RSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSP
Query: QNSDVDK
QNSDVDK
Subjt: QNSDVDK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 1.8e-131 | 89.74 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
T+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDY+D+DYRRRSRSRSRSRSLDK+DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
PDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGNG RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQN
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
Query: SD
SD
Subjt: SD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 3.7e-132 | 90.07 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
T+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRRRSRSRSRSRSLD+SDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
PDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGNGG RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQN
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQN
Query: SD
SD
Subjt: SD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 7.8e-122 | 85.34 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD +DRDYRRRSRSRSRSRSLD+SDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSR--SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSP
PDYSKGRGRGRYDDERRSRSR SRS+SRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPRGESP RNG+GG R+PT RSVSPRGQPADSRSPSP
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSR--SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSP
Query: QNSDVDK
QNSDVDK
Subjt: QNSDVDK
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 9.2e-123 | 83.6 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
TVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRR RSRSRSRSLD+SDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRG
PDYSKGRGRGRY DERR+RSRS SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPRGESPERNG+GG RSPT RSVSPRG
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRG
Query: QPADSRSPSPQNSDVDK
QPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: QPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 5.6e-120 | 81.11 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
TVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+Y+DRDYRR RSRSRSRSLD+SDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSR
PDYSKGRGRGRY DERR+RSRS SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPRGESPERNG+GG RSPT R
Subjt: PDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSR
Query: SVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SVSPRGQ ADSRSPSPQNSDV+K
Subjt: SVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.2e-24 | 42.32 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
Query: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
DGRE+ VQ A+YG P++ +G + S Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS +S R R R + R R R RSRS
Subjt: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Query: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.7e-23 | 41.95 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
Query: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
DGRE+ VQ A+YG P++ +G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS +S R R R + R R R RSRS
Subjt: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Query: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.7e-23 | 41.95 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
Query: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
DGRE+ VQ A+YG P++ +G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS +S R R R + R R R RSRS
Subjt: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Query: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.7e-23 | 41.95 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVV
Query: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
DGRE+ VQ A+YG P++ +G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS +S R R R + R R R RSRS
Subjt: DGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSP
Query: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: DYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.7e-65 | 57.74 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRR
VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDY+++DYR+RSRSRS DRR
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRR
Query: GRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPR
R E++RD+RRR+RS R SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR + SP
Subjt: GRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPR
Query: GE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
E SPER N RSP+ S +P R A SRS SP
Subjt: GE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 7.2e-11 | 37.67 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVVDGREITVQFAKYG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG LLL GRE+TV FA+
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVVDGREITVQFAKYG
Query: PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRG
R + R R R + RD RRR+ R SRS +S RRGR R R DY R RSISPR D + R
Subjt: PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRG
Query: RYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
D SR RS + RG+SRS+ S SP R RSP RSPSP+ RS+SPRRS S SP R+ RSP S +PA SRS SP D+
Subjt: RYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 7.2e-11 | 36.22 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVVD
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG LLL
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSASTVVD
Query: GREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR
GRE+TV FA+ N ++ + + E SR+R R R+P R + SRSR S RRGR R R DY R RSISPR
Subjt: GREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADS
D + R D SR RS + RG+SRS+ S SP R RSP RSPSP+ RS+SPRRS S SP R+ RSP S +PA S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADS
Query: RSPSPQNSDVDK
RS SP D+
Subjt: RSPSPQNSDVDK
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 3.0e-09 | 34.53 | Show/hide |
Query: PTNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSP
P+ FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG LLL
Subjt: PTNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSP
Query: SASTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISP
GRE+TV FA+ N ++ + + + +S R++ R RSP R R RR RSRSRSR + R +SRS+SP
Subjt: SASTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISP
Query: RRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRS-VDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQP
+ D R + RS SRS + S V SGSPGR S SPRRS SPR RS +P ++ R +SP + RSPT PRG
Subjt: RRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRS-VDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQP
Query: ADSRSPS
RSPS
Subjt: ADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.2e-66 | 57.74 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRR
VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDY+++DYR+RSRSRS DRR
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRR
Query: GRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPR
R E++RD+RRR+RS R SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR + SP
Subjt: GRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPR
Query: GE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
E SPER N RSP+ S +P R A SRS SP
Subjt: GE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.2e-66 | 57.74 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTPATLFFSHCLILLLSSPSAS
Query: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRR
VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDY+++DYR+RSRSRS DRR
Subjt: TVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRR
Query: GRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPR
R E++RD+RRR+RS R SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR + SP
Subjt: GRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPR
Query: GE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
E SPER N RSP+ S +P R A SRS SP
Subjt: GE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
|
|
